More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_2104 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007484  Noc_2104  methylated-DNA-(protein)-cysteine S-methyltransferase  100 
 
 
211 aa  433  1e-121  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2938  AraC family transcriptional regulator  73.33 
 
 
357 aa  257  1e-67  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2570  bifunctional methylated-DNA--protein-cysteine methyltransferase/O-6-methylguanine-DNA transcription regulator  71.52 
 
 
360 aa  255  3e-67  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37190  O6-methylguanine-DNA methyltransferase  68.1 
 
 
358 aa  247  9e-65  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0320795  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2856  transcriptional regulator, AraC family  67.27 
 
 
361 aa  246  1e-64  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4239  methylated-DNA--protein-cysteine methyltransferase  70.55 
 
 
353 aa  244  8e-64  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.577797  normal  0.120321 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2450  transcriptional regulator, AraC family  66.67 
 
 
361 aa  243  9.999999999999999e-64  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4931  AraC family transcriptional regulator  64.41 
 
 
354 aa  243  9.999999999999999e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3765  bifunctional DNA-binding transcriptional dual regulator/O6-methylguanine-DNA methyltransferase  67.9 
 
 
354 aa  242  3e-63  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0476  methylated-DNA--protein-cysteine methyltransferase  66.67 
 
 
361 aa  242  3e-63  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0706  adaptive response regulator protein  67.5 
 
 
350 aa  241  6e-63  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.998073  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0739  methylated-DNA--protein-cysteine methyltransferase  66.88 
 
 
350 aa  241  7.999999999999999e-63  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4734  DNA-O6-methylguanine--protein-cysteine S-methyltransferase  63.28 
 
 
240 aa  238  4e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3365  methylated-DNA-[protein]-cysteine S-methyltransferase  66.87 
 
 
384 aa  238  6.999999999999999e-62  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0383  ada regulatory protein  65.45 
 
 
361 aa  238  6.999999999999999e-62  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3190  O6-methylguanine-DNA methyltransferase  66.25 
 
 
358 aa  237  1e-61  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0368  ada regulatory protein  64.85 
 
 
361 aa  236  2e-61  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3595  Ada regulatory protein  65.85 
 
 
368 aa  236  2e-61  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0793  transcriptional regulator, AraC family  64.94 
 
 
376 aa  235  3e-61  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0138198  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0740  AraC family transcriptional regulator  65.62 
 
 
350 aa  234  5.0000000000000005e-61  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4134  AraC family transcriptional regulator  65.09 
 
 
354 aa  234  6e-61  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0607807  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0082  ada regulatory protein  64.5 
 
 
354 aa  231  5e-60  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2118  AraC family transcriptional regulator  66.46 
 
 
366 aa  230  9e-60  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0669009  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3551  AraC family transcriptional regulator  64.85 
 
 
369 aa  226  1e-58  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0783013  normal  0.874169 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4477  AraC family transcriptional regulator  64.38 
 
 
350 aa  227  1e-58  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1027  transcriptional regulator, AraC family  55.88 
 
 
359 aa  226  3e-58  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1042  AraC family transcriptional regulator  65.43 
 
 
370 aa  225  4e-58  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.826547  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1536  transcriptional regulator, AraC family  65.62 
 
 
366 aa  224  6e-58  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.26366 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0501  transcriptional regulator, AraC family  58.92 
 
 
374 aa  221  7e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.399439  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3753  transcriptional regulator Ada / DNA-O6-methylguanine--protein-cysteine S-methyltransferase  70.62 
 
 
363 aa  214  5e-55  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.2777  normal  0.322377 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2772  transcriptional regulator, AraC family  61.25 
 
 
313 aa  205  4e-52  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.353019  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46280  Methylated-DNA--(protein)-cysteine S-methyltransferase  66.25 
 
 
355 aa  204  7e-52  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4835  transcriptional regulator, AraC family  61.73 
 
 
360 aa  200  9.999999999999999e-51  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0179003  normal  0.379038 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2162  AraC family transcriptional regulator  59.51 
 
