More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A4482 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010681  Bphyt_3955  transcriptional regulator, AraC family  86.03 
 
 
391 aa  646    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000156521  normal  0.830157 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4482  AraC family transcriptional regulator  100 
 
 
401 aa  812    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000221745  unclonable  0.0000015212 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3088  AraC family transcriptional regulator  81.79 
 
 
376 aa  573  1.0000000000000001e-162  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000000118536  hitchhiker  0.0000000000000798373 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0116  regulatory protein ada (regulatory protein of adaptative response)  76.59 
 
 
364 aa  541  1e-153  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00000000327978  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2300  regulatory protein ada (regulatory protein of adaptative response)  76.88 
 
 
364 aa  542  1e-153  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.000121844  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0115  ADA regulatory protein  76.88 
 
 
364 aa  542  1e-153  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.0000393468  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0085  ADA regulatory protein  74.3 
 
 
364 aa  543  1e-153  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000000000911419  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2323  ADA regulatory protein  76.88 
 
 
364 aa  542  1e-153  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  decreased coverage  0.00000161007  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2249  ADA regulatory protein  76.88 
 
 
364 aa  542  1e-153  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000000255362  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0132  ADA regulatory protein  76.88 
 
 
364 aa  542  1e-153  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0622499  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2836  ADA regulatory protein  76.88 
 
 
364 aa  542  1e-153  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000994394  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0322  O6-methylguanine-DNA methyltransferase  76.3 
 
 
364 aa  540  9.999999999999999e-153  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  unclonable  0.00000000161378  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6508  bifunctional DNA-O6-methylguanine--protein-cysteine S-methyltransferase / transcriptional regulator Ada  75.43 
 
 
363 aa  533  1e-150  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000000013299  normal  0.0946299 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3089  AraC family transcriptional regulator  76.3 
 
 
363 aa  522  1e-147  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000000381417  hitchhiker  0.0021619 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2539  AraC family transcriptional regulator  76.3 
 
 
363 aa  521  1e-147  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.0000057895  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3205  AraC family transcriptional regulator  76.59 
 
 
380 aa  523  1e-147  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.000040374  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3152  AraC family transcriptional regulator  76.3 
 
 
363 aa  521  1e-147  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00000475647  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3171  AraC family transcriptional regulator  76.3 
 
 
363 aa  520  1e-146  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000719173  decreased coverage  0.000000135353 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3145  AraC family transcriptional regulator  75.22 
 
 
365 aa  519  1e-146  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.0000000198948  unclonable  0.00000000000612342 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02140  fused DNA-binding transcriptional dual regulator/O6-methylguanine-DNA methyltransferase  49.14 
 
 
354 aa  327  3e-88  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.581837  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02099  hypothetical protein  49.14 
 
 
354 aa  327  3e-88  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.592554  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3351  regulatory protein Ada  48.43 
 
 
354 aa  325  6e-88  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.212963  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0793  transcriptional regulator, AraC family  48.56 
 
 
376 aa  325  7e-88  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0138198  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2362  regulatory protein Ada  48.43 
 
 
354 aa  325  9e-88  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.960218  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1445  transcriptional regulator, AraC family  48.57 
 
 
354 aa  324  1e-87  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.29559  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0727  regulatory protein Ada  48.43 
 
 
354 aa  325  1e-87  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.166972  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2352  regulatory protein Ada  48.72 
 
 
354 aa  325  1e-87  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.970088  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1437  AraC family transcriptional regulator  48.29 
 
 
354 aa  323  3e-87  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.195699 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1027  transcriptional regulator, AraC family  48.83 
 
 
359 aa  323  3e-87  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2512  regulatory protein Ada  48.15 
 
 
354 aa  322  9.000000000000001e-87  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0107303  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4239  methylated-DNA--protein-cysteine methyltransferase  47.81 
 
 
353 aa  308  9e-83  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.577797  normal  0.120321 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1042  AraC family transcriptional regulator  51.16 
 
 
370 aa  306  3e-82  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.826547  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0501  transcriptional regulator, AraC family  50.45 
 
 
374 aa  305  1.0000000000000001e-81  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.399439  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0082  ada regulatory protein  44.57 
 
