More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_A4920 on replicon NC_007510
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007510  Bcep18194_A4920  DNA-O6-methylguanine--protein-cysteine S-methyltransferase  100 
 
 
197 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4925  DNA-O6-methylguanine--protein-cysteine S-methyltransferase  66.13 
 
 
186 aa  244  8e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2118  AraC family transcriptional regulator  53.22 
 
 
366 aa  178  4.999999999999999e-44  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0669009  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0793  transcriptional regulator, AraC family  56.25 
 
 
376 aa  177  1e-43  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0138198  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3595  Ada regulatory protein  52.33 
 
 
368 aa  175  3e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3365  methylated-DNA-[protein]-cysteine S-methyltransferase  49.43 
 
 
384 aa  172  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0383  ada regulatory protein  50 
 
 
361 aa  172  2.9999999999999996e-42  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0368  ada regulatory protein  49.43 
 
 
361 aa  170  1e-41  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37190  O6-methylguanine-DNA methyltransferase  53.75 
 
 
358 aa  170  1e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0320795  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3190  O6-methylguanine-DNA methyltransferase  53.75 
 
 
358 aa  169  2e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2505  regulatory protein ada  52 
 
 
352 aa  169  2e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.899315  hitchhiker  0.000630655 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2449  regulatory protein ada  52 
 
 
352 aa  169  2e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0458356 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2608  regulatory protein ada  52 
 
 
352 aa  169  2e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.669578 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2401  regulatory protein ada  52 
 
 
352 aa  169  3e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00982046  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4477  AraC family transcriptional regulator  49.13 
 
 
350 aa  168  5e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2491  regulatory protein ada  52.81 
 
 
353 aa  168  5e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1027  transcriptional regulator, AraC family  52.5 
 
 
359 aa  167  6e-41  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2450  transcriptional regulator, AraC family  49.71 
 
 
361 aa  167  8e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4734  DNA-O6-methylguanine--protein-cysteine S-methyltransferase  50 
 
 
240 aa  167  8e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4931  AraC family transcriptional regulator  50 
 
 
354 aa  167  1e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1042  AraC family transcriptional regulator  52.47 
 
 
370 aa  166  2e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.826547  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2570  bifunctional methylated-DNA--protein-cysteine methyltransferase/O-6-methylguanine-DNA transcription regulator  50.87 
 
 
360 aa  166  2e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2856  transcriptional regulator, AraC family  49.13 
 
 
361 aa  165  4e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0727  regulatory protein Ada  50.29 
 
 
354 aa  165  4e-40  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.166972  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4835  transcriptional regulator, AraC family  50.92 
 
 
360 aa  165  4e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0179003  normal  0.379038 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4239  methylated-DNA--protein-cysteine methyltransferase  53.75 
 
 
353 aa  165  4e-40  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.577797  normal  0.120321 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02140  fused DNA-binding transcriptional dual regulator/O6-methylguanine-DNA methyltransferase  50.57 
 
 
354 aa  164  5.9999999999999996e-40  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.581837  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02099  hypothetical protein  50.57 
 
 
354 aa  164  5.9999999999999996e-40  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.592554  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2512  regulatory protein Ada  50 
 
 
354 aa  164  6.9999999999999995e-40  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0107303  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2362  regulatory protein Ada  49.71 
 
 
354 aa  164  6.9999999999999995e-40  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.960218  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3351  regulatory protein Ada  50.29 
 
 
354 aa  164  6.9999999999999995e-40  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.212963  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0476  methylated-DNA--protein-cysteine methyltransferase  49.38 
 
 
361 aa  164  8e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0739  methylated-DNA--protein-cysteine methyltransferase  47.98 
 
 
350 aa  164  9e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1445  transcriptional regulator, AraC family  50 
 
 
354 aa  163  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.29559  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0706  adaptive response regulator protein  47.98 
 
 
350 aa  163  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.998073  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2352  regulatory protein Ada  50 
 
 
354 aa  164  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.970088  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4134  AraC family transcriptional regulator  49.42 
 
