211 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1710b_A1635 on replicon NC_007435
Organism: Burkholderia pseudomallei 1710b



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009075  BURPS668_A0260  H-NS histone family protein  100 
 
 
128 aa  206  1e-52  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0171  H-NS histone family protein  100 
 
 
128 aa  206  1e-52  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.854986  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1635  H-NS histone family protein  100 
 
 
97 aa  204  3e-52  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.749854  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0199  H-NS histone family protein  91.67 
 
 
97 aa  190  6e-48  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.453548  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2220  H-NS histone family protein  51.09 
 
 
102 aa  95.9  2e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.999721  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5234  H-NS histone family protein  43.16 
 
 
105 aa  85.9  2e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.508361  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4703  H-NS histone family protein  43.16 
 
 
105 aa  85.9  2e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00682709  normal  0.394659 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4465  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  46.15 
 
 
92 aa  79.7  0.00000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.695514  normal  0.126063 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2580  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  44.32 
 
 
119 aa  78.2  0.00000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.122678  normal  0.024514 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0068  H-NS histone family protein  37.89 
 
 
99 aa  73.9  0.0000000000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  unclonable  0.00000000181219  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1225  H-NS histone family protein  37.89 
 
 
99 aa  73.9  0.0000000000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000571024  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0098  H-NS histone family protein  37.89 
 
 
108 aa  73.9  0.0000000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  unclonable  0.00000000000000405362  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1570  H-NS histone family protein  37.89 
 
 
173 aa  73.9  0.0000000000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  unclonable  0.000000000103893  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0079  H-NS histone family protein  37.89 
 
 
108 aa  73.9  0.0000000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  unclonable  0.0000151227  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1968  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  40.45 
 
 
93 aa  73.9  0.0000000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1506  H-NS histone family protein  37.89 
 
 
108 aa  73.9  0.0000000000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  unclonable  0.00000000000000220305  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4633  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  37 
 
 
101 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  unclonable  0.000000000000292632  decreased coverage  0.0000243295 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0864  H-NS histone family protein  39.56 
 
 
93 aa  70.1  0.000000000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0489  H-NS histone family protein  39.56 
 
 
93 aa  70.1  0.000000000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.416523  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1623  H-NS histone family protein  39.56 
 
 
93 aa  70.1  0.000000000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1784  H-NS histone family protein  39.56 
 
 
93 aa  70.1  0.000000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1601  putative DNA-binding protein  39.56 
 
 
93 aa  70.1  0.000000000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0668  H-NS histone family protein  39.56 
 
 
93 aa  70.1  0.000000000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0958724  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1386  H-NS histone family protein  39.56 
 
 
93 aa  70.1  0.000000000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2686  H-NS histone family protein  39.56 
 
 
93 aa  70.1  0.000000000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3822  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  36.36 
 
 
100 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000137841  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0112  HNS-like transcriptional regulator  36.36 
 
 
100 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000994611  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6667  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  34.12 
 
 
89 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.219261  normal  0.789361 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2158  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  35.42 
 
 
96 aa  68.9  0.00000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.232102  normal  0.811955 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6777  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  34.04 
 
 
99 aa  68.2  0.00000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1065  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  34.74 
 
 
98 aa  67.8  0.00000000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1144  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  34.74 
 
 
98 aa  67.8  0.00000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.439674  normal  0.582774 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0265  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  32.65 
 
 
98 aa  67.4  0.00000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3351  histone-like nucleoid-structuring protein H-NS  39.18 
 
 
98 aa  67.4  0.00000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.383074 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2010  H-NS histone family protein  37.76 
 
 
99 aa  67  0.00000000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0227527  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4282  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  37.89 
 
 
100 aa  67  0.00000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0105949  normal  0.0174683 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0843  DNA-binding protein BprA  38.71 
 
 
96 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.277711  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2072  H-NS histone family protein  37.63 
 
 
96 aa  65.5  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4128  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  35.11 
 
 
95 aa  65.5  0.0000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.382519  hitchhiker  0.00000000510411 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1913  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  35.11 
 
 
95 aa  65.5  0.0000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000183319 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7383  histone-like nucleoid-structuring protein H-NS  36.84 
 
 
102 aa  65.5  0.0000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.907507 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2858  histone-like nucleoid-structuring protein H-NS  34.02 
 
 
98 aa  65.5  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.259744  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0231  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  34.02 
 
 
98 aa  65.5  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0249  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  34.02 
 
 
98 aa  65.5  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1529  DNA-binding protein BprA  37.63 
 
