209 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_6755 on replicon NC_010512
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010512  Bcenmc03_6755  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  100 
 
 
113 aa  233  6e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.13631  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1539  H-NS histone family protein  66.06 
 
 
109 aa  129  1.0000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.167578  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0040  H-NS histone family protein  66.06 
 
 
109 aa  129  1.0000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1452  H-NS histone family protein  66.06 
 
 
109 aa  129  1.0000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.338045  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1324  H-NS histone family protein  65.14 
 
 
109 aa  128  3e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.392706  n/a   
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6900  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  49.09 
 
 
110 aa  121  4e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6743  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  53.85 
 
 
108 aa  118  1.9999999999999998e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6182  hypothetical protein  55 
 
 
159 aa  114  5e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.633203  normal  0.361807 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5701  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  54.26 
 
 
94 aa  110  5e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5851  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  51.49 
 
 
109 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6089  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  51.49 
 
 
109 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.817977  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6044  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  49.5 
 
 
116 aa  109  2.0000000000000002e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.304642 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6589  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  48.51 
 
 
109 aa  104  3e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.768318  normal  0.0573169 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5743  histone-like nucleoid-structuring protein H-NS  48.51 
 
 
109 aa  104  3e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6107  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  48.51 
 
 
109 aa  104  3e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.525668  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7579  histone-like nucleoid-structuring protein H-NS  47.52 
 
 
109 aa  103  6e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.54905  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3595  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  35.48 
 
 
95 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.137974  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4070  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  35.48 
 
 
95 aa  64.3  0.0000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.000676326  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1833  histone-like nucleoid-structuring protein H-NS  33.66 
 
 
96 aa  63.9  0.0000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.648369  normal  0.932582 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6934  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  38.04 
 
 
96 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.909068  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4285  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  37.89 
 
 
97 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2975  putative H-NS-like transcription regulator  40.62 
 
 
96 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4282  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  34.38 
 
 
100 aa  61.6  0.000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0105949  normal  0.0174683 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2010  H-NS histone family protein  35.05 
 
 
99 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0227527  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2714  DNA-binding protein BprA  31.37 
 
 
111 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.344106  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2825  histone-like nucleoid-structuring protein H-NS  35.79 
 
 
97 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0281  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  35.79 
 
 
97 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.166699  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0263  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  35.79 
 
 
97 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.820493 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0195  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  35.79 
 
 
97 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.750004  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6191  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  39.78 
 
 
102 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.299615  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0209  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  35.79 
 
 
97 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.726678 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3384  histone-like nucleoid-structuring protein H-NS  34.74 
 
 
97 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0190  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  34.74 
 
 
97 aa  57.4  0.00000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.317548  hitchhiker  0.0000000190695 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6777  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  35.48 
 
 
99 aa  57  0.00000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5922  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  38.71 
 
 
102 aa  57  0.00000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.997127  normal  0.678214 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6619  putative HNS-like protein  31.91 
 
 
111 aa  57  0.00000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.890454 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3806  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  35.92 
 
 
100 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0101066  hitchhiker  0.00273603 
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7403  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  33.7 
 
 
96 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3822  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  35.42 
 
 
100 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000137841  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0112  HNS-like transcriptional regulator  35.42 
 
 
100 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000994611  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6084  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  37.11 
 
 
99 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.78955  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS00711  putative HNS-like transcription regulator protein  35.79 
 
 
96 aa  55.1  0.0000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.0000172984  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6005  histone-like nucleoid-structuring protein H-NS  39 
 
 
103 aa  55.5  0.0000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0116  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  36.46 
 
 
100 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6382  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  37.11 
 
 
99 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.193522  normal  0.0275568 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2905  H-NS histone family protein  33.68 
 
 
97 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1636  H-NS histone family protein  33.68 
 
 
97 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.741416  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0048  H-NS histone family protein  33.68 
 
 
125 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3155  H-NS histone family protein  33.68 
 
 
97 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2965  H-NS histone family protein  33.68 
 
 
97 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3827  H-NS histone family protein  33.68 
 
 
97 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3909  H-NS histone family protein  33.68 
 
 
97 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3404  H-NS histone family protein  33.68 
 
 
97 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.237819  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1136  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  33.33 
 
 
104 aa  54.3  0.0000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00265311  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5596  nucleoid protein H-NS  31.37 
 