 
354 aa  164  1.0000000000000001e-39  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0607807  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1437  AraC family transcriptional regulator  50 
 
 
354 aa  163  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.195699 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0740  AraC family transcriptional regulator  47.98 
 
 
350 aa  163  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3551  AraC family transcriptional regulator  50.62 
 
 
369 aa  163  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0783013  normal  0.874169 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0082  ada regulatory protein  49.12 
 
 
354 aa  162  3e-39  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2938  AraC family transcriptional regulator  48.85 
 
 
357 aa  161  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2162  AraC family transcriptional regulator  52.76 
 
 
306 aa  161  7e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.235913  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3765  bifunctional DNA-binding transcriptional dual regulator/O6-methylguanine-DNA methyltransferase  48.85 
 
 
354 aa  160  8.000000000000001e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0501  transcriptional regulator, AraC family  50 
 
 
374 aa  160  1e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.399439  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2793  DNA-O6-methylguanine--protein-cysteine S-methyltransferase / transcriptional regulator Ada  49.13 
 
 
354 aa  159  3e-38  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.986339  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1536  transcriptional regulator, AraC family  51.25 
 
 
366 aa  158  5e-38  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.26366 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2104  methylated-DNA-(protein)-cysteine S-methyltransferase  53.7 
 
 
211 aa  157  1e-37  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6508  bifunctional DNA-O6-methylguanine--protein-cysteine S-methyltransferase / transcriptional regulator Ada  48.26 
 
 
363 aa  149  2e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000000013299  normal  0.0946299 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3145  AraC family transcriptional regulator  47.13 
 
 
365 aa  149  2e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.0000000198948  unclonable  0.00000000000612342 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4318  methylated-DNA--protein-cysteine methyltransferase  50 
 
 
380 aa  149  3e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.155933  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4482  AraC family transcriptional regulator  46.01 
 
 
401 aa  149  3e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000221745  unclonable  0.0000015212 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3089  AraC family transcriptional regulator  47.13 
 
 
363 aa  149  3e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000000381417  hitchhiker  0.0021619 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4687  transcriptional regulator, AraC family  50 
 
 
361 aa  148  5e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0116  regulatory protein ada (regulatory protein of adaptative response)  44.83 
 
 
364 aa  146  2.0000000000000003e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00000000327978  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3205  AraC family transcriptional regulator  47.09 
 
 
380 aa  146  2.0000000000000003e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.000040374  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0115  ADA regulatory protein  44.25 
 
 
364 aa  145  3e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.0000393468  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0132  ADA regulatory protein  44.25 
 
 
364 aa  145  3e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0622499  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3088  AraC family transcriptional regulator  44.17 
 
 
376 aa  145  3e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000000118536  hitchhiker  0.0000000000000798373 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0085  ADA regulatory protein  44.25 
 
 
364 aa  145  3e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000000000911419  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2249  ADA regulatory protein  44.25 
 
 
364 aa  145  3e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000000255362  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2300  regulatory protein ada (regulatory protein of adaptative response)  44.25 
 
 
364 aa  145  3e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.000121844  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2539  AraC family transcriptional regulator  46.51 
 
 
363 aa  145  3e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.0000057895  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2836  ADA regulatory protein  44.25 
 
 
364 aa  145  3e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000994394  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3152  AraC family transcriptional regulator  46.51 
 
 
363 aa  145  3e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00000475647  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2323  ADA regulatory protein  44.25 
 
 
364 aa  145  3e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  decreased coverage  0.00000161007  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0322  O6-methylguanine-DNA methyltransferase  44.83 
 
 
364 aa  145  4.0000000000000006e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  unclonable  0.00000000161378  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1307  transcriptional regulator, AraC family  49.14 
 
 
357 aa  145  4.0000000000000006e-34  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2772  transcriptional regulator, AraC family  46.88 
 
 
313 aa  144  7.0000000000000006e-34  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.353019  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6249  methylated-DNA/protein- cysteinemethyltransferase  51.41 
 