 
306 aa  196  3e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.235913  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0727  regulatory protein Ada  53.57 
 
 
354 aa  190  1e-47  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.166972  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2362  regulatory protein Ada  53.57 
 
 
354 aa  190  1e-47  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.960218  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1307  transcriptional regulator, AraC family  58.18 
 
 
357 aa  190  1e-47  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02140  fused DNA-binding transcriptional dual regulator/O6-methylguanine-DNA methyltransferase  53.57 
 
 
354 aa  189  2e-47  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.581837  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1445  transcriptional regulator, AraC family  53.57 
 
 
354 aa  189  2e-47  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.29559  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2352  regulatory protein Ada  53.57 
 
 
354 aa  190  2e-47  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.970088  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1437  AraC family transcriptional regulator  53.57 
 
 
354 aa  189  2e-47  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.195699 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02099  hypothetical protein  53.57 
 
 
354 aa  189  2e-47  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.592554  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2512  regulatory protein Ada  53.57 
 
 
354 aa  190  2e-47  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0107303  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3351  regulatory protein Ada  53.57 
 
 
354 aa  189  2e-47  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.212963  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2793  DNA-O6-methylguanine--protein-cysteine S-methyltransferase / transcriptional regulator Ada  56.71 
 
 
354 aa  186  2e-46  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.986339  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1127  DNA-O6-methylguanine--protein-cysteine S-methyltransferase / transcriptional regulator Ada  60.12 
 
 
351 aa  184  9e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.836162  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6249  methylated-DNA/protein- cysteinemethyltransferase  63.12 
 
 
388 aa  184  1.0000000000000001e-45  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4318  methylated-DNA--protein-cysteine methyltransferase  61.25 
 
 
380 aa  182  3e-45  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.155933  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4687  transcriptional regulator, AraC family  60.62 
 
 
361 aa  180  1e-44  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4920  DNA-O6-methylguanine--protein-cysteine S-methyltransferase  53.7 
 
 
197 aa  172  2.9999999999999996e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2491  regulatory protein ada  51.19 
 
 
353 aa  169  3e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2505  regulatory protein ada  51.19 
 
 
352 aa  168  5e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.899315  hitchhiker  0.000630655 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2608  regulatory protein ada  51.19 
 
 
352 aa  168  5e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.669578 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2449  regulatory protein ada  51.19 
 
 
352 aa  168  5e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0458356 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2401  regulatory protein ada  51.19 
 
 
352 aa  168  6e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00982046  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0834  DNA-O6-methylguanine--protein-cysteine S-methyltransferase / transcriptional regulator Ada  48.75 
 
 
340 aa  165  4e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3145  AraC family transcriptional regulator  50.3 
 
 
365 aa  165  4e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.0000000198948  unclonable  0.00000000000612342 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4925  DNA-O6-methylguanine--protein-cysteine S-methyltransferase  53.12 
 
 
186 aa  165  5e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6508  bifunctional DNA-O6-methylguanine--protein-cysteine S-methyltransferase / transcriptional regulator Ada  48.5 
 
 
363 aa  164  8e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000000013299  normal  0.0946299 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4048  methylated-DNA--protein-cysteine methyltransferase  52.8 
 
 
241 aa  164  8e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.785924  normal  0.44527 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2566  putative methylated-DNA--protein-cysteine methyltransferase  53.09 
 
 
171 aa  164  9e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2539  AraC family transcriptional regulator  48.21 
 
 
363 aa  162  3e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.0000057895  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3205  AraC family transcriptional regulator  47.31 
 
 
380 aa  162  3e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.000040374  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3152  AraC family transcriptional regulator  48.21 
 
 
363 aa  162  3e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00000475647  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4482  AraC family transcriptional regulator  48.48 
 
 
401 aa  159  2e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000221745  unclonable  0.0000015212 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3088  AraC family transcriptional regulator  47.27 
 
 
376 aa  160  2e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000000118536  hitchhiker  0.0000000000000798373 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3171  AraC family transcriptional regulator  47.62 
 
 
363 aa  159  3e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000719173  decreased coverage  0.000000135353 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3955  transcriptional regulator, AraC family  49.38 
 
