More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_09100 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013172  Bfae_09100  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  100 
 
 
296 aa  587  1e-167  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0994579  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07740  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  78.91 
 
 
297 aa  478  1e-134  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.55116  normal  0.434158 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7986  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  79.59 
 
 
295 aa  468  1.0000000000000001e-131  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4423  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  78.42 
 
 
292 aa  460  9.999999999999999e-129  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.690796  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04930  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  78.23 
 
 
295 aa  454  1e-127  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.861039  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3016  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  76.43 
 
 
296 aa  452  1.0000000000000001e-126  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0145094  normal  0.0121594 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0605  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  74.92 
 
 
295 aa  452  1.0000000000000001e-126  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.25955  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3812  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  75.77 
 
 
295 aa  451  1.0000000000000001e-126  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4220  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  75.51 
 
 
295 aa  448  1e-125  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28150  succinyl-CoA synthetase (ADP-forming) alpha subunit  78.98 
 
 
296 aa  442  1e-123  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4202  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  74.06 
 
 
295 aa  443  1e-123  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.886218  hitchhiker  0.00857355 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6507  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  79.52 
 
 
296 aa  439  9.999999999999999e-123  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3998  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  73.4 
 
 
299 aa  439  9.999999999999999e-123  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0147811  normal  0.27288 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0816  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  75.08 
 
 
300 aa  439  9.999999999999999e-123  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0728  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  73.65 
 
 
298 aa  436  1e-121  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0061  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  76.79 
 
 
292 aa  434  1e-121  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00177759 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5979  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  74.06 
 
 
290 aa  437  1e-121  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0361714  normal  0.14161 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2536  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  78.77 
 
 
292 aa  432  1e-120  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.269234 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4116  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  74.92 
 
 
312 aa  430  1e-119  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2576  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  75.09 
 
 
292 aa  424  1e-118  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10970  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  73.74 
 
 
303 aa  425  1e-118  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.107205  normal  0.560445 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0655  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  71.96 
 
 
291 aa  427  1e-118  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.374362 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1244  succinyl-CoA synthetase (ADP-forming) alpha subunit  72.3 
 
 
291 aa  425  1e-118  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.345661  normal  0.0101551 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1342  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  72.33 
 
 
304 aa  426  1e-118  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.077758  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0652  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  74.06 
 
 
290 aa  422  1e-117  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.413913 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1266  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  76.45 
 
 
293 aa  419  1e-116  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0021014  normal  0.775706 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4706  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  75.67 
 
 
300 aa  420  1e-116  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4326  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  75 
 
 
300 aa  418  1e-116  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0381  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  70.61 
 
 
295 aa  419  1e-116  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4412  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  75 
 
 
300 aa  418  1e-116  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  decreased coverage  0.00673609  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1866  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  71.81 
 
 
300 aa  416  9.999999999999999e-116  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0557225 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0672  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  74.58 
 
 
297 aa  416  9.999999999999999e-116  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.267798 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04280  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  75.49 
 
 
306 aa  412  1e-114  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.844796  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3589  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  73.56 
 
 
297 aa  411  1e-114  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4869  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  74.25 
 
 
300 aa  412  1e-114  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.300711 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0933  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  74.16 
 
 
300 aa  412  1e-114  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3310  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  73.83 
 
 
300 aa  405  1.0000000000000001e-112  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0457  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  62.96 
 
 
303 aa  369  1e-101  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.355464  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1275  succinyl-CoA synthetase (ADP-forming) alpha subunit  56.46 
 
 
292 aa  322  5e-87  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.43914  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3250  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  55.1 
 
 
290 aa  309  4e-83  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0118943  unclonable  0.0000183638 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3739  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  54.79 
 
 
290 aa  305  6e-82  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00386146  unclonable  0.000000000321721 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2819  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  54.03 
 
 
296 aa  303  2.0000000000000002e-81  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0288  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  52.7 
 
 
290 aa  303  3.0000000000000004e-81  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1993  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  53.56 
 
 
300 aa  302  6.000000000000001e-81  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1465  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  51.86 
 
 
308 aa  301  8.000000000000001e-81  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3658  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  53.22 
 
 
300 aa  301  8.000000000000001e-81  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000316664  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1100  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  53.54 
 
 
300 aa  301  9e-81  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0979666  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1376  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  51.86 
 
 
299 aa  301  9e-81  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2487  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  53.22 
 
 
300 aa  300  1e-80  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000153221  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0115  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  50.85 
 