 
354 aa  304  2.0000000000000002e-81  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4134  AraC family transcriptional regulator  44.31 
 
 
354 aa  302  7.000000000000001e-81  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0607807  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1307  transcriptional regulator, AraC family  48.84 
 
 
357 aa  301  1e-80  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0476  methylated-DNA--protein-cysteine methyltransferase  43.71 
 
 
361 aa  298  1e-79  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4835  transcriptional regulator, AraC family  46.54 
 
 
360 aa  297  2e-79  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0179003  normal  0.379038 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2856  transcriptional regulator, AraC family  46.09 
 
 
361 aa  297  2e-79  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0834  DNA-O6-methylguanine--protein-cysteine S-methyltransferase / transcriptional regulator Ada  46.92 
 
 
340 aa  294  2e-78  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2793  DNA-O6-methylguanine--protein-cysteine S-methyltransferase / transcriptional regulator Ada  47.71 
 
 
354 aa  293  4e-78  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.986339  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4477  AraC family transcriptional regulator  47.83 
 
 
350 aa  291  1e-77  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0740  AraC family transcriptional regulator  46.22 
 
 
350 aa  291  2e-77  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1127  DNA-O6-methylguanine--protein-cysteine S-methyltransferase / transcriptional regulator Ada  49.42 
 
 
351 aa  291  2e-77  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.836162  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2396  transcriptional regulator Ada / DNA-O6-methylguanine--protein-cysteine S-methyltransferase  46.33 
 
 
343 aa  290  3e-77  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3765  bifunctional DNA-binding transcriptional dual regulator/O6-methylguanine-DNA methyltransferase  44.73 
 
 
354 aa  290  4e-77  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0739  methylated-DNA--protein-cysteine methyltransferase  45.64 
 
 
350 aa  289  5.0000000000000004e-77  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0383  ada regulatory protein  43.97 
 
 
361 aa  289  6e-77  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2450  transcriptional regulator, AraC family  46.13 
 
 
361 aa  289  6e-77  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2118  AraC family transcriptional regulator  43.73 
 
 
366 aa  288  8e-77  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0669009  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1536  transcriptional regulator, AraC family  45.63 
 
 
366 aa  288  1e-76  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.26366 
 
 
-
 
NC_004310  BR0368  ada regulatory protein  43.68 
 
 
361 aa  288  2e-76  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3365  methylated-DNA-[protein]-cysteine S-methyltransferase  42.78 
 
 
384 aa  287  2e-76  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2938  AraC family transcriptional regulator  44.86 
 
 
357 aa  287  2e-76  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2570  bifunctional methylated-DNA--protein-cysteine methyltransferase/O-6-methylguanine-DNA transcription regulator  46.11 
 
 
360 aa  287  2.9999999999999996e-76  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4931  AraC family transcriptional regulator  44.16 
 
 
354 aa  286  2.9999999999999996e-76  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0706  adaptive response regulator protein  45.64 
 
 
350 aa  286  4e-76  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.998073  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2608  regulatory protein ada  46.65 
 
 
352 aa  285  1.0000000000000001e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.669578 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2491  regulatory protein ada  46.65 
 
 
353 aa  284  2.0000000000000002e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2449  regulatory protein ada  46.65 
 
 
352 aa  283  4.0000000000000003e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0458356 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2505  regulatory protein ada  46.65 
 
 
352 aa  283  4.0000000000000003e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.899315  hitchhiker  0.000630655 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2401  regulatory protein ada  46.36 
 
 
352 aa  282  9e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00982046  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3595  Ada regulatory protein  43.38 
 
 
368 aa  279  5e-74  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2282  AraC family transcriptional regulator  46.94 
 
 
345 aa  278  8e-74  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0991  methylated-DNA/protein- cysteinemethyltransferase  53.43 
 
 
295 aa  278  8e-74  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.275505  normal  0.265908 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4687  transcriptional regulator, AraC family  47.31 
 
 
361 aa  276  6e-73  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3753  transcriptional regulator Ada / DNA-O6-methylguanine--protein-cysteine S-methyltransferase  48.43 
 
 
363 aa  275  7e-73  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.2777  normal  0.322377 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37190  O6-methylguanine-DNA methyltransferase  45.53 
 
