More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_4202 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009953  Sare_4202  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  100 
 
 
295 aa  585  1e-166  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.886218  hitchhiker  0.00857355 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3812  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  97.29 
 
 
295 aa  573  1.0000000000000001e-162  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4220  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  79.86 
 
 
295 aa  485  1e-136  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7986  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  78.23 
 
 
295 aa  477  1e-133  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0605  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  77.13 
 
 
295 aa  474  1e-133  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.25955  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2576  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  82.19 
 
 
292 aa  473  1e-132  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4423  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  78.57 
 
 
292 aa  471  1e-132  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.690796  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6507  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  81.91 
 
 
296 aa  465  9.999999999999999e-131  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0061  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  80.48 
 
 
292 aa  462  1e-129  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00177759 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04930  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  76.87 
 
 
295 aa  461  1e-129  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.861039  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1244  succinyl-CoA synthetase (ADP-forming) alpha subunit  77.55 
 
 
291 aa  459  9.999999999999999e-129  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.345661  normal  0.0101551 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4116  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  78.5 
 
 
312 aa  457  1e-127  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1266  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  81.31 
 
 
293 aa  453  1.0000000000000001e-126  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0021014  normal  0.775706 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0655  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  76.19 
 
 
291 aa  452  1.0000000000000001e-126  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.374362 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07740  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  74.74 
 
 
297 aa  448  1e-125  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.55116  normal  0.434158 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0381  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  76.37 
 
 
295 aa  448  1e-125  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5979  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  76.53 
 
 
290 aa  439  9.999999999999999e-123  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0361714  normal  0.14161 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3998  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  73.24 
 
 
299 aa  437  1e-121  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0147811  normal  0.27288 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3016  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  74.16 
 
 
296 aa  436  1e-121  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0145094  normal  0.0121594 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2536  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  76.19 
 
 
292 aa  432  1e-120  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.269234 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10970  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  73.06 
 
 
303 aa  433  1e-120  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.107205  normal  0.560445 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0816  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  73.49 
 
 
300 aa  431  1e-120  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1866  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  72.48 
 
 
300 aa  429  1e-119  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0557225 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28150  succinyl-CoA synthetase (ADP-forming) alpha subunit  75.84 
 
 
296 aa  428  1e-119  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4326  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  75.17 
 
 
300 aa  429  1e-119  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09100  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  74.06 
 
 
296 aa  428  1e-119  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0994579  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4412  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  75.17 
 
 
300 aa  429  1e-119  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  decreased coverage  0.00673609  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4869  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  74.83 
 
 
300 aa  427  1e-119  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.300711 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1342  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  69.97 
 
 
304 aa  426  1e-118  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.077758  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4706  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  74.5 
 
 
300 aa  426  1e-118  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0728  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  71.57 
 
 
298 aa  427  1e-118  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3310  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  72.91 
 
 
300 aa  422  1e-117  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0652  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  75.85 
 
 
290 aa  423  1e-117  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.413913 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0933  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  73.58 
 
 
300 aa  414  9.999999999999999e-116  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3589  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  72.97 
 
 
297 aa  410  1e-114  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0672  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  73.4 
 
 
297 aa  408  1e-113  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.267798 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04280  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  75 
 
 
306 aa  401  1e-111  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.844796  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0457  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  59.53 
 
 
303 aa  343  1e-93  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.355464  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1376  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  53.22 
 
 
299 aa  315  6e-85  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1041  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  54.27 
 
 
290 aa  310  2e-83  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.201704 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3222  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  53.92 
 
 
290 aa  308  6.999999999999999e-83  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2788  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  53.58 
 
 
308 aa  306  2.0000000000000002e-82  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1465  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  53.24 
 
 
308 aa  306  3e-82  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1275  succinyl-CoA synthetase (ADP-forming) alpha subunit  54.42 
 
 
292 aa  306  3e-82  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.43914  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1993  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  54.77 
 
 
300 aa  302  4.0000000000000003e-81  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3739  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  54.42 
 
 
290 aa  302  5.000000000000001e-81  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00386146  unclonable  0.000000000321721 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3250  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  54.42 
 
 
290 aa  301  9e-81  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0118943  unclonable  0.0000183638 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1100  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  54.77 
 
 
300 aa  300  2e-80  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0979666  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2487  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  55.12 
 
 
300 aa  299  3e-80  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000153221  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0073  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  55.48 
 
 
289 aa  299  4e-80  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2068  succinyl-CoA synthetase (ADP-forming) alpha subunit  51.54 
 
