78 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_0764 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008346  Swol_0764  hypothetical protein  100 
 
 
391 aa  768    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2631  sporulation integral membrane protein YlbJ  44.31 
 
 
403 aa  254  2.0000000000000002e-66  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00000188887  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1274  nucleoside recognition  39.16 
 
 
435 aa  253  5.000000000000001e-66  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.174951  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3755  sporulation integral membrane protein YlbJ  42.34 
 
 
409 aa  247  2e-64  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4040  hypothetical protein  39.75 
 
 
409 aa  246  4e-64  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000595429  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3944  hypothetical protein  39.36 
 
 
409 aa  246  4e-64  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3975  hypothetical protein  40.62 
 
 
409 aa  246  6e-64  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.279779  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1350  sporulation integral membrane protein YlbJ  41.47 
 
 
416 aa  246  6.999999999999999e-64  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.430265  normal  0.106884 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3840  hypothetical protein  39.21 
 
 
409 aa  246  6.999999999999999e-64  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3670  hypothetical protein  39.21 
 
 
409 aa  246  6.999999999999999e-64  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.566119  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4138  hypothetical protein  39.21 
 
 
409 aa  246  6.999999999999999e-64  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3687  hypothetical protein  39 
 
 
409 aa  245  9.999999999999999e-64  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1209  hypothetical protein  41.42 
 
 
409 aa  243  3.9999999999999997e-63  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00106685  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1172  sporulation integral membrane protein YlbJ  41.57 
 
 
430 aa  243  6e-63  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0456795  normal  0.0749653 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4029  hypothetical protein  42.26 
 
 
409 aa  242  9e-63  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0426731  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1001  sporulation integral membrane protein YlbJ  41.05 
 
 
406 aa  242  1e-62  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0990759  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1734  nucleoside recognition domain-containing protein  34.81 
 
 
393 aa  234  3e-60  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10150  Sporulation integral membrane protein YlbJ  37.3 
 
 
406 aa  232  1e-59  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.206415  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2080  nucleoside recognition domain-containing protein  40.87 
 
 
419 aa  229  7e-59  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.40354  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1873  sporulation integral membrane protein YlbJ  40.78 
 
 
411 aa  226  4e-58  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0938  nucleoside recognition  41.05 
 
 
407 aa  225  1e-57  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000000955347  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1878  sporulation integral membrane protein YlbJ  37.54 
 
 
424 aa  219  8.999999999999998e-56  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.169606  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1659  sporulation integral membrane protein YlbJ  36.24 
 
 
429 aa  218  2e-55  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0635  nucleoside recognition domain-containing protein  38.56 
 
 
393 aa  209  6e-53  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.00000000395373  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3828  nucleoside recognition domain protein  36.94 
 
 
384 aa  192  1e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000315819  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1766  nucleoside recognition domain protein  36.39 
 
 
415 aa  191  2e-47  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.247694 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0113  nucleoside recognition domain protein  37.57 
 
 
369 aa  174  3.9999999999999995e-42  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000473689  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1229  nucleoside recognition domain protein  30.77 
 
 
325 aa  143  7e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1699  uncharacterized membrane protein  29.71 
 
 
386 aa  137  3.0000000000000003e-31  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.786998  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1981  sporulation integral membrane protein YlbJ  29.77 
 
 
386 aa  122  9.999999999999999e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1324  nucleoside recognition domain-containing protein  27.25 
 
 
362 aa  112  1.0000000000000001e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.244161  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22520  hypothetical protein  25.38 
 
 
450 aa  59.3  0.0000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3099  hypothetical protein  23.1 
 
 
442 aa  55.8  0.000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2860  hypothetical protein  23.1 
 
 
442 aa  55.1  0.000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.88357  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2138  nucleoside recognition domain protein  23.1 
 
 
442 aa  54.3  0.000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3131  hypothetical protein  22.44 
 
 
442 aa  53.9  0.000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4071  nucleoside recognition domain-containing protein  28.41 
 
 
441 aa  53.5  0.000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2821  hypothetical protein  22.11 
 
 
442 aa  53.1  0.000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2888  nucleoside recognition domain-containing protein  22.44 
 