 
102 aa  53.9  0.0000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.16143  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1239  H-NS histone family protein  33.68 
 
 
96 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  unclonable  0.0000000000958752  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3002  H-NS histone family protein  33.68 
 
 
96 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  unclonable  0.00000000000000136233  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0401  H-NS histone family protein  33.68 
 
 
96 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.000000304691  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2886  H-NS histone family protein  33.68 
 
 
96 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  hitchhiker  0.000145694  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3279  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  38.3 
 
 
97 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0515948 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1551  H-NS histone family protein  33.68 
 
 
96 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000358636  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1739  H-NS histone family protein  33.68 
 
 
96 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  unclonable  0.00000000000000443719  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0132  histone-like nucleoid-structuring protein H-NS  34.69 
 
 
99 aa  53.1  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2207  H-NS histone family protein  33.68 
 
 
96 aa  53.5  0.000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000144624  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3939  histone-like nucleoid-structuring protein H-NS  34.04 
 
 
99 aa  52.8  0.000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0681504  hitchhiker  0.000514453 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6929  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  34.02 
 
 
99 aa  53.5  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.599841  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0843  DNA-binding protein BprA  37.5 
 
 
96 aa  52.8  0.000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.277711  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0099  H-NS histone family protein  32.63 
 
 
101 aa  52.4  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5767  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  33.67 
 
 
99 aa  52.8  0.000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5155  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  33.67 
 
 
97 aa  52  0.000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.336859  normal  0.425922 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2060  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  30.43 
 
 
91 aa  52.4  0.000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0796579  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0867  putative HNS-like transcription regulator protein  36.17 
 
 
96 aa  52  0.000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.139885 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1065  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  31.58 
 
 
98 aa  51.6  0.000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6596  histone-like nucleoid-structuring protein H-NS  36.08 
 
 
96 aa  52  0.000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.540075  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1144  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  31.58 
 
 
98 aa  51.6  0.000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.439674  normal  0.582774 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4465  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  32.56 
 
 
92 aa  52  0.000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.695514  normal  0.126063 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4798  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  34.04 
 
 
96 aa  51.6  0.000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.272454  normal  0.166506 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3721  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  34.04 
 
 
96 aa  51.6  0.000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.00112888  normal  0.513312 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0265  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  32.63 
 
 
98 aa  51.6  0.000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS02004  putative HNS-like transcription regulator protein  37.23 
 
 
95 aa  50.8  0.000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0969964  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0668  H-NS histone family protein  32.5 
 
 
93 aa  51.2  0.000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0958724  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0864  H-NS histone family protein  32.5 
 
 
93 aa  51.2  0.000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0365  H-NS histone family protein  32.63 
 
 
96 aa  51.2  0.000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00000040716  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0175  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  30.21 
 
 
98 aa  51.2  0.000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1784  H-NS histone family protein  32.5 
 
 
93 aa  51.2  0.000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0208  H-NS histone family protein  31.58 
 
 
101 aa  50.8  0.000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00707733  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1623  H-NS histone family protein  32.5 
 
 
93 aa  51.2  0.000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0489  H-NS histone family protein  32.5 
 
 
93 aa  51.2  0.000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.416523  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1616  H-NS histone family protein  31.58 
 
 
101 aa  50.8  0.000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2686  H-NS histone family protein  32.5 
 
 
93 aa  51.2  0.000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0162  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  30.21 
 
 
98 aa  51.2  0.000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.121985  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1601  putative DNA-binding protein  32.5 
 
 
93 aa  51.2  0.000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1386  H-NS histone family protein  32.5 
 
 
93 aa  51.2  0.000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3717  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  28.26 
 
 
136 aa  50.8  0.000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.989758  hitchhiker  0.00118334 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7383  histone-like nucleoid-structuring protein H-NS  36.56 
 
 
102 aa  50.8  0.000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.907507 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4321  putative HNS-like transcriptional regulator  31.96 
 
 
100 aa  50.8  0.000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4934  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  35.35 
 
 
103 aa  50.8  0.000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0126  H-NS histone family protein  31.58 
 
 
101 aa  50.4  0.000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1570  H-NS histone family protein  31.96 
 
 
173 aa  50.4  0.000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  unclonable  0.000000000103893  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2580  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  45.24 
 
 
119 aa  50.1  0.000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.122678  normal  0.024514 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>