More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_6507 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013093  Amir_6507  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  100 
 
 
296 aa  582  1.0000000000000001e-165  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3812  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  83.28 
 
 
295 aa  491  9.999999999999999e-139  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7986  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  81.36 
 
 
295 aa  490  1e-137  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4202  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  81.91 
 
 
295 aa  487  1e-137  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.886218  hitchhiker  0.00857355 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4423  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  81.85 
 
 
292 aa  481  1e-135  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.690796  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4220  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  78.64 
 
 
295 aa  481  1e-135  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0061  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  84.59 
 
 
292 aa  481  1e-135  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00177759 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2576  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  84.25 
 
 
292 aa  478  1e-134  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4116  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  82.94 
 
 
312 aa  478  1e-134  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04930  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  79.66 
 
 
295 aa  471  1e-132  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.861039  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07740  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  80.89 
 
 
297 aa  473  1e-132  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.55116  normal  0.434158 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0605  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  78.08 
 
 
295 aa  471  1e-132  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.25955  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1266  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  84.08 
 
 
293 aa  467  1.0000000000000001e-131  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0021014  normal  0.775706 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28150  succinyl-CoA synthetase (ADP-forming) alpha subunit  84.18 
 
 
296 aa  457  1e-127  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1244  succinyl-CoA synthetase (ADP-forming) alpha subunit  78.16 
 
 
291 aa  457  1e-127  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.345661  normal  0.0101551 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3016  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  78.86 
 
 
296 aa  452  1.0000000000000001e-126  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0145094  normal  0.0121594 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0381  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  76.45 
 
 
295 aa  451  1.0000000000000001e-126  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2536  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  82.25 
 
 
292 aa  447  1e-125  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.269234 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09100  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  79.52 
 
 
296 aa  447  1e-125  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0994579  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0655  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  75.17 
 
 
291 aa  447  1.0000000000000001e-124  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.374362 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10970  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  76.33 
 
 
303 aa  445  1.0000000000000001e-124  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.107205  normal  0.560445 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0816  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  76.33 
 
 
300 aa  445  1.0000000000000001e-124  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1866  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  76 
 
 
300 aa  440  9.999999999999999e-123  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0557225 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0672  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  80.81 
 
 
297 aa  439  9.999999999999999e-123  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.267798 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3998  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  73.67 
 
 
299 aa  435  1e-121  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0147811  normal  0.27288 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4706  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  77.93 
 
 
300 aa  435  1e-121  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0728  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  73 
 
 
298 aa  434  1e-121  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4326  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  77.93 
 
 
300 aa  436  1e-121  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4412  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  77.93 
 
 
300 aa  436  1e-121  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  decreased coverage  0.00673609  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1342  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  73.36 
 
 
304 aa  432  1e-120  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.077758  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5979  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  73.56 
 
 
290 aa  431  1e-119  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0361714  normal  0.14161 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4869  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  77.85 
 
 
300 aa  427  1e-119  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.300711 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3310  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  76.67 
 
 
300 aa  428  1e-119  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0933  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  76.67 
 
 
300 aa  422  1e-117  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0652  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  74.24 
 
 
290 aa  423  1e-117  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.413913 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3589  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  74.07 
 
 
297 aa  416  9.999999999999999e-116  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04280  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  78.55 
 
 
306 aa  409  1e-113  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.844796  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0457  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  62.21 
 
 
303 aa  352  2.9999999999999997e-96  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.355464  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1275  succinyl-CoA synthetase (ADP-forming) alpha subunit  55.1 
 
 
292 aa  310  2e-83  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.43914  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1376  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  52.35 
 
 
299 aa  306  2.0000000000000002e-82  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2222  succinyl-CoA synthase, alpha subunit  56.51 
 
 
290 aa  303  2.0000000000000002e-81  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0851667  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3250  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  55.44 
 
 
290 aa  304  2.0000000000000002e-81  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0118943  unclonable  0.0000183638 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004109  succinyl-CoA ligase [ADP-forming] alpha chain  56.66 
 
 
290 aa  303  2.0000000000000002e-81  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1465  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  53.77 
 
 
308 aa  302  4.0000000000000003e-81  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01358  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  56.31 
 
 
290 aa  301  8.000000000000001e-81  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3739  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  55.1 
 
 
290 aa  301  9e-81  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00386146  unclonable  0.000000000321721 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0115  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  53.58 
 
 
291 aa  301  1e-80  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.732037  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1158  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  55.29 
 