 
96 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0569  HNS-like transcription regulator protein  37.63 
 
 
100 aa  65.5  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.147609  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6929  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  35.79 
 
 
99 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.599841  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0175  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  35.05 
 
 
98 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0162  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  35.05 
 
 
98 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.121985  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0755  H-NS histone family protein  37.63 
 
 
100 aa  65.5  0.0000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0220992  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4285  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  35.48 
 
 
97 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2160  DNA-binding protein BprA  37.63 
 
 
96 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2075  DNA-binding protein BprA  37.63 
 
 
100 aa  65.5  0.0000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0585602  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6191  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  34.74 
 
 
102 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.299615  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3476  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  33.68 
 
 
97 aa  64.3  0.0000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.634664  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5922  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  34.74 
 
 
102 aa  63.9  0.0000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.997127  normal  0.678214 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1150  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  31.25 
 
 
99 aa  63.9  0.0000000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0116  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  35.42 
 
 
100 aa  63.5  0.0000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6596  histone-like nucleoid-structuring protein H-NS  35.11 
 
 
96 aa  63.5  0.0000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.540075  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3934  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  32.97 
 
 
91 aa  63.2  0.000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.222409  normal  0.184824 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2135  putative DNA-binding protein  37.14 
 
 
79 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.45202  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1833  histone-like nucleoid-structuring protein H-NS  40.22 
 
 
96 aa  62.8  0.000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.648369  normal  0.932582 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3189  H-NS histone family protein  34.69 
 
 
98 aa  62.8  0.000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3279  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  37.11 
 
 
97 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0515948 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0158  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  32.99 
 
 
98 aa  62  0.000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1247  H-NS histone family protein  33.33 
 
 
96 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2867  H-NS histone family protein  35.71 
 
 
98 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0720  H-NS histone family protein  33.33 
 
 
96 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.232457  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0084  H-NS histone family protein  35.71 
 
 
98 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1677  H-NS histone family protein  35.71 
 
 
98 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2442  H-NS histone family protein  33.68 
 
 
131 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1706  H-NS histone family protein  33.68 
 
 
104 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1558  H-NS histone family protein  34.41 
 
 
131 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.752713  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3943  H-NS histone family protein  35.71 
 
 
98 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5767  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  36.08 
 
 
99 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1174  H-NS histone family protein  33.68 
 
 
104 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.354816  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3862  H-NS histone family protein  35.71 
 
 
98 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3442  H-NS histone family protein  35.71 
 
 
98 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0742  H-NS histone family protein  33.68 
 
 
104 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3109  H-NS histone family protein  35.71 
 
 
98 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2207  H-NS histone family protein  35.48 
 
 
96 aa  62  0.000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000144624  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3717  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  33.33 
 
 
136 aa  61.6  0.000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.989758  hitchhiker  0.00118334 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4071  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  35.16 
 
 
95 aa  61.2  0.000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0737815 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6084  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  34.74 
 
 
99 aa  61.2  0.000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.78955  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0132  histone-like nucleoid-structuring protein H-NS  33.33 
 
 
99 aa  60.8  0.000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6382  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  34.74 
 
 
99 aa  61.2  0.000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.193522  normal  0.0275568 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3806  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  35.87 
 
 
100 aa  60.5  0.000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0101066  hitchhiker  0.00273603 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2714  DNA-binding protein BprA  29.52 
 
 
111 aa  60.8  0.000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.344106  n/a   
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7403  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  36.67 
 
 
96 aa  60.5  0.000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2060  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  37.36 
 
 
91 aa  60.1  0.00000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0796579  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1239  H-NS histone family protein  34.41 
 
 
96 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  unclonable  0.0000000000958752  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2886  H-NS histone family protein  34.41 
 
 
96 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  hitchhiker  0.000145694  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0401  H-NS histone family protein  34.41 
 
 
96 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.000000304691  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3002  H-NS histone family protein  34.41 
 
 
96 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  unclonable  0.00000000000000136233  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1551  H-NS histone family protein  34.41 
 
 
96 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000358636  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1739  H-NS histone family protein  34.41 
 
 
96 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  unclonable  0.00000000000000443719  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00711  putative HNS-like transcription regulator protein  31.96 
 
 
96 aa  58.9  0.00000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.0000172984  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3384  histone-like nucleoid-structuring protein H-NS  31.96 
 
 
97 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1710  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  34.07 
 
 
93 aa  59.3  0.00000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.443687  normal  0.618525 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3909  H-NS histone family protein  31.96 
 
 
97 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>