72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GWCH70_1284 on replicon NC_012793
Organism: Geobacillus sp. WCH70



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013411  GYMC61_2161  nucleoside recognition domain protein  83.94 
 
 
460 aa  754    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1284  nucleoside recognition domain protein  100 
 
 
442 aa  874    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000041831  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3131  hypothetical protein  63.3 
 
 
442 aa  573  1.0000000000000001e-162  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2888  nucleoside recognition domain-containing protein  62.84 
 
 
442 aa  569  1e-161  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.118792  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2893  hypothetical protein  64.85 
 
 
442 aa  569  1e-161  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0838984  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2821  hypothetical protein  65.08 
 
 
442 aa  570  1e-161  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3110  hypothetical protein  64.85 
 
 
442 aa  569  1e-161  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.63107  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3113  hypothetical protein  64.85 
 
 
442 aa  567  1e-160  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3132  hypothetical protein  64.85 
 
 
442 aa  567  1e-160  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0941872  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3099  hypothetical protein  64.47 
 
 
442 aa  566  1e-160  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2138  nucleoside recognition domain protein  64.47 
 
 
442 aa  566  1e-160  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2860  hypothetical protein  64.61 
 
 
442 aa  565  1e-160  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.88357  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2070  nucleoside recognition domain-containing protein  64.37 
 
 
442 aa  553  1e-156  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.329625  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22520  hypothetical protein  60.82 
 
 
450 aa  525  1e-148  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2465  nucleoside recognition domain-containing protein  56.32 
 
 
463 aa  481  1e-134  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0309  nucleoside recognition domain-containing protein  54.67 
 
 
437 aa  478  1e-134  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0302  nucleoside recognition domain-containing protein  54.67 
 
 
437 aa  478  1e-134  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02270  hypothetical protein  56.03 
 
 
458 aa  470  1.0000000000000001e-131  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0205338  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1490  nucleoside recognition domain-containing protein  54.5 
 
 
439 aa  463  1e-129  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.189522 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1432  nucleoside recognition domain-containing protein  56.67 
 
 
465 aa  445  1.0000000000000001e-124  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.627663  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2587  nucleoside recognition domain-containing protein  55.4 
 
 
441 aa  440  9.999999999999999e-123  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.577285  normal  0.214795 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1950  nucleoside recognition domain-containing protein  54.23 
 
 
435 aa  433  1e-120  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.113243  normal  0.0269854 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30690  hypothetical protein  51.08 
 
 
472 aa  426  1e-118  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.970372  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1931  nucleoside recognition  50 
 
 
460 aa  424  1e-117  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0851  nucleoside recognition domain-containing protein  48.34 
 
 
463 aa  419  1e-116  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.0177534 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4071  nucleoside recognition domain-containing protein  51.54 
 
 
441 aa  410  1e-113  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0047  nucleoside recognition domain protein  45.83 
 
 
450 aa  386  1e-106  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.307144  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2205  nucleoside recognition domain-containing protein  34.08 
 
 
456 aa  219  1e-55  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0260611  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2243  nucleoside recognition domain-containing protein  34.08 
 
 
456 aa  219  1e-55  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0211126  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1774  hypothetical protein  32.51 
 
 
457 aa  210  3e-53  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.32184  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1392  nucleoside recognition domain-containing protein  34.46 
 
 
463 aa  206  5e-52  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1037  nucleoside recognition  36.62 
 
 
452 aa  204  2e-51  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1794  hypothetical protein  32.73 
 
 
451 aa  202  7e-51  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00298391  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1548  nucleoside recognition  32.12 
 
 
468 aa  202  9.999999999999999e-51  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.834674  normal  0.566263 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2588  nucleoside recognition domain-containing protein  31.89 
 
 
449 aa  200  3.9999999999999996e-50  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000000362431  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2910  nucleoside recognition domain-containing protein  31.89 
 
 
449 aa  200  5e-50  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.000000209711  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1793  nucleoside recognition  31.76 
 
