193 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_C7579 on replicon NC_007509
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007509  Bcep18194_C7579  histone-like nucleoid-structuring protein H-NS  100 
 
 
109 aa  218  1.9999999999999999e-56  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.54905  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6089  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  96.33 
 
 
109 aa  213  7e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.817977  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5851  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  96.33 
 
 
109 aa  213  7e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6589  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  96.33 
 
 
109 aa  213  8e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.768318  normal  0.0573169 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5743  histone-like nucleoid-structuring protein H-NS  96.33 
 
 
109 aa  213  8e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6107  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  96.33 
 
 
109 aa  213  8e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.525668  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6044  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  90.83 
 
 
116 aa  204  4e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.304642 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6743  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  58.88 
 
 
108 aa  134  4e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6900  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  61.17 
 
 
110 aa  133  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6182  hypothetical protein  53.77 
 
 
159 aa  123  7e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.633203  normal  0.361807 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5701  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  56.99 
 
 
94 aa  116  7.999999999999999e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6755  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  47.52 
 
 
113 aa  103  6e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.13631  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1324  H-NS histone family protein  47.17 
 
 
109 aa  87.4  6e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.392706  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0040  H-NS histone family protein  47.66 
 
 
109 aa  85.5  2e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1452  H-NS histone family protein  47.66 
 
 
109 aa  85.5  2e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.338045  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1539  H-NS histone family protein  47.66 
 
 
109 aa  85.5  2e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.167578  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3717  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  37.5 
 
 
136 aa  65.5  0.0000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.989758  hitchhiker  0.00118334 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4465  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  41.67 
 
 
92 aa  64.7  0.0000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.695514  normal  0.126063 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3595  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  38.37 
 
 
95 aa  60.1  0.000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.137974  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1065  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  33.67 
 
 
98 aa  60.1  0.00000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1144  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  33.67 
 
 
98 aa  60.1  0.00000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.439674  normal  0.582774 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0864  H-NS histone family protein  39.76 
 
 
93 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0668  H-NS histone family protein  39.76 
 
 
93 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0958724  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1784  H-NS histone family protein  39.76 
 
 
93 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2686  H-NS histone family protein  39.76 
 
 
93 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1623  H-NS histone family protein  39.76 
 
 
93 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4070  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  38.37 
 
 
95 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.000676326  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1386  H-NS histone family protein  39.76 
 
 
93 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0489  H-NS histone family protein  39.76 
 
 
93 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.416523  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1601  putative DNA-binding protein  39.76 
 
 
93 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6934  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  33.33 
 
 
96 aa  58.2  0.00000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.909068  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2975  putative H-NS-like transcription regulator  33.33 
 
 
96 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1833  histone-like nucleoid-structuring protein H-NS  36.05 
 
 
96 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.648369  normal  0.932582 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0126  H-NS histone family protein  34.02 
 
 
101 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4285  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  32.97 
 
 
97 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0208  H-NS histone family protein  34.02 
 
 
101 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00707733  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1968  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  32.63 
 
 
93 aa  55.5  0.0000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1616  H-NS histone family protein  34.02 
 
 
101 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0099  H-NS histone family protein  32.99 
 
 
101 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2220  H-NS histone family protein  36.84 
 
 
102 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.999721  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0112  HNS-like transcriptional regulator  33.33 
 
 
100 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000994611  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2010  H-NS histone family protein  32.63 
 
 
99 aa  53.5  0.0000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0227527  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2580  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  33.33 
 
 
119 aa  53.9  0.0000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.122678  normal  0.024514 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3822  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  33.33 
 
 
100 aa  53.5  0.0000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000137841  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1226  histone-like nucleoid-structuring protein H-NS  29.59 
 
 
114 aa  53.1  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.204671  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0088  DNA-binding protein BprA  32.99 
 
 
101 aa  52.8  0.000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2714  DNA-binding protein BprA  31.25 
 
 
111 aa  52.8  0.000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.344106  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3224  DNA-binding protein BprA  32.99 
 
 
101 aa  52.8  0.000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0199  H-NS histone family protein  31.03 
 
 
97 aa  51.6  0.000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.453548  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4714  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  33.67 
 
 
98 aa  52  0.000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.991534  normal  0.729946 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1150  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  28.12 
 
 
99 aa  51.6  0.000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1635  H-NS histone family protein  29.89 
 
 
97 aa  51.2  0.000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.749854  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3351  histone-like nucleoid-structuring protein H-NS  30.93 
 
