60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Csal_2839 on replicon NC_007963
Organism: Chromohalobacter salexigens DSM 3043



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007963  Csal_2839  nucleoside recognition  100 
 
 
463 aa  915    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1796  nucleoside recognition domain-containing protein  60.36 
 
 
464 aa  528  1e-148  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.440369  normal  0.948878 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1392  nucleoside recognition domain-containing protein  48.51 
 
 
463 aa  420  1e-116  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1012  nucleoside recognition domain-containing protein  49.11 
 
 
450 aa  416  9.999999999999999e-116  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3024  nucleoside recognition domain-containing protein  48.75 
 
 
451 aa  412  1e-114  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.86222  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3520  nucleoside recognition domain-containing protein  49.89 
 
 
451 aa  413  1e-114  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3353  nucleoside recognition domain-containing protein  49.21 
 
 
461 aa  407  1.0000000000000001e-112  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.854  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2790  nucleoside recognition domain-containing protein  48.52 
 
 
451 aa  404  1e-111  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.727752  normal  0.835537 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0994  hypothetical protein  49.21 
 
 
452 aa  402  1e-111  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1037  nucleoside recognition  48.21 
 
 
452 aa  396  1e-109  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1168  nucleoside recognition domain protein  46.99 
 
 
452 aa  397  1e-109  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3199  nucleoside recognition domain-containing protein  46.99 
 
 
452 aa  396  1e-109  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3205  nucleoside recognition domain-containing protein  46.99 
 
 
452 aa  397  1e-109  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3343  nucleoside recognition domain-containing protein  46.99 
 
 
452 aa  396  1e-109  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2588  nucleoside recognition domain-containing protein  45.86 
 
 
449 aa  392  1e-108  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000000362431  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1062  nucleoside recognition domain-containing protein  47.39 
 
 
452 aa  392  1e-108  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.283596  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2808  nucleoside recognition domain-containing protein  46.97 
 
 
443 aa  390  1e-107  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1129  nucleoside recognition domain-containing protein  47.17 
 
 
452 aa  390  1e-107  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00523822  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1058  nucleoside recognition domain-containing protein  47.39 
 
 
452 aa  391  1e-107  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000157465  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2910  nucleoside recognition domain-containing protein  45.64 
 
 
449 aa  390  1e-107  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.000000209711  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1245  hypothetical protein  47.17 
 
 
452 aa  390  1e-107  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1548  nucleoside recognition  45.95 
 
 
468 aa  385  1e-106  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.834674  normal  0.566263 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0063  hypothetical protein  46.07 
 
 
458 aa  369  1e-101  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000575905  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06311  hypothetical protein  45.88 
 
 
454 aa  370  1e-101  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001424  predicted arginine uptake transporter  47.24 
 
 
438 aa  370  1e-101  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0157375  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0592  membrane protein, putative nucleoside transporter  45.9 
 
 
455 aa  365  1e-100  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.687346  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1793  nucleoside recognition  43.68 
 
 
479 aa  350  3e-95  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.11571  normal  0.0825987 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1774  hypothetical protein  40.62 
 
 
457 aa  346  4e-94  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.32184  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1794  hypothetical protein  38.03 
 
 
451 aa  332  1e-89  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00298391  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2205  nucleoside recognition domain-containing protein  42.25 
 
 
456 aa  326  5e-88  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0260611  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2243  nucleoside recognition domain-containing protein  42.25 
 
 
456 aa  326  5e-88  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0211126  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28070  hypothetical protein  40.13 
 
 
455 aa  298  1e-79  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.816379  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2893  hypothetical protein  32.74 
 
 
442 aa  227  3e-58  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0838984  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3110  hypothetical protein  32.74 
 
 
442 aa  227  3e-58  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.63107  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3113  hypothetical protein  32.74 
 
 
442 aa  226  8e-58  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2821  hypothetical protein  32.66 
 
 
442 aa  224  3e-57  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2138  nucleoside recognition domain protein  31.82 
 
 
442 aa  223  4.9999999999999996e-57  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2888  nucleoside recognition domain-containing protein  32.44 
 
 
442 aa  223  4.9999999999999996e-57  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.118792  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3132  hypothetical protein  32.43 
 
 
442 aa  223  6e-57  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0941872  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3099  hypothetical protein  32.21 
 
 
442 aa  223  7e-57  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2860  hypothetical protein  33.56 
 
 
442 aa  221  1.9999999999999999e-56  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.88357  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3131  hypothetical protein  32.21 
 
 
442 aa  221  1.9999999999999999e-56  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2161  nucleoside recognition domain protein  30.52 
 
 
460 aa  209  1e-52  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2070  nucleoside recognition domain-containing protein  30 
 
 
442 aa  204  3e-51  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.329625  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1284  nucleoside recognition domain protein  32.03 
 
 
442 aa  201  1.9999999999999998e-50  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000041831  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22520  hypothetical protein  32.04 
 
 
450 aa  194  2e-48  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02270  hypothetical protein  28.67 
 
 
458 aa  191  2.9999999999999997e-47  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0205338  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0309  nucleoside recognition domain-containing protein  29.33 
 
 
437 aa  185  1.0000000000000001e-45  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0302  nucleoside recognition domain-containing protein  29.33 
 
 
437 aa  185  1.0000000000000001e-45  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1490  nucleoside recognition domain-containing protein  29.51 
 
 
439 aa  181  2e-44  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.189522 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30690  hypothetical protein  31.45 
 
 
472 aa  176  8e-43  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.970372  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1931  nucleoside recognition  29.61 
 
 
460 aa  172  1e-41  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0851  nucleoside recognition domain-containing protein  29.93 
 
 
463 aa  164  2.0000000000000002e-39  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.0177534 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2465  nucleoside recognition domain-containing protein  27.51 
 
 
463 aa  165  2.0000000000000002e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1950  nucleoside recognition domain-containing protein  31.4 
 
 
435 aa  161  2e-38  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.113243  normal  0.0269854 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0768  nucleoside recognition domain protein  28.6 
 
 
447 aa  160  4e-38  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00542215 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4071  nucleoside recognition domain-containing protein  31.47 
 
 
441 aa  155  1e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1432  nucleoside recognition domain-containing protein  28.86 
 
 
465 aa  147  6e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.627663  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0047  nucleoside recognition domain protein  27.83 
 
 
450 aa  145  2e-33  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.307144  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2587  nucleoside recognition domain-containing protein  28.87 
 
 
441 aa  135  1.9999999999999998e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.577285  normal  0.214795 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>