 
296 aa  298  5e-80  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000768235  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4348  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  52.22 
 
 
291 aa  298  6e-80  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.265556  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3485  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  51.88 
 
 
290 aa  298  6e-80  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.622532  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0156  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  51.88 
 
 
290 aa  298  6e-80  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.852217  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1310  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  55.48 
 
 
300 aa  298  8e-80  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000061731  unclonable  1.5256899999999999e-25 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3847  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  55.48 
 
 
300 aa  298  8e-80  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  8.48753e-62 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3877  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  55.48 
 
 
300 aa  298  8e-80  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000526587  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3686  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  55.48 
 
 
300 aa  298  8e-80  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0387134  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3576  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  55.48 
 
 
300 aa  298  8e-80  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0154825  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3594  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  55.48 
 
 
300 aa  298  8e-80  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.372712  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3933  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  55.48 
 
 
300 aa  298  8e-80  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000608067  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3882  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  55.48 
 
 
300 aa  298  8e-80  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000124479  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3973  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  55.48 
 
 
300 aa  298  8e-80  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00161204  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01878  Succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  54.45 
 
 
290 aa  298  1e-79  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0619  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  53.56 
 
 
293 aa  297  1e-79  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.00000000000000506874  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3658  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  54.77 
 
 
300 aa  296  2e-79  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000316664  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0598  succinyl-CoA synthetase alpha chain  54.04 
 
 
294 aa  296  3e-79  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2819  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  54.24 
 
 
296 aa  295  4e-79  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0600  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  54.04 
 
 
291 aa  294  1e-78  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0581  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  54.04 
 
 
291 aa  294  1e-78  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2260  succinyl-CoA synthetase (ADP-forming) alpha subunit  50.51 
 
 
291 aa  294  1e-78  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.237246  hitchhiker  0.0000000231889 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3291  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  52.86 
 
 
293 aa  294  1e-78  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.055129  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1702  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  52.56 
 
 
293 aa  294  1e-78  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.629716  normal  0.358906 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1158  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  52.56 
 
 
290 aa  294  1e-78  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1670  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  54.61 
 
 
290 aa  293  2e-78  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004109  succinyl-CoA ligase [ADP-forming] alpha chain  54.27 
 
 
290 aa  293  2e-78  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0810  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  52.72 
 
 
288 aa  293  2e-78  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.674167  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1556  succinate-CoA ligase (ADP-forming), alpha subunit  53.68 
 
 
294 aa  293  3e-78  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2180  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  57.04 
 
 
290 aa  293  3e-78  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2039  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  52.04 
 
 
291 aa  293  3e-78  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2222  succinyl-CoA synthase, alpha subunit  56.83 
 
 
290 aa  292  4e-78  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0851667  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01358  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  54.27 
 
 
290 aa  292  4e-78  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3874  succinyl-CoA synthetase (ADP-forming) alpha subunit  56.18 
 
 
293 aa  292  4e-78  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0714  succinyl-CoA ligase, alpha subunit  51.36 
 
 
291 aa  292  5e-78  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000108729  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2183  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  54.48 
 
 
339 aa  292  5e-78  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3723  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  51.53 
 
 
329 aa  291  7e-78  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.793133  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1802  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  53.58 
 
 
290 aa  291  8e-78  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.155061  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0849  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  53.92 
 
 
290 aa  291  1e-77  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2405  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  52.51 
 
 
300 aa  290  2e-77  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.861166  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0654  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  52.72 
 
 
293 aa  290  2e-77  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2548  succinyl-CoA synthetase (ADP-forming) alpha subunit  51.51 
 
 
290 aa  290  2e-77  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.12229 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0470  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  52.19 
 
 
293 aa  289  3e-77  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0675  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  52.19 
 
 
293 aa  289  4e-77  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.477108 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1430  succinyl-CoA synthetase alpha chain  53.77 
 
 
290 aa  289  4e-77  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.204322  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5975  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  52.19 
 
 
293 aa  289  5.0000000000000004e-77  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0290439 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1658  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  53.95 
 
 
290 aa  288  5.0000000000000004e-77  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0294249  normal  0.471073 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2037  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  52.19 
 
 
293 aa  289  5.0000000000000004e-77  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2695  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  52.19 
 
 
293 aa  289  5.0000000000000004e-77  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.208552  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2648  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  52.19 
 
 
293 aa  289  5.0000000000000004e-77  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2569  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  52.19 
 
 
293 aa  289  5.0000000000000004e-77  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>