73 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_2588 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008262  CPR_2588  nucleoside recognition domain-containing protein  100 
 
 		 449 aa  885    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000000362431  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2910  nucleoside recognition domain-containing protein  98.44 
 
 		 449 aa  875    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.000000209711  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1392  nucleoside recognition domain-containing protein  55.01 
 
 		 463 aa  504  1e-141  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3353  nucleoside recognition domain-containing protein  57.56 
 
 		 461 aa  497  1e-139  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.854  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3205  nucleoside recognition domain-containing protein  56.39 
 
 		 452 aa  493  9.999999999999999e-139  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1062  nucleoside recognition domain-containing protein  55.95 
 
 		 452 aa  491  9.999999999999999e-139  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.283596  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1129  nucleoside recognition domain-containing protein  55.73 
 
 		 452 aa  493  9.999999999999999e-139  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00523822  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1058  nucleoside recognition domain-containing protein  55.95 
 
 		 452 aa  494  9.999999999999999e-139  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000157465  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1168  nucleoside recognition domain protein  56.39 
 
 		 452 aa  493  9.999999999999999e-139  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3520  nucleoside recognition domain-containing protein  56.89 
 
 		 451 aa  494  9.999999999999999e-139  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3199  nucleoside recognition domain-containing protein  56.39 
 
 		 452 aa  493  9.999999999999999e-139  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3343  nucleoside recognition domain-containing protein  56.39 
 
 		 452 aa  493  9.999999999999999e-139  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3024  nucleoside recognition domain-containing protein  56.22 
 
 		 451 aa  494  9.999999999999999e-139  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.86222  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2808  nucleoside recognition domain-containing protein  57.01 
 
 		 443 aa  488  1e-137  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0994  hypothetical protein  57.33 
 
 		 452 aa  490  1e-137  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1245  hypothetical protein  55.07 
 
 		 452 aa  486  1e-136  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2790  nucleoside recognition domain-containing protein  56 
 
 		 451 aa  484  1e-135  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.727752  normal  0.835537 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1012  nucleoside recognition domain-containing protein  54.34 
 
 		 450 aa  475  1e-133  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1037  nucleoside recognition  52.78 
 
 		 452 aa  468  1.0000000000000001e-131  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0592  membrane protein, putative nucleoside transporter  56.18 
 
 		 455 aa  463  1e-129  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.687346  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0063  hypothetical protein  53.35 
 
 		 458 aa  461  9.999999999999999e-129  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000575905  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001424  predicted arginine uptake transporter  55.02 
 
 		 438 aa  458  9.999999999999999e-129  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0157375  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06311  hypothetical protein  54.79 
 
 		 454 aa  456  1e-127  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1796  nucleoside recognition domain-containing protein  48.09 
 
 		 464 aa  419  1e-116  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.440369  normal  0.948878 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1774  hypothetical protein  47.51 
 
 		 457 aa  419  1e-116  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.32184  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1793  nucleoside recognition  51.67 
 
 		 479 aa  402  1e-111  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.11571  normal  0.0825987 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28070  hypothetical protein  50.55 
 
 		 455 aa  400  9.999999999999999e-111  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.816379  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1794  hypothetical protein  44.89 
 
 		 451 aa  397  1e-109  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00298391  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2205  nucleoside recognition domain-containing protein  48.31 
 
 		 456 aa  397  1e-109  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0260611  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2243  nucleoside recognition domain-containing protein  48.31 
 
 		 456 aa  397  1e-109  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0211126  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2839  nucleoside recognition  45.86 
 
 		 463 aa  385  1e-106  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1548  nucleoside recognition  43.12 
 
 		 468 aa  360  2e-98  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.834674  normal  0.566263 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2888  nucleoside recognition domain-containing protein  32.52 
 
 		 442 aa  224  2e-57  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.118792  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2860  hypothetical protein  32.74 
 
 		 442 aa  224  2e-57  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.88357  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3113  hypothetical protein  32.52 
 
 		 442 aa  224  3e-57  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3131  hypothetical protein  32.74 
 
 		 442 aa  223  4e-57  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3099  hypothetical protein  32.74 
 
