219 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1710b_A0040 on replicon NC_007435
Organism: Burkholderia pseudomallei 1710b



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007435  BURPS1710b_A0040  H-NS histone family protein  100 
 
 
109 aa  221  2e-57  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1452  H-NS histone family protein  100 
 
 
109 aa  221  2e-57  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.338045  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1539  H-NS histone family protein  100 
 
 
109 aa  221  2e-57  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.167578  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1324  H-NS histone family protein  98.17 
 
 
109 aa  219  9.999999999999999e-57  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.392706  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6755  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  66.06 
 
 
113 aa  147  4e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.13631  normal 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6182  hypothetical protein  59.05 
 
 
159 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.633203  normal  0.361807 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6743  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  57.01 
 
 
108 aa  124  6e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6900  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  50.46 
 
 
110 aa  120  7e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5701  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  58.51 
 
 
94 aa  112  1.0000000000000001e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6089  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  49.06 
 
 
109 aa  110  8.000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.817977  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5851  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  49.06 
 
 
109 aa  110  8.000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6044  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  49.07 
 
 
116 aa  110  9e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.304642 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5743  histone-like nucleoid-structuring protein H-NS  49.53 
 
 
109 aa  107  7.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6107  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  49.53 
 
 
109 aa  107  7.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.525668  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6589  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  49.53 
 
 
109 aa  107  7.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.768318  normal  0.0573169 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7579  histone-like nucleoid-structuring protein H-NS  47.66 
 
 
109 aa  105  2e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.54905  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0112  HNS-like transcriptional regulator  36.46 
 
 
100 aa  71.2  0.000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000994611  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3822  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  36.46 
 
 
100 aa  70.9  0.000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000137841  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1833  histone-like nucleoid-structuring protein H-NS  34.41 
 
 
96 aa  70.9  0.000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.648369  normal  0.932582 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3595  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  34.41 
 
 
95 aa  67.8  0.00000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.137974  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4070  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  34.41 
 
 
95 aa  67.4  0.00000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.000676326  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6934  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  40.45 
 
 
96 aa  67  0.00000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.909068  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4285  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  38.38 
 
 
97 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2060  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  40.62 
 
 
91 aa  65.1  0.0000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0796579  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3279  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  41.3 
 
 
97 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0515948 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1136  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  36.73 
 
 
104 aa  64.7  0.0000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00265311  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5596  nucleoid protein H-NS  37.37 
 
 
102 aa  64.3  0.0000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.16143  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2010  H-NS histone family protein  39.74 
 
 
99 aa  64.3  0.0000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0227527  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2975  putative H-NS-like transcription regulator  37.5 
 
 
96 aa  63.9  0.0000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2867  H-NS histone family protein  32.29 
 
 
98 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3943  H-NS histone family protein  32.29 
 
 
98 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0084  H-NS histone family protein  32.29 
 
 
98 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3862  H-NS histone family protein  32.29 
 
 
98 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3109  H-NS histone family protein  32.29 
 
 
98 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1677  H-NS histone family protein  32.29 
 
 
98 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3442  H-NS histone family protein  32.29 
 
 
98 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0838  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  35.42 
 
 
94 aa  63.2  0.000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0263  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  39.39 
 
 
97 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.820493 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2825  histone-like nucleoid-structuring protein H-NS  39.39 
 
 
97 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0195  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  39.39 
 
 
97 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.750004  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0209  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  39.39 
 
 
97 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.726678 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0281  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  39.39 
 
 
97 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.166699  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4465  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  37.11 
 
 
92 aa  62  0.000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.695514  normal  0.126063 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2207  H-NS histone family protein  38.04 
 
 
96 aa  62  0.000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000144624  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2580  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  36.26 
 
 
119 aa  62  0.000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.122678  normal  0.024514 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0190  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  38.38 
 
 
97 aa  61.2  0.000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.317548  hitchhiker  0.0000000190695 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3384  histone-like nucleoid-structuring protein H-NS  38.38 
 
 
97 aa  61.6  0.000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0132  histone-like nucleoid-structuring protein H-NS  38.95 
 
 
99 aa  61.2  0.000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3677  histone-like nucleoid-structuring protein H-NS  36.36 
 
 
102 aa  61.6  0.000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.166379 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0867  putative HNS-like transcription regulator protein  46.84 
 
 
96 aa  60.8  0.000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.139885 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2905  H-NS histone family protein  35.35 
 