 
388 aa  144  8.000000000000001e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3171  AraC family transcriptional regulator  45.4 
 
 
363 aa  144  1e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000719173  decreased coverage  0.000000135353 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2566  putative methylated-DNA--protein-cysteine methyltransferase  50.31 
 
 
171 aa  142  2e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3753  transcriptional regulator Ada / DNA-O6-methylguanine--protein-cysteine S-methyltransferase  52.6 
 
 
363 aa  143  2e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.2777  normal  0.322377 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3955  transcriptional regulator, AraC family  44.17 
 
 
391 aa  142  2e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000156521  normal  0.830157 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4048  methylated-DNA--protein-cysteine methyltransferase  49.07 
 
 
241 aa  140  1.9999999999999998e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.785924  normal  0.44527 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0834  DNA-O6-methylguanine--protein-cysteine S-methyltransferase / transcriptional regulator Ada  46.88 
 
 
340 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1325  methylated-DNA--protein-cysteine methyltransferase  41.98 
 
 
175 aa  138  4.999999999999999e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1127  DNA-O6-methylguanine--protein-cysteine S-methyltransferase / transcriptional regulator Ada  51.85 
 
 
351 aa  137  1e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.836162  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46280  Methylated-DNA--(protein)-cysteine S-methyltransferase  52.47 
 
 
355 aa  137  1e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0950  methylated-DNA/protein-cysteine methyltransferase  39.52 
 
 
212 aa  132  3e-30  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.267452  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2956  methylated-DNA--protein-cysteine methyltransferase  43.29 
 
 
303 aa  129  3e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1283  transcriptional regulator Ada / DNA-O6-methylguanine--protein-cysteine S-methyltransferase  42.38 
 
 
344 aa  126  2.0000000000000002e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0991  methylated-DNA/protein- cysteinemethyltransferase  40.49 
 
 
295 aa  124  9e-28  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.275505  normal  0.265908 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2396  transcriptional regulator Ada / DNA-O6-methylguanine--protein-cysteine S-methyltransferase  41.98 
 
 
343 aa  122  4e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1950  transcriptional regulator, AraC family  41.57 
 
 
338 aa  122  4e-27  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2119  methylated-DNA/protein-cysteine methyltransferase  42.67 
 
 
172 aa  121  6e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.025406 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3879  transcriptional regulator Ada / DNA-O6-methylguanine--protein-cysteine S-methyltransferase  40.36 
 
 
293 aa  121  8e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.612619  normal  0.1278 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0891  transcriptional regulator, AraC family  38.69 
 
 
280 aa  112  3e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0866  methylated-DNA--protein-cysteine methyltransferase  37.35 
 
 
280 aa  111  7.000000000000001e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3679  methylated-DNA--protein-cysteine methyltransferase  45.57 
 
 
175 aa  110  1.0000000000000001e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0102541 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2282  AraC family transcriptional regulator  40.74 
 
 
345 aa  108  4.0000000000000004e-23  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0551  methylated-DNA--protein-cysteine methyltransferase  41.88 
 
 
169 aa  108  6e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3470  methylated-DNA--protein-cysteine methyltransferase  36.14 
 
 
280 aa  108  7.000000000000001e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3353  methylated-DNA--protein-cysteine methyltransferase  33.95 
 
 
282 aa  107  1e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2901  methylated-DNA--protein-cysteine methyltransferase  58.33 
 
 
104 aa  107  1e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1031  methylated-DNA/protein-cysteine methyltransferase  48.3 
 
 
204 aa  107  1e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1028  methylated-DNA/protein-cysteine methyltransferase  48.3 
 
 
204 aa  107  1e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1946  AraC family transcriptional regulator  34.29 
 
 
282 aa  105  5e-22  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.609227  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0149  methylated-DNA--protein-cysteine methyltransferase  36.07 
 
 
185 aa  105  5e-22  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11343  methylated-DNA-protein-cysteine methyltransferase ogt  47.12 
 
 
165 aa  105  6e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0121563  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>