 
442 aa  52.8  0.000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.118792  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3132  hypothetical protein  22.44 
 
 
442 aa  52.4  0.00001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0941872  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1012  nucleoside recognition domain-containing protein  24.74 
 
 
450 aa  51.6  0.00002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1774  hypothetical protein  28.19 
 
 
457 aa  51.6  0.00003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.32184  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0309  nucleoside recognition domain-containing protein  29.11 
 
 
437 aa  51.2  0.00003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0302  nucleoside recognition domain-containing protein  29.11 
 
 
437 aa  51.2  0.00003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3110  hypothetical protein  22.44 
 
 
442 aa  50.8  0.00004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.63107  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3113  hypothetical protein  22.44 
 
 
442 aa  50.8  0.00004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2893  hypothetical protein  22.44 
 
 
442 aa  50.8  0.00004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0838984  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1931  nucleoside recognition  22.13 
 
 
460 aa  50.4  0.00005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2465  nucleoside recognition domain-containing protein  24.17 
 
 
463 aa  49.7  0.00008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30690  hypothetical protein  25.64 
 
 
472 aa  49.3  0.0001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.970372  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0768  nucleoside recognition domain protein  34.62 
 
 
447 aa  47.4  0.0004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00542215 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1284  nucleoside recognition domain protein  28.05 
 
 
442 aa  47  0.0005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000041831  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2070  nucleoside recognition domain-containing protein  22.33 
 
 
442 aa  47.4  0.0005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.329625  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1392  nucleoside recognition domain-containing protein  27.62 
 
 
463 aa  46.6  0.0008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2161  nucleoside recognition domain protein  25.64 
 
 
460 aa  45.4  0.001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0851  nucleoside recognition domain-containing protein  21.58 
 
 
463 aa  45.8  0.001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.0177534 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1062  nucleoside recognition domain-containing protein  24.9 
 
 
452 aa  45.8  0.001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.283596  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3343  nucleoside recognition domain-containing protein  24.14 
 
 
452 aa  45.4  0.002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1168  nucleoside recognition domain protein  24.14 
 
 
452 aa  45.4  0.002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1432  nucleoside recognition domain-containing protein  24.68 
 
 
465 aa  45.1  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.627663  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3199  nucleoside recognition domain-containing protein  24.14 
 
 
452 aa  45.4  0.002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1037  nucleoside recognition  22.47 
 
 
452 aa  45.1  0.002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3205  nucleoside recognition domain-containing protein  24.14 
 
 
452 aa  45.4  0.002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0327  hypothetical protein  32.69 
 
 
384 aa  44.7  0.003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3353  nucleoside recognition domain-containing protein  22.94 
 
 
461 aa  44.3  0.004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.854  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2910  nucleoside recognition domain-containing protein  24.84 
 
 
449 aa  44.3  0.004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.000000209711  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2588  nucleoside recognition domain-containing protein  24.84 
 
 
449 aa  44.3  0.004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000000362431  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2630  nucleoside recognition domain protein  29.89 
 
 
224 aa  44.3  0.004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2587  nucleoside recognition domain-containing protein  21.61 
 
 
441 aa  44.3  0.004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.577285  normal  0.214795 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2808  nucleoside recognition domain-containing protein  24.82 
 
 
443 aa  43.5  0.006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1129  nucleoside recognition domain-containing protein  24.52 
 
 
452 aa  43.5  0.006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00523822  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1058  nucleoside recognition domain-containing protein  24.52 
 
 
452 aa  43.5  0.006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000157465  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2205  nucleoside recognition domain-containing protein  27.41 
 
 
456 aa  43.5  0.006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0260611  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2243  nucleoside recognition domain-containing protein  27.41 
 
 
456 aa  43.5  0.006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0211126  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2790  nucleoside recognition domain-containing protein  24.31 
 
 
451 aa  43.1  0.008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.727752  normal  0.835537 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0063  hypothetical protein  44 
 
 
458 aa  43.1  0.008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000575905  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1794  hypothetical protein  34.29 
 
 
451 aa  43.1  0.008  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00298391  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1950  nucleoside recognition domain-containing protein  23.57 
 
 
435 aa  42.7  0.01  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.113243  normal  0.0269854 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>