216 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_5851 on replicon NC_010557
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010557  BamMC406_5851  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  100 
 
 		 109 aa  218  1.9999999999999999e-56  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6089  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  100 
 
 		 109 aa  218  1.9999999999999999e-56  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.817977  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7579  histone-like nucleoid-structuring protein H-NS  96.33 
 
 		 109 aa  213  7e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.54905  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5743  histone-like nucleoid-structuring protein H-NS  94.5 
 
 		 109 aa  210  5.999999999999999e-54  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6107  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  94.5 
 
 		 109 aa  210  5.999999999999999e-54  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.525668  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6589  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  94.5 
 
 		 109 aa  210  5.999999999999999e-54  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.768318  normal  0.0573169 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6044  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  92.66 
 
 		 116 aa  207  5e-53  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.304642 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6743  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  60.75 
 
 		 108 aa  138  3e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6900  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  61.17 
 
 		 110 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6182  hypothetical protein  52.83 
 
 		 159 aa  122  1e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.633203  normal  0.361807 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5701  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  59.14 
 
 		 94 aa  120  5e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6755  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  51.49 
 
 		 113 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.13631  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1324  H-NS histone family protein  50 
 
 		 109 aa  91.7  3e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.392706  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0040  H-NS histone family protein  49.52 
 
 		 109 aa  89.7  1e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1452  H-NS histone family protein  49.52 
 
 		 109 aa  89.7  1e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.338045  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1539  H-NS histone family protein  49.52 
 
 		 109 aa  89.7  1e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.167578  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3717  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  40.62 
 
 		 136 aa  71.2  0.000000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.989758  hitchhiker  0.00118334 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4465  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  44.05 
 
 		 92 aa  67.8  0.00000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.695514  normal  0.126063 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3595  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  39.13 
 
 		 95 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.137974  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4070  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  39.13 
 
 		 95 aa  64.3  0.0000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.000676326  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2975  putative H-NS-like transcription regulator  36.56 
 
 		 96 aa  63.9  0.0000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6934  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  36.56 
 
 		 96 aa  63.5  0.0000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.909068  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0864  H-NS histone family protein  42.17 
 
 		 93 aa  61.6  0.000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1784  H-NS histone family protein  42.17 
 
 		 93 aa  61.6  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1601  putative DNA-binding protein  42.17 
 
 		 93 aa  61.6  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1623  H-NS histone family protein  42.17 
 
 		 93 aa  61.6  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2686  H-NS histone family protein  42.17 
 
 		 93 aa  61.6  0.000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0489  H-NS histone family protein  42.17 
 
 		 93 aa  61.6  0.000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.416523  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1386  H-NS histone family protein  42.17 
 
 		 93 aa  61.6  0.000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0668  H-NS histone family protein  42.17 
 
 		 93 aa  61.6  0.000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0958724  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1833  histone-like nucleoid-structuring protein H-NS  36.96 
 
 		 96 aa  61.6  0.000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.648369  normal  0.932582 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4285  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  36.26 
 
 		 97 aa  61.2  0.000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1065  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  34.69 
 
 		 98 aa  60.8  0.000000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1144  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  34.69 
 
 		 98 aa  60.8  0.000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.439674  normal  0.582774 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1616  H-NS histone family protein  36.08 
 
 		 101 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0208  H-NS histone family protein  36.08 
 
 		 101 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00707733  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2010  H-NS histone family protein  35.79 
 
 		 99 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0227527  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0126  H-NS histone family protein  36.08 
 
 		 101 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3822  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  36.46 
 
 		 100 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000137841  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0099  H-NS histone family protein  35.05 
 
 		 101 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0112  HNS-like transcriptional regulator  36.46 
 
 		 100 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000994611  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1968  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  34.74 
 
 		 93 aa  57.8  0.00000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2580  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  34.44 
 
 		 119 aa  57  0.00000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.122678  normal  0.024514 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0088  DNA-binding protein BprA  35.05 
 
 		 101 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0843  DNA-binding protein BprA  39.13 
 
 		 96 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.277711  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3224  DNA-binding protein BprA  35.05 
 
 		 101 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2207  H-NS histone family protein  36.26 
 
 		 96 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000144624  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2714  DNA-binding protein BprA  32.29 
 
 		 111 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.344106  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4282  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  37.23 
 
 		 100 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0105949  normal  0.0174683 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0401  H-NS histone family protein  36.26 
 
 		 96 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.000000304691  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2220  H-NS histone family protein  36.84 
 