 
97 aa  60.8  0.000000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2965  H-NS histone family protein  35.35 
 
 
97 aa  60.8  0.000000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3827  H-NS histone family protein  35.35 
 
 
97 aa  60.8  0.000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3155  H-NS histone family protein  35.35 
 
 
97 aa  60.8  0.000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1636  H-NS histone family protein  35.35 
 
 
97 aa  60.8  0.000000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.741416  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3404  H-NS histone family protein  35.35 
 
 
97 aa  60.8  0.000000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.237819  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3909  H-NS histone family protein  35.35 
 
 
97 aa  60.8  0.000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1739  H-NS histone family protein  36.96 
 
 
96 aa  60.8  0.000000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  unclonable  0.00000000000000443719  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0048  H-NS histone family protein  35.35 
 
 
125 aa  60.5  0.000000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1239  H-NS histone family protein  36.96 
 
 
96 aa  60.8  0.000000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  unclonable  0.0000000000958752  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3002  H-NS histone family protein  36.96 
 
 
96 aa  60.8  0.000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  unclonable  0.00000000000000136233  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2886  H-NS histone family protein  36.96 
 
 
96 aa  60.8  0.000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  hitchhiker  0.000145694  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0401  H-NS histone family protein  36.96 
 
 
96 aa  60.8  0.000000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.000000304691  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1551  H-NS histone family protein  36.96 
 
 
96 aa  60.8  0.000000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000358636  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1226  histone-like nucleoid-structuring protein H-NS  33.67 
 
 
114 aa  60.5  0.000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.204671  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1616  H-NS histone family protein  37.11 
 
 
101 aa  60.5  0.000000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0208  H-NS histone family protein  37.11 
 
 
101 aa  60.5  0.000000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00707733  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2714  DNA-binding protein BprA  34.34 
 
 
111 aa  60.5  0.000000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.344106  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0099  H-NS histone family protein  36.08 
 
 
101 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0126  H-NS histone family protein  37.11 
 
 
101 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5335  histone-like nucleoid-structuring protein H-NS  37.62 
 
 
101 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4746  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  37.62 
 
 
101 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.587516  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5527  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  37.62 
 
 
101 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.645148  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0365  H-NS histone family protein  36.96 
 
 
96 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00000040716  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3476  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  33 
 
 
97 aa  58.9  0.00000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.634664  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2981  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  38.36 
 
 
100 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.207499  decreased coverage  0.0000000417224 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0088  DNA-binding protein BprA  36.08 
 
 
101 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3224  DNA-binding protein BprA  36.08 
 
 
101 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4282  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  31.91 
 
 
100 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0105949  normal  0.0174683 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3717  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  33.72 
 
 
136 aa  57.8  0.00000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.989758  hitchhiker  0.00118334 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2158  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  31.63 
 
 
96 aa  57.4  0.00000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.232102  normal  0.811955 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1065  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  30.77 
 
 
98 aa  57  0.00000009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1144  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  30.77 
 
 
98 aa  57  0.00000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.439674  normal  0.582774 
 
 
-
 
NC_003296  RS02004  putative HNS-like transcription regulator protein  41.46 
 
 
95 aa  56.6  0.0000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0969964  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6005  histone-like nucleoid-structuring protein H-NS  44.05 
 
 
103 aa  56.6  0.0000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4689  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  39.74 
 
 
92 aa  56.6  0.0000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1150  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  32.22 
 
 
99 aa  56.6  0.0000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0864  H-NS histone family protein  33.75 
 
 
93 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0489  H-NS histone family protein  33.75 
 
 
93 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.416523  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1784  H-NS histone family protein  33.75 
 
 
93 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0668  H-NS histone family protein  33.75 
 
 
93 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0958724  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1623  H-NS histone family protein  33.75 
 
 
93 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2686  H-NS histone family protein  33.75 
 
 
93 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1601  putative DNA-binding protein  33.75 
 
 
93 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3493  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  33.01 
 
 
113 aa  56.2  0.0000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.572012  normal  0.600215 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1386  H-NS histone family protein  33.75 
 
 
93 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0116  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  34.62 
 
 
100 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3939  histone-like nucleoid-structuring protein H-NS  32.99 
 
 
99 aa  55.1  0.0000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0681504  hitchhiker  0.000514453 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3806  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  35.35 
 
 
100 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0101066  hitchhiker  0.00273603 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4886  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  33.03 
 
 
114 aa  54.3  0.0000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.602991  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>