68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal195_3343 on replicon NC_009997
Organism: Shewanella baltica OS195



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009092  Shew_2790  nucleoside recognition domain-containing protein  78.17 
 
 
451 aa  690    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.727752  normal  0.835537 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3520  nucleoside recognition domain-containing protein  81.51 
 
 
451 aa  718    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3343  nucleoside recognition domain-containing protein  100 
 
 
452 aa  894    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3024  nucleoside recognition domain-containing protein  79.11 
 
 
451 aa  706    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.86222  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3353  nucleoside recognition domain-containing protein  81.96 
 
 
461 aa  726    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.854  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3199  nucleoside recognition domain-containing protein  100 
 
 
452 aa  894    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1168  nucleoside recognition domain protein  99.78 
 
 
452 aa  894    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2808  nucleoside recognition domain-containing protein  93 
 
 
443 aa  788    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3205  nucleoside recognition domain-containing protein  99.78 
 
 
452 aa  894    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1392  nucleoside recognition domain-containing protein  72.44 
 
 
463 aa  672    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0994  hypothetical protein  80.31 
 
 
452 aa  709    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1062  nucleoside recognition domain-containing protein  93.14 
 
 
452 aa  812    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.283596  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1012  nucleoside recognition domain-containing protein  79.64 
 
 
450 aa  697    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1129  nucleoside recognition domain-containing protein  92.7 
 
 
452 aa  811    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00523822  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1058  nucleoside recognition domain-containing protein  92.48 
 
 
452 aa  811    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000157465  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1245  hypothetical protein  91.15 
 
 
452 aa  800    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1037  nucleoside recognition  77.38 
 
 
452 aa  690    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0592  membrane protein, putative nucleoside transporter  68.36 
 
 
455 aa  592  1e-168  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.687346  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001424  predicted arginine uptake transporter  68.65 
 
 
438 aa  582  1.0000000000000001e-165  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0157375  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0063  hypothetical protein  67.73 
 
 
458 aa  584  1.0000000000000001e-165  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000575905  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06311  hypothetical protein  68.19 
 
 
454 aa  579  1e-164  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2588  nucleoside recognition domain-containing protein  56.39 
 
 
449 aa  492  9.999999999999999e-139  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000000362431  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2910  nucleoside recognition domain-containing protein  56.61 
 
 
449 aa  489  1e-137  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.000000209711  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1796  nucleoside recognition domain-containing protein  49.66 
 
 
464 aa  457  1e-127  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.440369  normal  0.948878 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1793  nucleoside recognition  54.53 
 
 
479 aa  438  1e-121  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.11571  normal  0.0825987 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1794  hypothetical protein  47.23 
 
 
451 aa  434  1e-120  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00298391  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1774  hypothetical protein  47.03 
 
 
457 aa  410  1e-113  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.32184  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28070  hypothetical protein  48.45 
 
 
455 aa  410  1e-113  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.816379  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2839  nucleoside recognition  46.99 
 
 
463 aa  396  1e-109  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2205  nucleoside recognition domain-containing protein  46.38 
 
 
456 aa  386  1e-106  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0260611  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2243  nucleoside recognition domain-containing protein  46.38 
 
 
456 aa  386  1e-106  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0211126  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1548  nucleoside recognition  43.31 
 
 
468 aa  370  1e-101  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.834674  normal  0.566263 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3099  hypothetical protein  31.94 
 
 
442 aa  218  1e-55  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2893  hypothetical protein  31.5 
 
 
442 aa  216  7e-55  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0838984  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3110  hypothetical protein  31.5 
 
 
442 aa  216  7e-55  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.63107  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2138  nucleoside recognition domain protein  31.54 
 
 
442 aa  216  8e-55  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2888  nucleoside recognition domain-containing protein  32.16 
 
 
442 aa  215  9.999999999999999e-55  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.118792  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3113  hypothetical protein  31.5 
 
 
442 aa  215  9.999999999999999e-55  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2821  hypothetical protein  31.06 
 
 
442 aa  214  3.9999999999999995e-54  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3132  hypothetical protein  31.5 
 
 
442 aa  213  4.9999999999999996e-54  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0941872  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2860  hypothetical protein  30.84 
 
 
442 aa  211  2e-53  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.88357  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3131  hypothetical protein  30.84 
 
 
442 aa  210  5e-53  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2070  nucleoside recognition domain-containing protein  29.67 
 
 
442 aa  202  9e-51  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.329625  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0768  nucleoside recognition domain protein  29.28 
 
 
447 aa  198  2.0000000000000003e-49  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00542215 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2161  nucleoside recognition domain protein  29.35 
 
 
460 aa  194  2e-48  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1490  nucleoside recognition domain-containing protein  28.28 
 
 
439 aa  195  2e-48  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.189522 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22520  hypothetical protein  32.12 
 
 
450 aa  186  7e-46  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1284  nucleoside recognition domain protein  27.98 
 
 
442 aa  184  2.0000000000000003e-45  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000041831  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30690  hypothetical protein  31.09 
 
 
472 aa  184  3e-45  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.970372  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02270  hypothetical protein  28.74 
 
 
458 aa  183  4.0000000000000006e-45  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0205338  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2587  nucleoside recognition domain-containing protein  30.04 
 
 
441 aa  183  5.0000000000000004e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.577285  normal  0.214795 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0851  nucleoside recognition domain-containing protein  26.82 
 
 
463 aa  176  8e-43  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.0177534 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0309  nucleoside recognition domain-containing protein  26.97 
 
 
437 aa  174  2.9999999999999996e-42  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0302  nucleoside recognition domain-containing protein  26.97 
 
 
437 aa  174  2.9999999999999996e-42  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1950  nucleoside recognition domain-containing protein  30.85 
 
 
435 aa  174  2.9999999999999996e-42  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.113243  normal  0.0269854 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1432  nucleoside recognition domain-containing protein  28.23 
 
 
465 aa  163  5.0000000000000005e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.627663  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1931  nucleoside recognition  30.28 
 
 
460 aa  163  5.0000000000000005e-39  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2465  nucleoside recognition domain-containing protein  27.45 
 
 
463 aa  161  2e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4071  nucleoside recognition domain-containing protein  27.48 
 
 
441 aa  158  2e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0047  nucleoside recognition domain protein  26.84 
 
 
450 aa  130  4.0000000000000003e-29  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.307144  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1716  hypothetical protein  26.74 
 
 
379 aa  59.3  0.0000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0764  hypothetical protein  25 
 
 
391 aa  53.5  0.000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2325  hypothetical protein  23.53 
 
 
381 aa  48.1  0.0003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.655913  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0180  membrane protein  25.23 
 
 
380 aa  46.2  0.001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.00000462081  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1350  sporulation integral membrane protein YlbJ  25.65 
 
 
416 aa  45.4  0.002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.430265  normal  0.106884 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1734  nucleoside recognition domain-containing protein  30.84 
 
 
393 aa  44.7  0.003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1172  sporulation integral membrane protein YlbJ  34.18 
 
 
430 aa  44.7  0.003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0456795  normal  0.0749653 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1332  hypothetical protein  21.68 
 
 
374 aa  43.9  0.006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.13452  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>