 
391 aa  159  4e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000156521  normal  0.830157 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3089  AraC family transcriptional regulator  46.71 
 
 
363 aa  159  4e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000000381417  hitchhiker  0.0021619 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2396  transcriptional regulator Ada / DNA-O6-methylguanine--protein-cysteine S-methyltransferase  48.47 
 
 
343 aa  157  8e-38  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0085  ADA regulatory protein  48.48 
 
 
364 aa  154  8e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000000000911419  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1283  transcriptional regulator Ada / DNA-O6-methylguanine--protein-cysteine S-methyltransferase  44.51 
 
 
344 aa  153  1e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2282  AraC family transcriptional regulator  48.19 
 
 
345 aa  154  1e-36  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1325  methylated-DNA--protein-cysteine methyltransferase  43.37 
 
 
175 aa  152  2.9999999999999998e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0322  O6-methylguanine-DNA methyltransferase  46.67 
 
 
364 aa  149  2e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  unclonable  0.00000000161378  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0116  regulatory protein ada (regulatory protein of adaptative response)  46.67 
 
 
364 aa  149  2e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00000000327978  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2836  ADA regulatory protein  46.06 
 
 
364 aa  149  3e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000994394  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0132  ADA regulatory protein  46.06 
 
 
364 aa  149  3e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0622499  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0115  ADA regulatory protein  46.06 
 
 
364 aa  149  3e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.0000393468  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2249  ADA regulatory protein  46.06 
 
 
364 aa  149  3e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000000255362  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2323  ADA regulatory protein  46.06 
 
 
364 aa  149  3e-35  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  decreased coverage  0.00000161007  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2300  regulatory protein ada (regulatory protein of adaptative response)  46.06 
 
 
364 aa  149  3e-35  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.000121844  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0991  methylated-DNA/protein- cysteinemethyltransferase  45.06 
 
 
295 aa  146  2.0000000000000003e-34  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.275505  normal  0.265908 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0950  methylated-DNA/protein-cysteine methyltransferase  38.61 
 
 
212 aa  140  1.9999999999999998e-32  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.267452  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3679  methylated-DNA--protein-cysteine methyltransferase  46.39 
 
 
175 aa  138  4.999999999999999e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0102541 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2956  methylated-DNA--protein-cysteine methyltransferase  42.86 
 
 
303 aa  137  2e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1950  transcriptional regulator, AraC family  46.3 
 
 
338 aa  134  7.000000000000001e-31  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0076  adaptative response regulatory protein Ada  64.84 
 
 
273 aa  130  2.0000000000000002e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2901  methylated-DNA--protein-cysteine methyltransferase  62.89 
 
 
104 aa  129  5.0000000000000004e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2119  methylated-DNA/protein-cysteine methyltransferase  46.41 
 
 
172 aa  128  8.000000000000001e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.025406 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0551  methylated-DNA--protein-cysteine methyltransferase  44.24 
 
 
169 aa  127  1.0000000000000001e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0891  transcriptional regulator, AraC family  42.41 
 
 
280 aa  118  6e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0866  methylated-DNA--protein-cysteine methyltransferase  41.77 
 
 
280 aa  117  9.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2993  AraC family transcriptional regulator  37.58 
 
 
282 aa  117  9.999999999999999e-26  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3470  methylated-DNA--protein-cysteine methyltransferase  41.77 
 
 
280 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4855  methylated-DNA/protein-cysteine methyltransferase  37.93 
 
 
207 aa  116  3e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2691  DNA-O6-methylguanine--protein-cysteine S-methyltransferase / transcriptional regulator Ada  38.3 
 
 
297 aa  112  4.0000000000000004e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3353  methylated-DNA--protein-cysteine methyltransferase  37.28 
 
 
282 aa  112  5e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1493  methylated-DNA--protein-cysteine methyltransferase  40 
 
 
276 aa  112  6e-24  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000000302117  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3509  methylated-DNA--protein-cysteine methyltransferase  36.99 
 
 
176 aa  111  8.000000000000001e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0199748  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>