31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_1981 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008261  CPF_1981  sporulation integral membrane protein YlbJ  100 
 
 
386 aa  731    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1699  uncharacterized membrane protein  97.27 
 
 
386 aa  659    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.786998  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1878  sporulation integral membrane protein YlbJ  33.43 
 
 
424 aa  147  2.0000000000000003e-34  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.169606  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1734  nucleoside recognition domain-containing protein  28.35 
 
 
393 aa  135  9.999999999999999e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0764  hypothetical protein  29.45 
 
 
391 aa  134  3e-30  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1229  nucleoside recognition domain protein  29.21 
 
 
325 aa  132  2.0000000000000002e-29  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10150  Sporulation integral membrane protein YlbJ  25.85 
 
 
406 aa  126  8.000000000000001e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.206415  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1274  nucleoside recognition  30.23 
 
 
435 aa  124  2e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.174951  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1873  sporulation integral membrane protein YlbJ  26.39 
 
 
411 aa  121  1.9999999999999998e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1172  sporulation integral membrane protein YlbJ  24.18 
 
 
430 aa  117  3e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0456795  normal  0.0749653 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4029  hypothetical protein  25.8 
 
 
409 aa  117  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0426731  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3755  sporulation integral membrane protein YlbJ  26.88 
 
 
409 aa  116  5e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1350  sporulation integral membrane protein YlbJ  23.37 
 
 
416 aa  116  5e-25  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.430265  normal  0.106884 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1209  hypothetical protein  25.8 
 
 
409 aa  116  6e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00106685  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3975  hypothetical protein  25.51 
 
 
409 aa  114  3e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.279779  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1001  sporulation integral membrane protein YlbJ  26.48 
 
 
406 aa  112  8.000000000000001e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0990759  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3944  hypothetical protein  24.93 
 
 
409 aa  112  9e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3840  hypothetical protein  24.93 
 
 
409 aa  112  9e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2631  sporulation integral membrane protein YlbJ  25.87 
 
 
403 aa  112  9e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00000188887  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4138  hypothetical protein  24.93 
 
 
409 aa  112  9e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3670  hypothetical protein  24.93 
 
 
409 aa  112  9e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.566119  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4040  hypothetical protein  24.93 
 
 
409 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000595429  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0635  nucleoside recognition domain-containing protein  25.4 
 
 
393 aa  112  1.0000000000000001e-23  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.00000000395373  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3687  hypothetical protein  25.51 
 
 
409 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3828  nucleoside recognition domain protein  27.18 
 
 
384 aa  106  6e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000315819  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2080  nucleoside recognition domain-containing protein  24.8 
 
 
419 aa  101  2e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.40354  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0113  nucleoside recognition domain protein  24.84 
 
 
369 aa  97.4  4e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000473689  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0938  nucleoside recognition  24.15 
 
 
407 aa  96.7  6e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000000955347  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1324  nucleoside recognition domain-containing protein  25.99 
 
 
362 aa  95.1  2e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.244161  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1659  sporulation integral membrane protein YlbJ  24.16 
 
 
429 aa  95.1  2e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1766  nucleoside recognition domain protein  25.22 
 
 
415 aa  87.8  3e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.247694 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>