 
479 aa  196  9e-49  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.11571  normal  0.0825987 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2839  nucleoside recognition  32.03 
 
 
463 aa  194  3e-48  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1796  nucleoside recognition domain-containing protein  32.17 
 
 
464 aa  193  4e-48  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.440369  normal  0.948878 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0063  hypothetical protein  31.79 
 
 
458 aa  192  8e-48  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000575905  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28070  hypothetical protein  30.11 
 
 
455 aa  191  2e-47  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.816379  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1012  nucleoside recognition domain-containing protein  31.51 
 
 
450 aa  188  1e-46  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0994  hypothetical protein  36.08 
 
 
452 aa  180  4.999999999999999e-44  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001424  predicted arginine uptake transporter  32.95 
 
 
438 aa  180  5.999999999999999e-44  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0157375  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06311  hypothetical protein  29.69 
 
 
454 aa  179  8e-44  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3520  nucleoside recognition domain-containing protein  32.1 
 
 
451 aa  178  2e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1245  hypothetical protein  32.19 
 
 
452 aa  175  9.999999999999999e-43  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2790  nucleoside recognition domain-containing protein  33.07 
 
 
451 aa  176  9.999999999999999e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.727752  normal  0.835537 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3353  nucleoside recognition domain-containing protein  32.29 
 
 
461 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.854  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3024  nucleoside recognition domain-containing protein  32.1 
 
 
451 aa  174  2.9999999999999996e-42  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.86222  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1129  nucleoside recognition domain-containing protein  33.45 
 
 
452 aa  173  5e-42  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00523822  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1058  nucleoside recognition domain-containing protein  33.45 
 
 
452 aa  173  5e-42  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000157465  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2808  nucleoside recognition domain-containing protein  33.1 
 
 
443 aa  173  5.999999999999999e-42  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1062  nucleoside recognition domain-containing protein  31.62 
 
 
452 aa  172  9e-42  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.283596  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0592  membrane protein, putative nucleoside transporter  31.28 
 
 
455 aa  172  1e-41  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.687346  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1168  nucleoside recognition domain protein  27.92 
 
 
452 aa  171  3e-41  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3205  nucleoside recognition domain-containing protein  27.92 
 
 
452 aa  171  3e-41  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3343  nucleoside recognition domain-containing protein  32.76 
 
 
452 aa  170  4e-41  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3199  nucleoside recognition domain-containing protein  32.76 
 
 
452 aa  170  4e-41  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0768  nucleoside recognition domain protein  27.47 
 
 
447 aa  156  6e-37  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00542215 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0635  nucleoside recognition domain-containing protein  32.95 
 
 
393 aa  53.9  0.000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.00000000395373  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1172  sporulation integral membrane protein YlbJ  24.12 
 
 
430 aa  51.6  0.00003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0456795  normal  0.0749653 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1873  sporulation integral membrane protein YlbJ  28.41 
 
 
411 aa  49.3  0.0001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1350  sporulation integral membrane protein YlbJ  23.61 
 
 
416 aa  48.5  0.0002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.430265  normal  0.106884 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2080  nucleoside recognition domain-containing protein  32.05 
 
 
419 aa  48.5  0.0003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.40354  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10150  Sporulation integral membrane protein YlbJ  31.71 
 
 
406 aa  48.1  0.0003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.206415  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0764  hypothetical protein  28.05 
 
 
391 aa  47  0.0007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1001  sporulation integral membrane protein YlbJ  26.37 
 
 
406 aa  45.8  0.001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0990759  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3828  nucleoside recognition domain protein  29.87 
 
 
384 aa  45.8  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000315819  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1878  sporulation integral membrane protein YlbJ  27.05 
 
 
424 aa  45.4  0.002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.169606  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1734  nucleoside recognition domain-containing protein  21.91 
 
 
393 aa  44.7  0.003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1659  sporulation integral membrane protein YlbJ  20.81 
 
 
429 aa  43.9  0.006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>