28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BcerKBAB4_2486 on replicon NC_010184
Organism: Bacillus weihenstephanensis KBAB4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010184  BcerKBAB4_2486  penicillin-binding protein  100 
 
 
76 aa  154  5.0000000000000005e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000877671  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2679  penicillin-binding protein  76.47 
 
 
341 aa  114  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2632  penicillin-binding protein  73.53 
 
 
341 aa  110  9e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.149759  decreased coverage  0.000000240236 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2394  penicillin-binding protein  73.13 
 
 
340 aa  109  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.70958  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2469  penicillin-binding protein  73.13 
 
 
340 aa  107  4.0000000000000004e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.242822  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2650  penicillin-binding protein  73.13 
 
 
340 aa  107  4.0000000000000004e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2668  penicillin-binding protein  70.59 
 
 
348 aa  106  9.000000000000001e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00162016 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2433  penicillin-binding protein  71.64 
 
 
340 aa  106  1e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0197006  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2721  penicillin-binding protein  71.64 
 
 
340 aa  105  3e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0897232  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1777  beta-lactamase  51.61 
 
 
343 aa  67  0.00000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00484911  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4043  beta-lactamase  42.37 
 
 
361 aa  52.4  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1551  beta-lactamase  47.92 
 
 
333 aa  51.2  0.000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.345066  normal  0.407276 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37770  penicillin-binding protein, beta-lactamase class C  40.35 
 
 
366 aa  48.1  0.00004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.269534  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0502  beta-lactamase  45.83 
 
 
358 aa  46.2  0.0001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0831  beta-lactamase  37.1 
 
 
422 aa  45.8  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.146809  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2736  beta-lactamase  46.81 
 
 
417 aa  44.3  0.0006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.416885  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13238  penicillin-binding protein, putative  42.86 
 
 
431 aa  43.1  0.001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.652866  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2294  penicillin-binding protein, putative  33.33 
 
 
434 aa  43.5  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.272122  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3731  beta-lactamase  44.68 
 
 
603 aa  43.1  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.227339 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3422  beta-lactamase  44.68 
 
 
593 aa  43.1  0.001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.126074  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0439  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  33.82 
 
 
392 aa  42.7  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.919528 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2881  beta-lactamase  35.09 
 
 
338 aa  42.7  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.74645  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6092  beta-lactamase  40.38 
 
 
419 aa  42.4  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.152854 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3615  beta-lactamase  42.55 
 
 
611 aa  42.4  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0663146 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1906  beta-lactamase  36.51 
 
 
369 aa  42  0.003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2198  beta-lactamase  33.85 
 
 
543 aa  41.2  0.005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.176904  normal  0.0317754 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1783  cyclic peptide transporter  35.38 
 
 
1055 aa  40.4  0.009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0903267  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0500  beta-lactamase  31.75 
 
 
487 aa  40.4  0.009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>