43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_3828 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011830  Dhaf_3828  nucleoside recognition domain protein  100 
 
 
384 aa  754    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000315819  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0938  nucleoside recognition  42.48 
 
 
407 aa  255  8e-67  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000000955347  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1172  sporulation integral membrane protein YlbJ  44 
 
 
430 aa  253  5.000000000000001e-66  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0456795  normal  0.0749653 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1873  sporulation integral membrane protein YlbJ  43.75 
 
 
411 aa  251  1e-65  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3755  sporulation integral membrane protein YlbJ  40.74 
 
 
409 aa  246  4e-64  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1001  sporulation integral membrane protein YlbJ  43.12 
 
 
406 aa  246  4.9999999999999997e-64  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0990759  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3944  hypothetical protein  39.88 
 
 
409 aa  242  9e-63  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3840  hypothetical protein  39.88 
 
 
409 aa  241  1e-62  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3670  hypothetical protein  39.88 
 
 
409 aa  241  1e-62  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.566119  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4138  hypothetical protein  39.88 
 
 
409 aa  241  1e-62  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1350  sporulation integral membrane protein YlbJ  39.25 
 
 
416 aa  240  2e-62  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.430265  normal  0.106884 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3975  hypothetical protein  40.3 
 
 
409 aa  241  2e-62  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.279779  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3687  hypothetical protein  39.57 
 
 
409 aa  239  5e-62  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4040  hypothetical protein  39.57 
 
 
409 aa  239  9e-62  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000595429  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1209  hypothetical protein  40.06 
 
 
409 aa  237  2e-61  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00106685  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2631  sporulation integral membrane protein YlbJ  41.07 
 
 
403 aa  237  3e-61  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00000188887  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4029  hypothetical protein  37.98 
 
 
409 aa  237  3e-61  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0426731  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1734  nucleoside recognition domain-containing protein  32.89 
 
 
393 aa  225  1e-57  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10150  Sporulation integral membrane protein YlbJ  37.78 
 
 
406 aa  219  7e-56  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.206415  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2080  nucleoside recognition domain-containing protein  40.5 
 
 
419 aa  216  4e-55  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.40354  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1878  sporulation integral membrane protein YlbJ  36.18 
 
 
424 aa  216  5.9999999999999996e-55  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.169606  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1274  nucleoside recognition  40.26 
 
 
435 aa  209  7e-53  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.174951  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1659  sporulation integral membrane protein YlbJ  37.34 
 
 
429 aa  206  6e-52  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0635  nucleoside recognition domain-containing protein  41.1 
 
 
393 aa  205  9e-52  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.00000000395373  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0764  hypothetical protein  36.51 
 
 
391 aa  187  3e-46  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0113  nucleoside recognition domain protein  40.58 
 
 
369 aa  185  1.0000000000000001e-45  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000473689  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1766  nucleoside recognition domain protein  33.33 
 
 
415 aa  178  1e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.247694 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1229  nucleoside recognition domain protein  27.69 
 
 
325 aa  119  7e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1324  nucleoside recognition domain-containing protein  27.99 
 
 
362 aa  107  4e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.244161  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1699  uncharacterized membrane protein  26.86 
 
 
386 aa  105  2e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.786998  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1981  sporulation integral membrane protein YlbJ  27.51 
 
 
386 aa  90.5  5e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0768  nucleoside recognition domain protein  32.43 
 
 
447 aa  56.6  0.0000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00542215 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22520  hypothetical protein  26.32 
 
 
450 aa  53.5  0.000006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0309  nucleoside recognition domain-containing protein  30.77 
 
 
437 aa  50.4  0.00005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0302  nucleoside recognition domain-containing protein  30.77 
 
 
437 aa  50.4  0.00005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30690  hypothetical protein  32.18 
 
 
472 aa  46.2  0.0009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.970372  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1432  nucleoside recognition domain-containing protein  24.86 
 
 
465 aa  46.2  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.627663  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1284  nucleoside recognition domain protein  29.87 
 
 
442 aa  46.2  0.001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000041831  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4071  nucleoside recognition domain-containing protein  30.56 
 
 
441 aa  45.1  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2161  nucleoside recognition domain protein  29.21 
 
 
460 aa  45.4  0.002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2465  nucleoside recognition domain-containing protein  30.26 
 
 
463 aa  45.4  0.002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0047  nucleoside recognition domain protein  22.95 
 
 
450 aa  43.5  0.006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.307144  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2587  nucleoside recognition domain-containing protein  26.67 
 
 
441 aa  43.1  0.008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.577285  normal  0.214795 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>