 
290 aa  301  1e-80  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2788  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  53.08 
 
 
308 aa  299  3e-80  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0895  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  53.9 
 
 
289 aa  299  3e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0404555  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0772  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  53.9 
 
 
289 aa  299  3e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0862  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  53.9 
 
 
289 aa  299  3e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0472557 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0798  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  53.9 
 
 
289 aa  299  3e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0283915  normal  0.188512 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0833  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  53.56 
 
 
289 aa  298  5e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0260305  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0106  succinyl-CoA synthetase (ADP-forming) alpha subunit  53.58 
 
 
291 aa  298  6e-80  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3658  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  54.23 
 
 
300 aa  298  6e-80  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000316664  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1993  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  54.23 
 
 
300 aa  298  7e-80  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1229  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  53.9 
 
 
289 aa  298  1e-79  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.143875 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3877  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  54.58 
 
 
300 aa  296  2e-79  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000526587  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3686  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  54.58 
 
 
300 aa  296  2e-79  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0387134  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3576  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  54.58 
 
 
300 aa  296  2e-79  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0154825  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3594  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  54.58 
 
 
300 aa  296  2e-79  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.372712  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1100  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  54.58 
 
 
300 aa  296  2e-79  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0979666  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3973  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  54.58 
 
 
300 aa  296  2e-79  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00161204  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1051  succinyl-CoA synthetase alpha subunit  56.27 
 
 
290 aa  296  2e-79  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0859965  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3882  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  54.58 
 
 
300 aa  296  2e-79  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000124479  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2487  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  53.87 
 
 
300 aa  296  2e-79  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000153221  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3933  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  54.58 
 
 
300 aa  296  2e-79  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000608067  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1310  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  54.58 
 
 
300 aa  296  2e-79  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000061731  unclonable  1.5256899999999999e-25 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3847  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  54.58 
 
 
300 aa  296  2e-79  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  8.48753e-62 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5544  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  53.72 
 
 
291 aa  295  4e-79  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01878  Succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  54.79 
 
 
290 aa  296  4e-79  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1430  succinyl-CoA synthetase alpha chain  55.48 
 
 
290 aa  296  4e-79  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.204322  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2548  succinyl-CoA synthetase (ADP-forming) alpha subunit  53.22 
 
 
290 aa  295  5e-79  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.12229 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1658  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  55.67 
 
 
290 aa  295  6e-79  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0294249  normal  0.471073 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2180  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  55.33 
 
 
290 aa  295  6e-79  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1791  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  55.33 
 
 
290 aa  295  7e-79  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.66969  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4348  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  51.88 
 
 
291 aa  295  8e-79  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.265556  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2102  succinyl-CoA synthetase (ADP-forming) alpha subunit  53.92 
 
 
290 aa  295  8e-79  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.174971  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0470  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  54.21 
 
 
293 aa  295  8e-79  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0810  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  52.72 
 
 
288 aa  295  9e-79  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.674167  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00688  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  53.56 
 
 
289 aa  294  1e-78  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2907  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  53.56 
 
 
289 aa  294  1e-78  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.398696  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0648  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  53.56 
 
 
289 aa  294  1e-78  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2183  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  52.01 
 
 
339 aa  294  1e-78  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0776  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  53.56 
 
 
289 aa  294  1e-78  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00677  hypothetical protein  53.56 
 
 
289 aa  294  1e-78  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2927  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  53.56 
 
 
289 aa  294  1e-78  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0741  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  53.56 
 
 
289 aa  294  1e-78  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0821  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  53.56 
 
 
289 aa  294  1e-78  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1041  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  51.19 
 
 
290 aa  294  1e-78  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.201704 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0755  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  53.56 
 
 
289 aa  294  1e-78  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1239  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  53.56 
 
 
290 aa  293  2e-78  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.961959  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3723  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  51.86 
 
 
329 aa  293  2e-78  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.793133  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0714  succinyl-CoA ligase, alpha subunit  51.01 
 
 
291 aa  293  2e-78  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000108729  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0459  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  52.86 
 
 
293 aa  293  2e-78  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1888  succinyl-CoA synthetase (ADP-forming) alpha subunit  54.23 
 
 
292 aa  293  2e-78  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2819  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  54.39 
 
 
296 aa  293  2e-78  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3097  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  53.56 
 
 
290 aa  294  2e-78  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3222  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  50.85 
 
 
290 aa  293  3e-78  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>