199 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_6619 on replicon NC_010553
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010553  BamMC406_6619  putative HNS-like protein  100 
 
 		 111 aa  230  6e-60  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.890454 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6790  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  36.46 
 
 		 111 aa  71.2  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.215652  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1775  H-NS histone family protein  35.05 
 
 		 113 aa  66.2  0.0000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0387422  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0651  H-NS histone family protein  35.05 
 
 		 113 aa  66.2  0.0000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2382  H-NS histone family protein  34.02 
 
 		 113 aa  66.2  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0812  H-NS histone family protein  35.05 
 
 		 113 aa  66.2  0.0000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1093  H-NS histone family protein  35.05 
 
 		 113 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.327135  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1170  H-NS histone family protein  35.05 
 
 		 113 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4935  putative H-NS histon-like DNA-binding protein  34.31 
 
 		 104 aa  62.8  0.000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.529231  normal  0.833407 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2158  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  32.26 
 
 		 96 aa  62.4  0.000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.232102  normal  0.811955 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2010  H-NS histone family protein  34.38 
 
 		 99 aa  61.2  0.000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0227527  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00711  putative HNS-like transcription regulator protein  30.95 
 
 		 96 aa  61.2  0.000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.0000172984  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2975  putative H-NS-like transcription regulator  27.96 
 
 		 96 aa  61.2  0.000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3721  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  32.14 
 
 		 96 aa  60.5  0.000000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.00112888  normal  0.513312 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4798  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  32.14 
 
 		 96 aa  60.5  0.000000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.272454  normal  0.166506 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0116  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  30.53 
 
 		 100 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4285  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  32.29 
 
 		 97 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2714  DNA-binding protein BprA  34.38 
 
 		 111 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.344106  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1065  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  30.85 
 
 		 98 aa  58.5  0.00000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1150  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  29.9 
 
 		 99 aa  58.5  0.00000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1144  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  30.85 
 
 		 98 aa  58.5  0.00000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.439674  normal  0.582774 
 
 
-
 
NC_003296  RS02004  putative HNS-like transcription regulator protein  31.18 
 
 		 95 aa  58.2  0.00000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0969964  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4990  histone-like nucleoid-structuring protein H-NS  31 
 
 		 104 aa  57.4  0.00000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0212879  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6755  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  31.91 
 
 		 113 aa  57  0.00000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.13631  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6382  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  31.58 
 
 		 99 aa  57  0.00000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.193522  normal  0.0275568 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6084  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  31.58 
 
 		 99 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.78955  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6005  histone-like nucleoid-structuring protein H-NS  33.33 
 
 		 103 aa  55.8  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6934  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  26.88 
 
 		 96 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.909068  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0088  DNA-binding protein BprA  32.98 
 
 		 101 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0199  H-NS histone family protein  34.41 
 
 		 97 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.453548  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1558  H-NS histone family protein  34.62 
 
 		 131 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.752713  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3224  DNA-binding protein BprA  32.98 
 
 		 101 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0099  H-NS histone family protein  34.04 
 
 		 101 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2204  BphA  31.91 
 
 		 151 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.322036  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0208  H-NS histone family protein  32.98 
 
 		 101 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00707733  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1616  H-NS histone family protein  32.98 
 
 		 101 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0171  H-NS histone family protein  28.04 
 
 		 128 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.854986  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1226  histone-like nucleoid-structuring protein H-NS  32.98 
 
 		 114 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.204671  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0260  H-NS histone family protein  28.04 
 
 		 128 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1635  H-NS histone family protein  33.33 
 
 		 97 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.749854  n/a   
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7403  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  33.7 
 
 		 96 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0867  putative HNS-like transcription regulator protein  27.38 
 
 		 96 aa  54.7  0.0000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.139885 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0126  H-NS histone family protein  32.98 
 
 		 101 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3585  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  27.72 
 
 		 191 aa  53.5  0.0000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3476  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  27.84 
 
 		 97 aa  53.5  0.0000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.634664  normal  1 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6900  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  32.93 
 
 		 110 aa  53.9  0.0000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1570  H-NS histone family protein  30.21 
 
 		 173 aa  53.5  0.0000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  unclonable  0.000000000103893  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0401  H-NS histone family protein  30.59 
 
 		 96 aa  53.5  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.000000304691  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0068  H-NS histone family protein  30.21 
 
 		 99 aa  53.5  0.000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  unclonable  0.00000000181219  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2886  H-NS histone family protein  30.59 
 
 		 96 aa  53.5  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  hitchhiker  0.000145694  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1239  H-NS histone family protein  30.59 
 
 		 96 aa  53.5  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  unclonable  0.0000000000958752  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0263  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  28.12 
 