 
358 aa  276  7e-73  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0320795  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3551  AraC family transcriptional regulator  47.87 
 
 
369 aa  275  1.0000000000000001e-72  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0783013  normal  0.874169 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4318  methylated-DNA--protein-cysteine methyltransferase  48.1 
 
 
380 aa  274  2.0000000000000002e-72  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.155933  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1283  transcriptional regulator Ada / DNA-O6-methylguanine--protein-cysteine S-methyltransferase  41.18 
 
 
344 aa  274  2.0000000000000002e-72  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3190  O6-methylguanine-DNA methyltransferase  44.44 
 
 
358 aa  269  5.9999999999999995e-71  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46280  Methylated-DNA--(protein)-cysteine S-methyltransferase  47.03 
 
 
355 aa  264  2e-69  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6249  methylated-DNA/protein- cysteinemethyltransferase  42.78 
 
 
388 aa  236  6e-61  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2956  methylated-DNA--protein-cysteine methyltransferase  44.98 
 
 
303 aa  222  9.999999999999999e-57  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2772  transcriptional regulator, AraC family  43.94 
 
 
313 aa  215  8e-55  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.353019  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1950  transcriptional regulator, AraC family  47.01 
 
 
338 aa  214  9.999999999999999e-55  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1108  methylated-DNA/protein-cysteine methyltransferase  33.24 
 
 
348 aa  208  2e-52  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000971871  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0076  adaptative response regulatory protein Ada  39.78 
 
 
273 aa  207  3e-52  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0045  DNA-O6-methylguanine--protein-cysteine S-methyltransferase / transcriptional regulator Ada  35.47 
 
 
348 aa  204  2e-51  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.218349  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0128  methylated-DNA--protein-cysteine methyltransferase  35.17 
 
 
361 aa  201  9.999999999999999e-51  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0019  methylated-DNA/protein-cysteine methyltransferase  37.03 
 
 
360 aa  200  3e-50  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.21113  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0849  ADA regulatory protein  34.1 
 
 
351 aa  195  1e-48  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2162  AraC family transcriptional regulator  45.39 
 
 
306 aa  188  1e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.235913  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2158  transcriptional regulator Ada / DNA-O6-methylguanine--protein-cysteine S-methyltransferase  34.25 
 
 
360 aa  187  3e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.267601  normal  0.69653 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3288  methylated-DNA--protein-cysteine methyltransferase  36.42 
 
 
351 aa  185  1.0000000000000001e-45  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.575953  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0234  methylated-DNA/protein-cysteine methyltransferase  34.21 
 
 
354 aa  185  1.0000000000000001e-45  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0549  transcriptional regulator, AraC family  38.43 
 
 
289 aa  184  2.0000000000000003e-45  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.587181 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1156  hypothetical protein  33.53 
 
 
356 aa  183  5.0000000000000004e-45  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1546  putative methylated-DNA--protein-cysteine methyltransferase  37.61 
 
 
357 aa  183  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.939179  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0889  ada regulatory protein, putative  35 
 
 
350 aa  183  6e-45  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1152  hypothetical protein  33.82 
 
 
356 aa  182  1e-44  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0286  hypothetical protein  31.76 
 
 
352 aa  181  2e-44  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0450605 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3569  DNA-O6-methylguanine--protein-cysteine S-methyltransferase / transcriptional regulator Ada  37.63 
 
 
294 aa  181  2e-44  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3024  ADA regulatory protein  39.55 
 
 
287 aa  181  2e-44  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.697686  normal  0.421668 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3879  transcriptional regulator Ada / DNA-O6-methylguanine--protein-cysteine S-methyltransferase  38.38 
 
 
293 aa  180  2.9999999999999997e-44  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.612619  normal  0.1278 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1493  methylated-DNA--protein-cysteine methyltransferase  38.82 
 
 
276 aa  180  4e-44  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000000302117  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17760  putative methylated-DNA--protein-cysteine methyltransferase  35.8 
 
 
357 aa  180  4e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5050  AraC family transcriptional regulator  40.82 
 
 
293 aa  179  5.999999999999999e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.148414 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1668  transcriptional regulator Ada / DNA-O6-methylguanine--protein-cysteine S-methyltransferase  41.04 
 
 
267 aa  179  7e-44  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.490998  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>