 		 442 aa  223  4e-57  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3132  hypothetical protein  32.96 
 
 		 442 aa  222  9.999999999999999e-57  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0941872  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3110  hypothetical protein  32.3 
 
 		 442 aa  221  1.9999999999999999e-56  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.63107  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2821  hypothetical protein  32.96 
 
 		 442 aa  221  1.9999999999999999e-56  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2138  nucleoside recognition domain protein  32.52 
 
 		 442 aa  221  1.9999999999999999e-56  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2893  hypothetical protein  32.3 
 
 		 442 aa  221  1.9999999999999999e-56  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0838984  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22520  hypothetical protein  31.84 
 
 		 450 aa  221  1.9999999999999999e-56  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2070  nucleoside recognition domain-containing protein  31.45 
 
 		 442 aa  215  9.999999999999999e-55  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.329625  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1284  nucleoside recognition domain protein  31.51 
 
 		 442 aa  214  1.9999999999999998e-54  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000041831  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2161  nucleoside recognition domain protein  31.47 
 
 		 460 aa  214  2.9999999999999995e-54  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0309  nucleoside recognition domain-containing protein  32.05 
 
 		 437 aa  213  4.9999999999999996e-54  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0302  nucleoside recognition domain-containing protein  32.05 
 
 		 437 aa  213  4.9999999999999996e-54  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2465  nucleoside recognition domain-containing protein  28.84 
 
 		 463 aa  194  3e-48  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02270  hypothetical protein  30.43 
 
 		 458 aa  194  3e-48  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0205338  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1490  nucleoside recognition domain-containing protein  29.26 
 
 		 439 aa  190  5e-47  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.189522 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0768  nucleoside recognition domain protein  29.93 
 
 		 447 aa  189  1e-46  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00542215 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30690  hypothetical protein  29.13 
 
 		 472 aa  188  1e-46  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.970372  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0851  nucleoside recognition domain-containing protein  28.18 
 
 		 463 aa  180  4e-44  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0177534 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2587  nucleoside recognition domain-containing protein  30.23 
 
 		 441 aa  179  7e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.577285  normal  0.214795 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1432  nucleoside recognition domain-containing protein  29.77 
 
 		 465 aa  176  6e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.627663  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0047  nucleoside recognition domain protein  29.73 
 
 		 450 aa  172  1e-41  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.307144  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1950  nucleoside recognition domain-containing protein  30.94 
 
 		 435 aa  170  4e-41  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.113243  normal  0.0269854 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4071  nucleoside recognition domain-containing protein  29.69 
 
 		 441 aa  162  1e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1931  nucleoside recognition  27.6 
 
 		 460 aa  157  4e-37  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0180  membrane protein  25 
 
 		 380 aa  51.6  0.00003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.00000462081  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1332  hypothetical protein  23.31 
 
 		 374 aa  50.8  0.00004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.13452  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2325  hypothetical protein  22.96 
 
 		 381 aa  50.1  0.00009  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.655913  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0764  hypothetical protein  25.4 
 
 		 391 aa  49.3  0.0001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1350  sporulation integral membrane protein YlbJ  26.84 
 
 		 416 aa  48.5  0.0002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.430265  normal  0.106884 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1873  sporulation integral membrane protein YlbJ  24.42 
 
 		 411 aa  48.9  0.0002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1734  nucleoside recognition domain-containing protein  37.1 
 
 		 393 aa  46.6  0.0009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1172  sporulation integral membrane protein YlbJ  37.35 
 
 		 430 aa  46.2  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0456795  normal  0.0749653 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1001  sporulation integral membrane protein YlbJ  22.86 
 
 		 406 aa  45.1  0.003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0990759  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3828  nucleoside recognition domain protein  30.53 
 
 		 384 aa  44.3  0.004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000315819  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0226  hypothetical protein  34.52 
 
 		 243 aa  43.9  0.006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001110  hypothetical protein  35.71 
 
 		 245 aa  43.1  0.009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.185501  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04863  hypothetical protein  35.71 
 
 		 246 aa  43.1  0.01  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>