 		 97 aa  52.8  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.820493 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2207  H-NS histone family protein  30.59 
 
 		 96 aa  53.1  0.000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000144624  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2825  histone-like nucleoid-structuring protein H-NS  28.12 
 
 		 97 aa  52.8  0.000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6044  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  28.04 
 
 		 116 aa  53.1  0.000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.304642 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0098  H-NS histone family protein  30.21 
 
 		 108 aa  53.5  0.000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  unclonable  0.00000000000000405362  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3002  H-NS histone family protein  30.59 
 
 		 96 aa  53.5  0.000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  unclonable  0.00000000000000136233  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0281  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  28.12 
 
 		 97 aa  52.8  0.000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.166699  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0079  H-NS histone family protein  30.21 
 
 		 108 aa  53.5  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  unclonable  0.0000151227  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4714  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  30.61 
 
 		 98 aa  53.1  0.000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.991534  normal  0.729946 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1225  H-NS histone family protein  30.21 
 
 		 99 aa  53.5  0.000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000571024  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1551  H-NS histone family protein  30.59 
 
 		 96 aa  53.5  0.000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000358636  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1506  H-NS histone family protein  30.21 
 
 		 108 aa  53.5  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  unclonable  0.00000000000000220305  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1739  H-NS histone family protein  30.59 
 
 		 96 aa  53.5  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  unclonable  0.00000000000000443719  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4321  putative HNS-like transcriptional regulator  28.42 
 
 		 100 aa  52.4  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5562  histone-like nucleoid-structuring protein H-NS  26.73 
 
 		 104 aa  52.4  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3493  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  29.81 
 
 		 113 aa  52.4  0.000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.572012  normal  0.600215 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0838  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  31.58 
 
 		 94 aa  52.8  0.000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0398  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  28.42 
 
 		 100 aa  52.8  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0864  H-NS histone family protein  32.63 
 
 		 93 aa  51.6  0.000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1623  H-NS histone family protein  32.63 
 
 		 93 aa  51.6  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1784  H-NS histone family protein  32.63 
 
 		 93 aa  51.6  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3384  histone-like nucleoid-structuring protein H-NS  27.08 
 
 		 97 aa  51.6  0.000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0209  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  27.08 
 
 		 97 aa  51.6  0.000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.726678 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2686  H-NS histone family protein  32.63 
 
 		 93 aa  52  0.000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6777  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  33.67 
 
 		 99 aa  52  0.000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0195  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  27.08 
 
 		 97 aa  51.6  0.000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.750004  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0668  H-NS histone family protein  32.63 
 
 		 93 aa  51.6  0.000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0958724  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1386  H-NS histone family protein  32.63 
 
 		 93 aa  51.6  0.000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1601  putative DNA-binding protein  32.63 
 
 		 93 aa  51.6  0.000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0265  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  29.47 
 
 		 98 aa  52  0.000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0489  H-NS histone family protein  32.63 
 
 		 93 aa  51.6  0.000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.416523  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1136  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  28.97 
 
 		 104 aa  51.6  0.000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00265311  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4282  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  35.35 
 
 		 100 aa  51.2  0.000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0105949  normal  0.0174683 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6191  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  37.5 
 
 		 102 aa  51.2  0.000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.299615  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5743  histone-like nucleoid-structuring protein H-NS  31.91 
 
 		 109 aa  50.8  0.000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6107  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  31.91 
 
 		 109 aa  50.8  0.000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.525668  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6589  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  31.91 
 
 		 109 aa  50.8  0.000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.768318  normal  0.0573169 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5922  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  37.5 
 
 		 102 aa  50.4  0.000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.997127  normal  0.678214 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4465  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  29.67 
 
 		 92 aa  50.8  0.000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.695514  normal  0.126063 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4689  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  31.08 
 
 		 92 aa  50.8  0.000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0365  H-NS histone family protein  29.41 
 
 		 96 aa  50.4  0.000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00000040716  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5851  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  31 
 
 		 109 aa  50.4  0.000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6089  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  31 
 
 		 109 aa  50.4  0.000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.817977  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0190  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  27.08 
 
 		 97 aa  50.4  0.000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.317548  hitchhiker  0.0000000190695 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3595  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  58.82 
 
 		 95 aa  50.4  0.000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.137974  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4128  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  26.88 
 
 		 95 aa  50.4  0.000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.382519  hitchhiker  0.00000000510411 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1913  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  26.88 
 
 		 95 aa  50.4  0.000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000183319 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1247  H-NS histone family protein  31.82 
 
 		 96 aa  50.1  0.00001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2442  H-NS histone family protein  35.71 
 
 		 131 aa  50.1  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>