 		 102 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.999721  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1239  H-NS histone family protein  36.26 
 
 		 96 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  unclonable  0.0000000000958752  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3002  H-NS histone family protein  36.26 
 
 		 96 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  unclonable  0.00000000000000136233  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2886  H-NS histone family protein  36.26 
 
 		 96 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  hitchhiker  0.000145694  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1551  H-NS histone family protein  36.26 
 
 		 96 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000358636  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1739  H-NS histone family protein  36.26 
 
 		 96 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  unclonable  0.00000000000000443719  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3351  histone-like nucleoid-structuring protein H-NS  32.99 
 
 		 98 aa  55.1  0.0000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.383074 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1226  histone-like nucleoid-structuring protein H-NS  30.61 
 
 		 114 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.204671  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6191  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  29 
 
 		 102 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.299615  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0199  H-NS histone family protein  33.33 
 
 		 97 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.453548  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5922  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  29 
 
 		 102 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.997127  normal  0.678214 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0260  H-NS histone family protein  32.18 
 
 		 128 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0365  H-NS histone family protein  36.26 
 
 		 96 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00000040716  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0175  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  31.96 
 
 		 98 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1635  H-NS histone family protein  32.18 
 
 		 97 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.749854  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0171  H-NS histone family protein  32.18 
 
 		 128 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.854986  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6777  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  32.97 
 
 		 99 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0162  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  31.96 
 
 		 98 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.121985  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2867  H-NS histone family protein  30.93 
 
 		 98 aa  53.9  0.0000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3943  H-NS histone family protein  30.93 
 
 		 98 aa  53.9  0.0000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0084  H-NS histone family protein  30.93 
 
 		 98 aa  53.9  0.0000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3109  H-NS histone family protein  30.93 
 
 		 98 aa  53.9  0.0000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1677  H-NS histone family protein  30.93 
 
 		 98 aa  53.9  0.0000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3862  H-NS histone family protein  30.93 
 
 		 98 aa  53.9  0.0000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3442  H-NS histone family protein  30.93 
 
 		 98 aa  53.9  0.0000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0843  H-NS histone family protein  44.78 
 
 		 114 aa  53.5  0.0000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1753  H-NS histone family protein  44.78 
 
 		 114 aa  53.5  0.0000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0231  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  32.99 
 
 		 98 aa  53.5  0.0000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1593  H-NS histone family protein  44.78 
 
 		 114 aa  53.5  0.0000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.198882  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2858  histone-like nucleoid-structuring protein H-NS  32.99 
 
 		 98 aa  53.5  0.0000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.259744  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0646  H-NS histone family protein  44.78 
 
 		 114 aa  53.5  0.0000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.406819  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0249  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  32.99 
 
 		 98 aa  53.5  0.0000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0510  H-NS histone family protein  44.78 
 
 		 114 aa  53.5  0.0000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.403335  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1364  H-NS histone family protein  44.78 
 
 		 114 aa  53.5  0.0000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0759669  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00711  putative HNS-like transcription regulator protein  36.46 
 
 		 96 aa  52.8  0.000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.0000172984  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6382  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  35.48 
 
 		 99 aa  53.1  0.000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.193522  normal  0.0275568 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1568  H-NS histone family protein  44.78 
 
 		 114 aa  53.5  0.000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.115952  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1529  DNA-binding protein BprA  35.87 
 
 		 96 aa  52.4  0.000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0755  H-NS histone family protein  35.87 
 
 		 100 aa  52.4  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0220992  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5596  nucleoid protein H-NS  29.59 
 
 		 102 aa  52.4  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.16143  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0569  HNS-like transcription regulator protein  35.87 
 
 		 100 aa  52.4  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.147609  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6084  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  35.48 
 
 		 99 aa  52.8  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.78955  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7383  histone-like nucleoid-structuring protein H-NS  29.9 
 
 		 102 aa  52.8  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.907507 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0132  histone-like nucleoid-structuring protein H-NS  35.11 
 
 		 99 aa  52.8  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2072  H-NS histone family protein  35.87 
 
 		 96 aa  52.8  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2160  DNA-binding protein BprA  35.87 
 
 		 96 aa  52.4  0.000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0838  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  30.43 
 
 		 94 aa  52  0.000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2075  DNA-binding protein BprA  35.87 
 
 		 100 aa  52.4  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0585602  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3476  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  32.63 
 
 		 97 aa  52  0.000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.634664  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0158  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  31.96 
 
 		 98 aa  52  0.000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>