70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_30690 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013172  Bfae_30690  hypothetical protein  100 
 
 
472 aa  919    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.970372  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02270  hypothetical protein  54.68 
 
 
458 aa  457  1e-127  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0205338  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22520  hypothetical protein  57.45 
 
 
450 aa  443  1e-123  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2860  hypothetical protein  50.11 
 
 
442 aa  428  1e-119  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.88357  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3113  hypothetical protein  49.66 
 
 
442 aa  429  1e-119  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2888  nucleoside recognition domain-containing protein  50.34 
 
 
442 aa  428  1e-118  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.118792  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2161  nucleoside recognition domain protein  51.65 
 
 
460 aa  427  1e-118  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2893  hypothetical protein  49.66 
 
 
442 aa  427  1e-118  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0838984  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2821  hypothetical protein  49.89 
 
 
442 aa  427  1e-118  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3110  hypothetical protein  49.66 
 
 
442 aa  427  1e-118  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.63107  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1284  nucleoside recognition domain protein  51.17 
 
 
442 aa  425  1e-118  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000041831  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3132  hypothetical protein  49.89 
 
 
442 aa  426  1e-118  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0941872  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2138  nucleoside recognition domain protein  49.44 
 
 
442 aa  423  1e-117  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3099  hypothetical protein  49.21 
 
 
442 aa  423  1e-117  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3131  hypothetical protein  49.66 
 
 
442 aa  422  1e-116  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2070  nucleoside recognition domain-containing protein  48.94 
 
 
442 aa  412  1e-114  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.329625  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0309  nucleoside recognition domain-containing protein  47.54 
 
 
437 aa  404  1e-111  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0302  nucleoside recognition domain-containing protein  47.54 
 
 
437 aa  404  1e-111  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1931  nucleoside recognition  49.53 
 
 
460 aa  392  1e-108  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1432  nucleoside recognition domain-containing protein  51.31 
 
 
465 aa  382  1e-105  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.627663  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2465  nucleoside recognition domain-containing protein  48.35 
 
 
463 aa  376  1e-103  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2587  nucleoside recognition domain-containing protein  50.96 
 
 
441 aa  368  1e-100  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.577285  normal  0.214795 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0851  nucleoside recognition domain-containing protein  44.03 
 
 
463 aa  364  2e-99  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.0177534 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1950  nucleoside recognition domain-containing protein  47.04 
 
 
435 aa  360  3e-98  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.113243  normal  0.0269854 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4071  nucleoside recognition domain-containing protein  48.58 
 
 
441 aa  357  1.9999999999999998e-97  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1490  nucleoside recognition domain-containing protein  43.06 
 
 
439 aa  345  1e-93  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.189522 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0047  nucleoside recognition domain protein  36.47 
 
 
450 aa  305  1.0000000000000001e-81  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.307144  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1774  hypothetical protein  31.25 
 
 
457 aa  213  5.999999999999999e-54  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.32184  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2205  nucleoside recognition domain-containing protein  30.58 
 
 
456 aa  203  5e-51  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0260611  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2243  nucleoside recognition domain-containing protein  30.58 
 
 
456 aa  203  5e-51  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0211126  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1392  nucleoside recognition domain-containing protein  29.84 
 
 
463 aa  189  8e-47  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28070  hypothetical protein  35.59 
 
 
455 aa  185  1.0000000000000001e-45  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.816379  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1037  nucleoside recognition  34.88 
 
 
452 aa  183  5.0000000000000004e-45  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1548  nucleoside recognition  33.18 
 
 
468 aa  183  6e-45  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.834674  normal  0.566263 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1796  nucleoside recognition domain-containing protein  34.31 
 
 
464 aa  176  9e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.440369  normal  0.948878 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2588  nucleoside recognition domain-containing protein  29.53 
 
 
449 aa  175  1.9999999999999998e-42  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000000362431  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1012  nucleoside recognition domain-containing protein  29.38 
 
 
450 aa  174  3.9999999999999995e-42  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3199  nucleoside recognition domain-containing protein  33.9 
 
 
452 aa  172  9e-42  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3343  nucleoside recognition domain-containing protein  33.9 
 
 
452 aa  172  9e-42  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3205  nucleoside recognition domain-containing protein  33.9 
 
 
452 aa  172  1e-41  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1168  nucleoside recognition domain protein  33.9 
 
 
452 aa  172  1e-41  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3353  nucleoside recognition domain-containing protein  33.22 
 
 
461 aa  172  1e-41  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.854  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3520  nucleoside recognition domain-containing protein  34.12 
 
 
451 aa  172  2e-41  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2808  nucleoside recognition domain-containing protein  33.45 
 
 
443 aa  171  3e-41  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0994  hypothetical protein  36.18 
 
 
452 aa  171  3e-41  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1058  nucleoside recognition domain-containing protein  30.25 
 
 
452 aa  171  3e-41  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000157465  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1129  nucleoside recognition domain-containing protein  32.65 
 
 
452 aa  170  4e-41  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00523822  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1794  hypothetical protein  31.61 
 
 
451 aa  171  4e-41  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00298391  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2790  nucleoside recognition domain-containing protein  34.12 
 
 
451 aa  171  4e-41  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.727752  normal  0.835537 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1062  nucleoside recognition domain-containing protein  32.53 
 
 
452 aa  169  9e-41  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.283596  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2910  nucleoside recognition domain-containing protein  29.24 
 
 
449 aa  169  1e-40  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.000000209711  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1245  hypothetical protein  32.53 
 
 
452 aa  167  2.9999999999999998e-40  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3024  nucleoside recognition domain-containing protein  34.46 
 
 
451 aa  166  5.9999999999999996e-40  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.86222  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1793  nucleoside recognition  33.56 
 
 
479 aa  166  6.9999999999999995e-40  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.11571  normal  0.0825987 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2839  nucleoside recognition  30.16 
 
 
463 aa  166  8e-40  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0063  hypothetical protein  30.17 
 
 
458 aa  165  1.0000000000000001e-39  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000575905  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0592  membrane protein, putative nucleoside transporter  32.32 
 
 
455 aa  164  4.0000000000000004e-39  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.687346  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001424  predicted arginine uptake transporter  32.43 
 
 
438 aa  161  3e-38  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0157375  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06311  hypothetical protein  30.02 
 
 
454 aa  160  4e-38  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0768  nucleoside recognition domain protein  28.28 
 
 
447 aa  144  5e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00542215 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0764  hypothetical protein  25.64 
 
 
391 aa  49.3  0.0001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2080  nucleoside recognition domain-containing protein  32.05 
 
 
419 aa  49.7  0.0001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.40354  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1873  sporulation integral membrane protein YlbJ  31.17 
 
 
411 aa  48.9  0.0002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1001  sporulation integral membrane protein YlbJ  29.21 
 
 
406 aa  48.1  0.0003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0990759  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1172  sporulation integral membrane protein YlbJ  27.85 
 
 
430 aa  46.6  0.0009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0456795  normal  0.0749653 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3828  nucleoside recognition domain protein  32.18 
 
 
384 aa  46.2  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000315819  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0635  nucleoside recognition domain-containing protein  29.11 
 
 
393 aa  46.6  0.001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.00000000395373  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1350  sporulation integral membrane protein YlbJ  25.74 
 
 
416 aa  44.3  0.005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.430265  normal  0.106884 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10150  Sporulation integral membrane protein YlbJ  30.77 
 
 
406 aa  44.3  0.005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.206415  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1734  nucleoside recognition domain-containing protein  30.65 
 
 
393 aa  44.3  0.005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>