 
291 aa  301  1e-80  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.732037  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2405  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  53.95 
 
 
300 aa  301  1e-80  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.861166  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3877  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  53.56 
 
 
300 aa  300  2e-80  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000526587  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3686  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  53.56 
 
 
300 aa  300  2e-80  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0387134  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3576  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  53.56 
 
 
300 aa  300  2e-80  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0154825  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3594  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  53.56 
 
 
300 aa  300  2e-80  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.372712  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3933  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  53.56 
 
 
300 aa  300  2e-80  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000608067  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3973  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  53.56 
 
 
300 aa  300  2e-80  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00161204  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3882  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  53.56 
 
 
300 aa  300  2e-80  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000124479  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1310  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  53.56 
 
 
300 aa  300  2e-80  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000061731  unclonable  1.5256899999999999e-25 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3723  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  52.38 
 
 
329 aa  300  2e-80  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.793133  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3847  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  53.56 
 
 
300 aa  300  2e-80  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  8.48753e-62 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2788  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  51.53 
 
 
308 aa  299  3e-80  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0106  succinyl-CoA synthetase (ADP-forming) alpha subunit  50.85 
 
 
291 aa  299  4e-80  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1702  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  51.86 
 
 
293 aa  298  8e-80  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.629716  normal  0.358906 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5544  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  55.1 
 
 
291 aa  298  9e-80  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2498  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  51.71 
 
 
292 aa  298  1e-79  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2222  succinyl-CoA synthase, alpha subunit  54.11 
 
 
290 aa  296  2e-79  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0851667  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2548  succinyl-CoA synthetase (ADP-forming) alpha subunit  52.03 
 
 
290 aa  296  4e-79  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.12229 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00688  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  53.22 
 
 
289 aa  295  5e-79  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2907  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  53.22 
 
 
289 aa  295  5e-79  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.398696  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00677  hypothetical protein  53.22 
 
 
289 aa  295  5e-79  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0755  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  53.22 
 
 
289 aa  295  5e-79  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0741  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  53.22 
 
 
289 aa  295  5e-79  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0821  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  53.22 
 
 
289 aa  295  5e-79  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0648  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  53.22 
 
 
289 aa  295  5e-79  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2927  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  53.22 
 
 
289 aa  295  5e-79  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0776  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  53.22 
 
 
289 aa  295  5e-79  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4348  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  50.85 
 
 
291 aa  294  1e-78  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.265556  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1229  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  52.88 
 
 
289 aa  294  1e-78  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.143875 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1221  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  51.01 
 
 
292 aa  294  1e-78  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0392735  normal  0.972662 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1305  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  53.56 
 
 
302 aa  293  2e-78  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0212377  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1330  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  53.56 
 
 
302 aa  293  2e-78  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.247026  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2512  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  53.61 
 
 
290 aa  293  2e-78  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.498228  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1839  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  53.61 
 
 
290 aa  293  2e-78  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00249209  normal  0.0388751 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2625  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  53.61 
 
 
290 aa  293  2e-78  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000598296  normal  0.140223 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2505  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  53.61 
 
 
290 aa  293  2e-78  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00526313  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0320  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  57.09 
 
 
295 aa  293  3e-78  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.836774  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2811  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  53.61 
 
 
290 aa  292  4e-78  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0439  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  56.61 
 
 
289 aa  292  4e-78  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.551094  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0814  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  54.39 
 
 
302 aa  292  5e-78  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0497664  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004109  succinyl-CoA ligase [ADP-forming] alpha chain  53.58 
 
 
290 aa  291  7e-78  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1840  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  52.92 
 
 
290 aa  291  1e-77  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00135274  normal  0.0561968 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0714  succinyl-CoA ligase, alpha subunit  50.34 
 
 
291 aa  291  1e-77  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000108729  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2180  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  52.92 
 
 
290 aa  291  1e-77  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01358  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  53.24 
 
 
290 aa  290  2e-77  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3485  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  49.83 
 
 
290 aa  290  2e-77  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.622532  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1638  succinyl-CoA synthetase (ADP-forming) alpha subunit  53.74 
 
 
290 aa  290  2e-77  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0190398  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1713  succinyl-CoA synthetase (ADP-forming) alpha subunit  53.74 
 
 
290 aa  290  2e-77  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0303591  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1713  succinyl-CoA synthetase (ADP-forming) alpha subunit  53.74 
 
 
290 aa  290  2e-77  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0092181  normal  0.0855349 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0156  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  49.83 
 
 
290 aa  290  2e-77  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.852217  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>