67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_II0592 on replicon NC_011313
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009456  VC0395_0063  hypothetical protein  76.54 
 
 
458 aa  660    Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000575905  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0592  membrane protein, putative nucleoside transporter  100 
 
 
455 aa  894    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.687346  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06311  hypothetical protein  76.48 
 
 
454 aa  660    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001424  predicted arginine uptake transporter  79 
 
 
438 aa  661    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0157375  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1392  nucleoside recognition domain-containing protein  66.52 
 
 
463 aa  623  1e-177  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3353  nucleoside recognition domain-containing protein  69.46 
 
 
461 aa  606  9.999999999999999e-173  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.854  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1245  hypothetical protein  69.23 
 
 
452 aa  602  1.0000000000000001e-171  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2808  nucleoside recognition domain-containing protein  69.68 
 
 
443 aa  602  1.0000000000000001e-171  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1062  nucleoside recognition domain-containing protein  69.23 
 
 
452 aa  600  1e-170  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.283596  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1058  nucleoside recognition domain-containing protein  69.23 
 
 
452 aa  598  1e-170  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000157465  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2790  nucleoside recognition domain-containing protein  69.68 
 
 
451 aa  596  1e-169  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.727752  normal  0.835537 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1129  nucleoside recognition domain-containing protein  69.46 
 
 
452 aa  597  1e-169  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00523822  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3520  nucleoside recognition domain-containing protein  67.41 
 
 
451 aa  596  1e-169  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1037  nucleoside recognition  68.25 
 
 
452 aa  595  1e-169  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3205  nucleoside recognition domain-containing protein  68.14 
 
 
452 aa  593  1e-168  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0994  hypothetical protein  68.1 
 
 
452 aa  592  1e-168  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1168  nucleoside recognition domain protein  68.14 
 
 
452 aa  593  1e-168  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3199  nucleoside recognition domain-containing protein  68.36 
 
 
452 aa  594  1e-168  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3343  nucleoside recognition domain-containing protein  68.36 
 
 
452 aa  594  1e-168  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1012  nucleoside recognition domain-containing protein  66.82 
 
 
450 aa  585  1e-166  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3024  nucleoside recognition domain-containing protein  66.52 
 
 
451 aa  585  1e-166  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.86222  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2910  nucleoside recognition domain-containing protein  56.63 
 
 
449 aa  470  1.0000000000000001e-131  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.000000209711  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2588  nucleoside recognition domain-containing protein  56.18 
 
 
449 aa  464  1e-129  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000000362431  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1796  nucleoside recognition domain-containing protein  49.21 
 
 
464 aa  431  1e-119  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.440369  normal  0.948878 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1794  hypothetical protein  48.65 
 
 
451 aa  428  1e-118  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00298391  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1793  nucleoside recognition  54.89 
 
 
479 aa  424  1e-117  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.11571  normal  0.0825987 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28070  hypothetical protein  49.78 
 
 
455 aa  390  1e-107  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.816379  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1774  hypothetical protein  44.37 
 
 
457 aa  377  1e-103  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.32184  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2205  nucleoside recognition domain-containing protein  46.31 
 
 
456 aa  372  1e-102  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0260611  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2243  nucleoside recognition domain-containing protein  46.31 
 
 
456 aa  372  1e-102  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0211126  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2839  nucleoside recognition  45.9 
 
 
463 aa  367  1e-100  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1548  nucleoside recognition  43.34 
 
 
468 aa  358  9e-98  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.834674  normal  0.566263 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3099  hypothetical protein  30.4 
 
 
442 aa  200  5e-50  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2860  hypothetical protein  31.85 
 
 
442 aa  198  2.0000000000000003e-49  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.88357  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2138  nucleoside recognition domain protein  29.96 
 
 
442 aa  196  8.000000000000001e-49  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3113  hypothetical protein  29.6 
 
 
442 aa  195  1e-48  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2161  nucleoside recognition domain protein  30.48 
 
 
460 aa  195  2e-48  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2888  nucleoside recognition domain-containing protein  29.93 
 
 
442 aa  194  3e-48  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.118792  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02270  hypothetical protein  30.79 
 
 
458 aa  194  3e-48  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0205338  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3110  hypothetical protein  29.78 
 
 
442 aa  194  3e-48  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.63107  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2893  hypothetical protein  29.78 
 
 
442 aa  194  3e-48  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0838984  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3132  hypothetical protein  29.91 
 
 
442 aa  194  4e-48  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0941872  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2821  hypothetical protein  31.33 
 
 
442 aa  192  7e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3131  hypothetical protein  31.25 
 
 
442 aa  191  2e-47  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0768  nucleoside recognition domain protein  28.73 
 
 
447 aa  188  2e-46  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00542215 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1284  nucleoside recognition domain protein  30.93 
 
 
442 aa  187  3e-46  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000041831  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22520  hypothetical protein  30.75 
 
 
450 aa  187  3e-46  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1490  nucleoside recognition domain-containing protein  30.02 
 
 
439 aa  185  2.0000000000000003e-45  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.189522 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0302  nucleoside recognition domain-containing protein  28.7 
 
 
437 aa  184  2.0000000000000003e-45  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0309  nucleoside recognition domain-containing protein  28.7 
 
 
437 aa  184  2.0000000000000003e-45  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2070  nucleoside recognition domain-containing protein  28.67 
 
 
442 aa  183  7e-45  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.329625  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1950  nucleoside recognition domain-containing protein  31.43 
 
 
435 aa  178  2e-43  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.113243  normal  0.0269854 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30690  hypothetical protein  29.56 
 
 
472 aa  176  6e-43  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.970372  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0851  nucleoside recognition domain-containing protein  28.29 
 
 
463 aa  172  2e-41  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.0177534 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1432  nucleoside recognition domain-containing protein  30 
 
 
465 aa  159  7e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.627663  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1931  nucleoside recognition  27.27 
 
 
460 aa  159  9e-38  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2587  nucleoside recognition domain-containing protein  28.67 
 
 
441 aa  155  1e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.577285  normal  0.214795 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2465  nucleoside recognition domain-containing protein  27.43 
 
 
463 aa  154  2e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4071  nucleoside recognition domain-containing protein  29.45 
 
 
441 aa  152  8e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0047  nucleoside recognition domain protein  26.27 
 
 
450 aa  133  6.999999999999999e-30  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.307144  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1172  sporulation integral membrane protein YlbJ  25.26 
 
 
430 aa  52.4  0.00002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0456795  normal  0.0749653 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1716  hypothetical protein  24.66 
 
 
379 aa  49.3  0.0001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1332  hypothetical protein  23.83 
 
 
374 aa  48.5  0.0003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.13452  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06390  hypothetical protein  24.03 
 
 
395 aa  48.1  0.0003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0764  hypothetical protein  37.18 
 
 
391 aa  46.6  0.001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2080  nucleoside recognition domain-containing protein  30.93 
 
 
419 aa  45.1  0.003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.40354  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0180  membrane protein  23.85 
 
 
380 aa  43.5  0.008  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.00000462081  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>