67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcryo_1931 on replicon NC_007969
Organism: Psychrobacter cryohalolentis K5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007969  Pcryo_1931  nucleoside recognition  100 
 
 
460 aa  917    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0851  nucleoside recognition domain-containing protein  71.88 
 
 
463 aa  625  1e-178  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.0177534 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2465  nucleoside recognition domain-containing protein  54.82 
 
 
463 aa  473  1e-132  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1432  nucleoside recognition domain-containing protein  53.95 
 
 
465 aa  466  9.999999999999999e-131  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.627663  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4071  nucleoside recognition domain-containing protein  56.38 
 
 
441 aa  462  1e-129  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2587  nucleoside recognition domain-containing protein  54.46 
 
 
441 aa  453  1.0000000000000001e-126  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.577285  normal  0.214795 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1950  nucleoside recognition domain-containing protein  53.94 
 
 
435 aa  427  1e-118  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.113243  normal  0.0269854 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2161  nucleoside recognition domain protein  47.12 
 
 
460 aa  420  1e-116  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1284  nucleoside recognition domain protein  50 
 
 
442 aa  412  1e-114  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000041831  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22520  hypothetical protein  49.77 
 
 
450 aa  406  1.0000000000000001e-112  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0309  nucleoside recognition domain-containing protein  48.78 
 
 
437 aa  400  9.999999999999999e-111  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0302  nucleoside recognition domain-containing protein  48.78 
 
 
437 aa  400  9.999999999999999e-111  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3132  hypothetical protein  44.77 
 
 
442 aa  395  1e-109  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0941872  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2888  nucleoside recognition domain-containing protein  47.39 
 
 
442 aa  398  1e-109  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.118792  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3110  hypothetical protein  46.92 
 
 
442 aa  396  1e-109  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.63107  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3113  hypothetical protein  44.99 
 
 
442 aa  395  1e-109  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2860  hypothetical protein  47.16 
 
 
442 aa  397  1e-109  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.88357  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2893  hypothetical protein  46.92 
 
 
442 aa  396  1e-109  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0838984  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2138  nucleoside recognition domain protein  46.68 
 
 
442 aa  394  1e-108  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3131  hypothetical protein  47.16 
 
 
442 aa  394  1e-108  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2821  hypothetical protein  44.54 
 
 
442 aa  395  1e-108  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3099  hypothetical protein  46.45 
 
 
442 aa  389  1e-107  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02270  hypothetical protein  44.8 
 
 
458 aa  385  1e-105  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0205338  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30690  hypothetical protein  49.15 
 
 
472 aa  381  1e-104  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.970372  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2070  nucleoside recognition domain-containing protein  46.15 
 
 
442 aa  376  1e-103  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.329625  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1490  nucleoside recognition domain-containing protein  43.8 
 
 
439 aa  357  1.9999999999999998e-97  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.189522 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0047  nucleoside recognition domain protein  37.64 
 
 
450 aa  294  2e-78  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.307144  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1774  hypothetical protein  29.34 
 
 
457 aa  176  6e-43  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.32184  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1794  hypothetical protein  28.57 
 
 
451 aa  172  1e-41  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00298391  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1392  nucleoside recognition domain-containing protein  28.33 
 
 
463 aa  169  1e-40  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1037  nucleoside recognition  29.48 
 
 
452 aa  168  2e-40  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2243  nucleoside recognition domain-containing protein  29.6 
 
 
456 aa  165  2.0000000000000002e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0211126  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2205  nucleoside recognition domain-containing protein  29.6 
 
 
456 aa  165  2.0000000000000002e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0260611  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2839  nucleoside recognition  29.61 
 
 
463 aa  162  9e-39  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28070  hypothetical protein  29.69 
 
 
455 aa  154  2.9999999999999998e-36  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.816379  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1548  nucleoside recognition  29.3 
 
 
468 aa  151  2e-35  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.834674  normal  0.566263 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1012  nucleoside recognition domain-containing protein  29.35 
 
 
450 aa  150  3e-35  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3520  nucleoside recognition domain-containing protein  29.31 
 
 
451 aa  149  7e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1129  nucleoside recognition domain-containing protein  27.78 
 
 
452 aa  149  1.0000000000000001e-34  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00523822  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1062  nucleoside recognition domain-containing protein  29.66 
 
 
452 aa  149  1.0000000000000001e-34  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.283596  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0063  hypothetical protein  29.07 
 
 
458 aa  149  1.0000000000000001e-34  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000575905  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1058  nucleoside recognition domain-containing protein  27.78 
 
 
452 aa  148  2.0000000000000003e-34  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000157465  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1245  hypothetical protein  27.72 
 
 
452 aa  148  2.0000000000000003e-34  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3353  nucleoside recognition domain-containing protein  28.97 
 
 
461 aa  148  3e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.854  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2808  nucleoside recognition domain-containing protein  27.11 
 
 
443 aa  147  5e-34  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2790  nucleoside recognition domain-containing protein  27.11 
 
 
451 aa  146  6e-34  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.727752  normal  0.835537 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001424  predicted arginine uptake transporter  28.03 
 
 
438 aa  146  7.0000000000000006e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0157375  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3205  nucleoside recognition domain-containing protein  29.31 
 
 
452 aa  144  2e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3343  nucleoside recognition domain-containing protein  29.31 
 
 
452 aa  144  2e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3199  nucleoside recognition domain-containing protein  29.31 
 
 
452 aa  144  2e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1168  nucleoside recognition domain protein  29.31 
 
 
452 aa  144  2e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1793  nucleoside recognition  32.19 
 
 
479 aa  144  3e-33  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.11571  normal  0.0825987 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0994  hypothetical protein  27.05 
 
 
452 aa  143  5e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0592  membrane protein, putative nucleoside transporter  28.62 
 
 
455 aa  142  1.9999999999999998e-32  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.687346  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2910  nucleoside recognition domain-containing protein  27.54 
 
 
449 aa  142  1.9999999999999998e-32  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.000000209711  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2588  nucleoside recognition domain-containing protein  27.31 
 
 
449 aa  141  3e-32  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000000362431  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3024  nucleoside recognition domain-containing protein  25.5 
 
 
451 aa  137  6.0000000000000005e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.86222  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06311  hypothetical protein  26.64 
 
 
454 aa  137  6.0000000000000005e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1796  nucleoside recognition domain-containing protein  26.17 
 
 
464 aa  135  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.440369  normal  0.948878 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0768  nucleoside recognition domain protein  27.9 
 
 
447 aa  122  1.9999999999999998e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00542215 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1001  sporulation integral membrane protein YlbJ  28.12 
 
 
406 aa  53.5  0.000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0990759  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0764  hypothetical protein  30 
 
 
391 aa  48.5  0.0002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10150  Sporulation integral membrane protein YlbJ  28.93 
 
 
406 aa  47.8  0.0004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.206415  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1873  sporulation integral membrane protein YlbJ  28.57 
 
 
411 aa  47  0.0007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0635  nucleoside recognition domain-containing protein  27.59 
 
 
393 aa  46.2  0.001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.00000000395373  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1172  sporulation integral membrane protein YlbJ  25.29 
 
 
430 aa  44.7  0.003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0456795  normal  0.0749653 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1878  sporulation integral membrane protein YlbJ  31.33 
 
 
424 aa  43.1  0.01  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.169606  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>