More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_0933 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011886  Achl_0933  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  100 
 
 
300 aa  588  1e-167  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0816  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  95.33 
 
 
300 aa  565  1e-160  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1342  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  80.33 
 
 
304 aa  479  1e-134  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.077758  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0728  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  79.67 
 
 
298 aa  474  1e-133  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04280  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  83.55 
 
 
306 aa  461  1e-129  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.844796  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1866  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  78.03 
 
 
300 aa  461  1e-129  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0557225 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4869  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  81.31 
 
 
300 aa  462  1e-129  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.300711 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04930  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  77.33 
 
 
295 aa  455  1e-127  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.861039  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3589  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  80.67 
 
 
297 aa  457  1e-127  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4706  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  79.8 
 
 
300 aa  451  1.0000000000000001e-126  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3310  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  79.67 
 
 
300 aa  453  1.0000000000000001e-126  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10970  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  74.75 
 
 
303 aa  448  1e-125  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.107205  normal  0.560445 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4326  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  79.14 
 
 
300 aa  449  1e-125  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4412  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  79.14 
 
 
300 aa  449  1e-125  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  decreased coverage  0.00673609  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3016  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  74.92 
 
 
296 aa  444  1e-123  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0145094  normal  0.0121594 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3812  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  74.25 
 
 
295 aa  440  9.999999999999999e-123  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4202  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  73.58 
 
 
295 aa  436  1e-121  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.886218  hitchhiker  0.00857355 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4220  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  72.67 
 
 
295 aa  436  1e-121  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4423  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  73.58 
 
 
292 aa  437  1e-121  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.690796  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07740  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  73.42 
 
 
297 aa  432  1e-120  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.55116  normal  0.434158 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0605  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  71 
 
 
295 aa  424  1e-118  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.25955  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7986  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  73 
 
 
295 aa  427  1e-118  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0655  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  73.06 
 
 
291 aa  427  1e-118  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.374362 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09100  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  74.41 
 
 
296 aa  422  1e-117  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0994579  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6507  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  76.67 
 
 
296 aa  422  1e-117  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1244  succinyl-CoA synthetase (ADP-forming) alpha subunit  73.91 
 
 
291 aa  424  1e-117  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.345661  normal  0.0101551 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28150  succinyl-CoA synthetase (ADP-forming) alpha subunit  76.57 
 
 
296 aa  423  1e-117  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0061  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  74.75 
 
 
292 aa  419  1e-116  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00177759 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0672  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  75.08 
 
 
297 aa  419  1e-116  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.267798 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3998  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  71.48 
 
 
299 aa  417  9.999999999999999e-116  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0147811  normal  0.27288 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1266  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  77.55 
 
 
293 aa  416  9.999999999999999e-116  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0021014  normal  0.775706 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2536  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  74.92 
 
 
292 aa  417  9.999999999999999e-116  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.269234 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4116  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  73.15 
 
 
312 aa  414  1e-114  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2576  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  73.74 
 
 
292 aa  412  1e-114  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0381  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  69.36 
 
 
295 aa  405  1.0000000000000001e-112  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5979  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  69 
 
 
290 aa  406  1.0000000000000001e-112  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0361714  normal  0.14161 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0652  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  69 
 
 
290 aa  396  1e-109  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.413913 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0457  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  61.51 
 
 
303 aa  346  2e-94  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.355464  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1376  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  52.84 
 
 
299 aa  301  6.000000000000001e-81  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1702  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  52.17 
 
 
293 aa  300  2e-80  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.629716  normal  0.358906 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3250  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  53.18 
 
 
290 aa  299  5e-80  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0118943  unclonable  0.0000183638 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3723  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  52 
 
 
329 aa  297  1e-79  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.793133  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1840  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  55.07 
 
 
290 aa  298  1e-79  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00135274  normal  0.0561968 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1670  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  55.52 
 
 
290 aa  297  1e-79  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2249  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  55.7 
 
 
290 aa  297  1e-79  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.634912 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3739  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  52.86 
 
 
290 aa  298  1e-79  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00386146  unclonable  0.000000000321721 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0600  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  53.69 
 
 
291 aa  297  2e-79  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0581  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  53.69 
 
 
291 aa  297  2e-79  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1275  succinyl-CoA synthetase (ADP-forming) alpha subunit  52.98 
 
 
292 aa  296  4e-79  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.43914  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1430  succinyl-CoA synthetase alpha chain  54.88 
 
