60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcryo_1548 on replicon NC_007969
Organism: Psychrobacter cryohalolentis K5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007969  Pcryo_1548  nucleoside recognition  100 
 
 
468 aa  936    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.834674  normal  0.566263 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1796  nucleoside recognition domain-containing protein  49.14 
 
 
464 aa  421  1e-116  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.440369  normal  0.948878 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1012  nucleoside recognition domain-containing protein  45.45 
 
 
450 aa  389  1e-107  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1037  nucleoside recognition  43.9 
 
 
452 aa  385  1e-106  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1392  nucleoside recognition domain-containing protein  43.33 
 
 
463 aa  387  1e-106  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2790  nucleoside recognition domain-containing protein  46.26 
 
 
451 aa  384  1e-105  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.727752  normal  0.835537 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2839  nucleoside recognition  45.95 
 
 
463 aa  379  1e-104  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3024  nucleoside recognition domain-containing protein  44.67 
 
 
451 aa  372  1e-102  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.86222  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3520  nucleoside recognition domain-containing protein  43.76 
 
 
451 aa  369  1e-101  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3343  nucleoside recognition domain-containing protein  43.31 
 
 
452 aa  367  1e-100  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1168  nucleoside recognition domain protein  43.31 
 
 
452 aa  368  1e-100  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0063  hypothetical protein  43.54 
 
 
458 aa  366  1e-100  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000575905  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2808  nucleoside recognition domain-containing protein  43.31 
 
 
443 aa  366  1e-100  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3205  nucleoside recognition domain-containing protein  43.31 
 
 
452 aa  368  1e-100  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3199  nucleoside recognition domain-containing protein  43.31 
 
 
452 aa  367  1e-100  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1062  nucleoside recognition domain-containing protein  43.54 
 
 
452 aa  367  1e-100  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.283596  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1058  nucleoside recognition domain-containing protein  42.7 
 
 
452 aa  367  1e-100  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000157465  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1245  hypothetical protein  42.7 
 
 
452 aa  366  1e-100  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1129  nucleoside recognition domain-containing protein  42.92 
 
 
452 aa  368  1e-100  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00523822  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06311  hypothetical protein  43.54 
 
 
454 aa  363  3e-99  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3353  nucleoside recognition domain-containing protein  42.4 
 
 
461 aa  362  6e-99  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.854  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0994  hypothetical protein  43.31 
 
 
452 aa  362  7.0000000000000005e-99  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2910  nucleoside recognition domain-containing protein  43.57 
 
 
449 aa  361  1e-98  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.000000209711  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2588  nucleoside recognition domain-containing protein  43.12 
 
 
449 aa  360  3e-98  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000000362431  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001424  predicted arginine uptake transporter  43.48 
 
 
438 aa  353  2.9999999999999997e-96  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0157375  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0592  membrane protein, putative nucleoside transporter  43.34 
 
 
455 aa  353  2.9999999999999997e-96  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.687346  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1774  hypothetical protein  39.55 
 
 
457 aa  330  3e-89  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.32184  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2205  nucleoside recognition domain-containing protein  41.27 
 
 
456 aa  324  3e-87  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0260611  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2243  nucleoside recognition domain-containing protein  41.27 
 
 
456 aa  324  3e-87  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0211126  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1794  hypothetical protein  39 
 
 
451 aa  322  9.000000000000001e-87  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00298391  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1793  nucleoside recognition  40.56 
 
 
479 aa  306  6e-82  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.11571  normal  0.0825987 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28070  hypothetical protein  39.56 
 
 
455 aa  302  8.000000000000001e-81  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.816379  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3099  hypothetical protein  32.73 
 
 
442 aa  220  3e-56  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2888  nucleoside recognition domain-containing protein  33.56 
 
 
442 aa  217  2.9999999999999998e-55  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.118792  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2138  nucleoside recognition domain protein  32.37 
 
 
442 aa  216  5.9999999999999996e-55  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2070  nucleoside recognition domain-containing protein  31.82 
 
 
442 aa  214  2.9999999999999995e-54  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.329625  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2860  hypothetical protein  32.5 
 
 
442 aa  214  2.9999999999999995e-54  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.88357  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3113  hypothetical protein  32.65 
 
 
442 aa  213  5.999999999999999e-54  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3132  hypothetical protein  31.82 
 
 
442 aa  213  7e-54  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0941872  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3110  hypothetical protein  32.65 
 
 
442 aa  213  7.999999999999999e-54  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.63107  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2821  hypothetical protein  32.05 
 
 
442 aa  213  7.999999999999999e-54  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2893  hypothetical protein  32.65 
 
 
442 aa  213  7.999999999999999e-54  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0838984  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3131  hypothetical protein  32.65 
 
 
442 aa  211  2e-53  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1284  nucleoside recognition domain protein  31.55 
 
 
442 aa  210  4e-53  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000041831  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2161  nucleoside recognition domain protein  31.74 
 
 
460 aa  208  1e-52  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0309  nucleoside recognition domain-containing protein  31.54 
 
 
437 aa  198  1.0000000000000001e-49  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0302  nucleoside recognition domain-containing protein  31.54 
 
 
437 aa  198  1.0000000000000001e-49  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30690  hypothetical protein  33.02 
 
 
472 aa  187  3e-46  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.970372  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22520  hypothetical protein  31.29 
 
 
450 aa  184  3e-45  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1490  nucleoside recognition domain-containing protein  31.14 
 
 
439 aa  183  6e-45  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.189522 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02270  hypothetical protein  28.41 
 
 
458 aa  178  1e-43  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0205338  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1950  nucleoside recognition domain-containing protein  32.86 
 
 
435 aa  171  3e-41  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.113243  normal  0.0269854 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0851  nucleoside recognition domain-containing protein  28.29 
 
 
463 aa  169  1e-40  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.0177534 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2465  nucleoside recognition domain-containing protein  30.73 
 
 
463 aa  165  2.0000000000000002e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2587  nucleoside recognition domain-containing protein  30.02 
 
 
441 aa  165  2.0000000000000002e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.577285  normal  0.214795 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1931  nucleoside recognition  29.3 
 
 
460 aa  164  4.0000000000000004e-39  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0768  nucleoside recognition domain protein  28.79 
 
 
447 aa  161  3e-38  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00542215 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1432  nucleoside recognition domain-containing protein  28.34 
 
 
465 aa  159  1e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.627663  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4071  nucleoside recognition domain-containing protein  30.32 
 
 
441 aa  158  2e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0047  nucleoside recognition domain protein  27.65 
 
 
450 aa  135  1.9999999999999998e-30  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.307144  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>