61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_1950 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008709  Ping_1950  nucleoside recognition domain-containing protein  100 
 
 		 435 aa  853    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.113243  normal  0.0269854 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2465  nucleoside recognition domain-containing protein  61.11 
 
 		 463 aa  494  9.999999999999999e-139  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2161  nucleoside recognition domain protein  53.33 
 
 		 460 aa  449  1e-125  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2888  nucleoside recognition domain-containing protein  54.87 
 
 		 442 aa  451  1e-125  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.118792  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3132  hypothetical protein  54.39 
 
 		 442 aa  449  1e-125  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0941872  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3113  hypothetical protein  54.39 
 
 		 442 aa  446  1.0000000000000001e-124  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3110  hypothetical protein  54.39 
 
 		 442 aa  447  1.0000000000000001e-124  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.63107  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2821  hypothetical protein  54.16 
 
 		 442 aa  448  1.0000000000000001e-124  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2860  hypothetical protein  54.81 
 
 		 442 aa  447  1.0000000000000001e-124  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.88357  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2893  hypothetical protein  54.39 
 
 		 442 aa  447  1.0000000000000001e-124  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0838984  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2138  nucleoside recognition domain protein  54.39 
 
 		 442 aa  442  1e-123  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2070  nucleoside recognition domain-containing protein  53.1 
 
 		 442 aa  443  1e-123  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.329625  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3131  hypothetical protein  53.68 
 
 		 442 aa  442  1e-123  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1931  nucleoside recognition  53.83 
 
 		 460 aa  439  9.999999999999999e-123  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3099  hypothetical protein  54.16 
 
 		 442 aa  440  9.999999999999999e-123  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22520  hypothetical protein  54.7 
 
 		 450 aa  441  9.999999999999999e-123  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1284  nucleoside recognition domain protein  54.05 
 
 		 442 aa  437  1e-121  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000041831  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02270  hypothetical protein  52.03 
 
 		 458 aa  429  1e-119  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0205338  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1432  nucleoside recognition domain-containing protein  54.52 
 
 		 465 aa  426  1e-118  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.627663  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0851  nucleoside recognition domain-containing protein  53.62 
 
 		 463 aa  422  1e-117  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0177534 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4071  nucleoside recognition domain-containing protein  51.81 
 
 		 441 aa  406  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0302  nucleoside recognition domain-containing protein  48.63 
 
 		 437 aa  399  9.999999999999999e-111  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1490  nucleoside recognition domain-containing protein  51.31 
 
 		 439 aa  399  9.999999999999999e-111  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.189522 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0309  nucleoside recognition domain-containing protein  48.63 
 
 		 437 aa  399  9.999999999999999e-111  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2587  nucleoside recognition domain-containing protein  52.18 
 
 		 441 aa  400  9.999999999999999e-111  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.577285  normal  0.214795 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30690  hypothetical protein  46.25 
 
 		 472 aa  362  7.0000000000000005e-99  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.970372  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0047  nucleoside recognition domain protein  39.86 
 
 		 450 aa  324  2e-87  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.307144  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1774  hypothetical protein  32.96 
 
 		 457 aa  196  6e-49  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.32184  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2205  nucleoside recognition domain-containing protein  32.1 
 
 		 456 aa  182  1e-44  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0260611  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2243  nucleoside recognition domain-containing protein  32.1 
 
 		 456 aa  182  1e-44  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0211126  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1037  nucleoside recognition  30.32 
 
 		 452 aa  175  1.9999999999999998e-42  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1392  nucleoside recognition domain-containing protein  28.9 
 
 		 463 aa  174  2.9999999999999996e-42  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2790  nucleoside recognition domain-containing protein  28.91 
 
 		 451 aa  173  5.999999999999999e-42  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.727752  normal  0.835537 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3353  nucleoside recognition domain-containing protein  31.13 
 
 		 461 aa  170  4e-41  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.854  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1548  nucleoside recognition  32.87 
 
 		 468 aa  170  4e-41  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.834674  normal  0.566263 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28070  hypothetical protein  30.02 
 
 		 455 aa  170  5e-41  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.816379  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0592  membrane protein, putative nucleoside transporter  30.65 
 
 		 455 aa  169  1e-40  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.687346  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2910  nucleoside recognition domain-containing protein  31.07 
 
 		 449 aa  167  2e-40  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.000000209711  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3520  nucleoside recognition domain-containing protein  29.86 
 
 		 451 aa  167  4e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1012  nucleoside recognition domain-containing protein  30.02 
 
 		 450 aa  166  1.0000000000000001e-39  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2588  nucleoside recognition domain-containing protein  31.17 
 
 		 449 aa  164  4.0000000000000004e-39  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000000362431  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1794  hypothetical protein  33.44 
 
 		 451 aa  163  5.0000000000000005e-39  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00298391  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1796  nucleoside recognition domain-containing protein  31.83 
 
 		 464 aa  163  6e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.440369  normal  0.948878 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3199  nucleoside recognition domain-containing protein  29.64 
 
 		 452 aa  161  2e-38  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3205  nucleoside recognition domain-containing protein  29.64 
 
 		 452 aa  161  2e-38  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1168  nucleoside recognition domain protein  29.64 
 
 		 452 aa  161  2e-38  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3343  nucleoside recognition domain-containing protein  29.64 
 
 		 452 aa  161  2e-38  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1129  nucleoside recognition domain-containing protein  28.73 
 
 		 452 aa  160  4e-38  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00523822  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1058  nucleoside recognition domain-containing protein  28.73 
 
 		 452 aa  160  5e-38  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000157465  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1062  nucleoside recognition domain-containing protein  28.05 
 
 		 452 aa  160  5e-38  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.283596  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0063  hypothetical protein  28.77 
 
 		 458 aa  155  1e-36  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000575905  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2808  nucleoside recognition domain-containing protein  28.34 
 
 		 443 aa  155  2e-36  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001424  predicted arginine uptake transporter  29.45 
 
 		 438 aa  154  2e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0157375  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2839  nucleoside recognition  28.84 
 
 		 463 aa  154  4e-36  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1245  hypothetical protein  28.6 
 
 		 452 aa  154  4e-36  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3024  nucleoside recognition domain-containing protein  28.54 
 
 		 451 aa  153  7e-36  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.86222  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06311  hypothetical protein  29.38 
 
 		 454 aa  152  2e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0994  hypothetical protein  32.62 
 
 		 452 aa  151  2e-35  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1793  nucleoside recognition  32.98 
 
 		 479 aa  150  3e-35  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.11571  normal  0.0825987 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0768  nucleoside recognition domain protein  26.15 
 
 		 447 aa  132  1.0000000000000001e-29  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00542215 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1172  sporulation integral membrane protein YlbJ  22.22 
 
 		 430 aa  43.9  0.006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0456795  normal  0.0749653 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>