 
290 aa  296  4e-79  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.204322  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1993  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  52.51 
 
 
300 aa  295  5e-79  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2548  succinyl-CoA synthetase (ADP-forming) alpha subunit  53 
 
 
290 aa  295  5e-79  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.12229 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2180  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  54.39 
 
 
290 aa  295  6e-79  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01358  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  54.7 
 
 
290 aa  294  1e-78  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2811  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  54.73 
 
 
290 aa  294  1e-78  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0849  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  54.03 
 
 
290 aa  294  1e-78  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004109  succinyl-CoA ligase [ADP-forming] alpha chain  54.36 
 
 
290 aa  293  2e-78  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1158  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  54.36 
 
 
290 aa  293  2e-78  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3658  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  52.17 
 
 
300 aa  293  3e-78  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000316664  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2819  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  52.67 
 
 
296 aa  293  3e-78  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2222  succinyl-CoA synthase, alpha subunit  54.03 
 
 
290 aa  292  4e-78  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0851667  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2625  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  54.39 
 
 
290 aa  292  4e-78  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000598296  normal  0.140223 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2505  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  54.39 
 
 
290 aa  292  4e-78  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00526313  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1839  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  54.39 
 
 
290 aa  292  4e-78  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00249209  normal  0.0388751 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2512  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  54.39 
 
 
290 aa  292  4e-78  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.498228  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01878  Succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  54.21 
 
 
290 aa  292  5e-78  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1638  succinyl-CoA synthetase (ADP-forming) alpha subunit  54.39 
 
 
290 aa  292  5e-78  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0190398  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1713  succinyl-CoA synthetase (ADP-forming) alpha subunit  54.39 
 
 
290 aa  292  5e-78  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0303591  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1713  succinyl-CoA synthetase (ADP-forming) alpha subunit  54.39 
 
 
290 aa  292  5e-78  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0092181  normal  0.0855349 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3877  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  52.51 
 
 
300 aa  291  6e-78  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000526587  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3847  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  52.51 
 
 
300 aa  291  6e-78  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  8.48753e-62 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3686  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  52.51 
 
 
300 aa  291  6e-78  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0387134  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3576  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  52.51 
 
 
300 aa  291  6e-78  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0154825  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3594  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  52.51 
 
 
300 aa  291  6e-78  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.372712  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3933  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  52.51 
 
 
300 aa  291  6e-78  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000608067  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1310  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  52.51 
 
 
300 aa  291  6e-78  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000061731  unclonable  1.5256899999999999e-25 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3882  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  52.51 
 
 
300 aa  291  6e-78  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000124479  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3973  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  52.51 
 
 
300 aa  291  6e-78  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00161204  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2487  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  52.17 
 
 
300 aa  291  8e-78  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000153221  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1100  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  52.17 
 
 
300 aa  291  1e-77  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0979666  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2796  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  53.36 
 
 
290 aa  290  2e-77  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.623771 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1051  succinyl-CoA synthetase alpha subunit  56.95 
 
 
290 aa  290  2e-77  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0859965  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2266  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  54.39 
 
 
290 aa  290  2e-77  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1802  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  53.02 
 
 
290 aa  290  2e-77  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.155061  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1933  succinyl-CoA synthase, alpha subunit  54.05 
 
 
290 aa  289  3e-77  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0598  succinyl-CoA synthetase alpha chain  51.18 
 
 
294 aa  290  3e-77  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1791  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  54.05 
 
 
290 aa  289  4e-77  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.66969  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0439  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  55.52 
 
 
289 aa  288  6e-77  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.551094  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1658  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  53.38 
 
 
290 aa  288  6e-77  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0294249  normal  0.471073 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00688  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  52.51 
 
 
289 aa  288  8e-77  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2907  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  52.51 
 
 
289 aa  288  8e-77  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.398696  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0648  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  52.51 
 
 
289 aa  288  8e-77  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0776  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  52.51 
 
 
289 aa  288  8e-77  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0821  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  52.51 
 
 
289 aa  288  8e-77  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0755  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  52.51 
 
 
289 aa  288  8e-77  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2927  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  52.51 
 
 
289 aa  288  8e-77  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00677  hypothetical protein  52.51 
 
 
289 aa  288  8e-77  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0115  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  52.01 
 
 
291 aa  288  8e-77  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.732037  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0741  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  52.51 
 
 
289 aa  288  8e-77  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2499  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  53.69 
 
 
295 aa  288  9e-77  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.285546  normal  0.123009 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>