 
98 aa  51.2  0.000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.383074 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0843  DNA-binding protein BprA  35.48 
 
 
96 aa  51.6  0.000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.277711  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6777  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  34.12 
 
 
99 aa  51.2  0.000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0843  H-NS histone family protein  43.28 
 
 
114 aa  51.2  0.000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1753  H-NS histone family protein  43.28 
 
 
114 aa  51.2  0.000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3476  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  29.7 
 
 
97 aa  51.2  0.000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.634664  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1593  H-NS histone family protein  43.28 
 
 
114 aa  51.2  0.000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.198882  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0171  H-NS histone family protein  29.89 
 
 
128 aa  51.2  0.000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.854986  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1364  H-NS histone family protein  43.28 
 
 
114 aa  51.2  0.000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0759669  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0646  H-NS histone family protein  43.28 
 
 
114 aa  51.2  0.000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.406819  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0510  H-NS histone family protein  43.28 
 
 
114 aa  51.2  0.000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.403335  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1568  H-NS histone family protein  43.28 
 
 
114 aa  50.8  0.000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.115952  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0260  H-NS histone family protein  29.89 
 
 
128 aa  51.2  0.000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4282  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  34.04 
 
 
100 aa  50.4  0.000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0105949  normal  0.0174683 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2207  H-NS histone family protein  32.97 
 
 
96 aa  50.4  0.000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000144624  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0401  H-NS histone family protein  32.97 
 
 
96 aa  50.4  0.000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.000000304691  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1239  H-NS histone family protein  32.97 
 
 
96 aa  50.4  0.000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  unclonable  0.0000000000958752  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3002  H-NS histone family protein  32.97 
 
 
96 aa  50.4  0.000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  unclonable  0.00000000000000136233  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1551  H-NS histone family protein  32.97 
 
 
96 aa  50.4  0.000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000358636  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1739  H-NS histone family protein  32.97 
 
 
96 aa  50.4  0.000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  unclonable  0.00000000000000443719  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4071  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  33.65 
 
 
95 aa  50.4  0.000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0737815 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2886  H-NS histone family protein  32.97 
 
 
96 aa  50.4  0.000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  hitchhiker  0.000145694  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6619  putative HNS-like protein  30.85 
 
 
111 aa  50.1  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.890454 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0263  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  30.53 
 
 
97 aa  49.7  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.820493 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2825  histone-like nucleoid-structuring protein H-NS  30.53 
 
 
97 aa  49.7  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6191  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  26.26 
 
 
102 aa  49.7  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.299615  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0281  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  30.53 
 
 
97 aa  49.7  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.166699  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3939  histone-like nucleoid-structuring protein H-NS  31.18 
 
 
99 aa  49.7  0.00001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0681504  hitchhiker  0.000514453 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0175  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  28.87 
 
 
98 aa  48.9  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0365  H-NS histone family protein  32.97 
 
 
96 aa  48.9  0.00002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00000040716  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5922  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  26.26 
 
 
102 aa  48.9  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.997127  normal  0.678214 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0838  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  29.35 
 
 
94 aa  48.9  0.00002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3934  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  29.29 
 
 
91 aa  48.9  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.222409  normal  0.184824 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0162  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  28.87 
 
 
98 aa  48.9  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.121985  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2290  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  34.52 
 
 
112 aa  49.7  0.00002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2867  H-NS histone family protein  27.84 
 
 
98 aa  48.1  0.00003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3109  H-NS histone family protein  27.84 
 
 
98 aa  48.1  0.00003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0084  H-NS histone family protein  27.84 
 
 
98 aa  48.1  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5060  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  34.88 
 
 
100 aa  48.1  0.00003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3384  histone-like nucleoid-structuring protein H-NS  29.47 
 
 
97 aa  48.5  0.00003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0209  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  29.47 
 
 
97 aa  48.5  0.00003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.726678 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2858  histone-like nucleoid-structuring protein H-NS  29.9 
 
 
98 aa  48.5  0.00003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.259744  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3154  histone-like nucleoid-structuring protein H-NS  34.88 
 
 
100 aa  48.1  0.00003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0195  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  29.47 
 
 
97 aa  48.5  0.00003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.750004  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5214  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  34.88 
 
 
100 aa  48.1  0.00003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.319749 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3442  H-NS histone family protein  27.84 
 
 
98 aa  48.1  0.00003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1677  H-NS histone family protein  27.84 
 
 
98 aa  48.1  0.00003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3862  H-NS histone family protein  27.84 
 
 
98 aa  48.1  0.00003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>