216 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BMA10229_A0510 on replicon NC_008836
Organism: Burkholderia mallei NCTC 10229



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006348  BMA0843  H-NS histone family protein  100 
 
 
114 aa  232  2.0000000000000002e-60  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0646  H-NS histone family protein  100 
 
 
114 aa  232  2.0000000000000002e-60  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.406819  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1364  H-NS histone family protein  100 
 
 
114 aa  232  2.0000000000000002e-60  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0759669  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0510  H-NS histone family protein  100 
 
 
114 aa  232  2.0000000000000002e-60  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.403335  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1568  H-NS histone family protein  99.12 
 
 
114 aa  231  3e-60  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.115952  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1753  H-NS histone family protein  99.12 
 
 
114 aa  229  1e-59  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1593  H-NS histone family protein  99.12 
 
 
114 aa  229  1e-59  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.198882  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6934  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  40.62 
 
 
96 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.909068  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2975  putative H-NS-like transcription regulator  38.95 
 
 
96 aa  65.5  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2010  H-NS histone family protein  38.46 
 
 
99 aa  64.3  0.0000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0227527  n/a   
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6182  hypothetical protein  40.96 
 
 
159 aa  61.6  0.000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.633203  normal  0.361807 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2207  H-NS histone family protein  42.86 
 
 
96 aa  61.2  0.000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000144624  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6044  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  37.21 
 
 
116 aa  60.8  0.000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.304642 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2204  BphA  38.75 
 
 
151 aa  60.5  0.000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.322036  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6084  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  42.35 
 
 
99 aa  60.5  0.000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.78955  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0401  H-NS histone family protein  41.76 
 
 
96 aa  60.1  0.000000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.000000304691  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1239  H-NS histone family protein  41.76 
 
 
96 aa  60.1  0.000000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  unclonable  0.0000000000958752  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2886  H-NS histone family protein  41.76 
 
 
96 aa  60.1  0.000000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  hitchhiker  0.000145694  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3002  H-NS histone family protein  41.76 
 
 
96 aa  60.1  0.000000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  unclonable  0.00000000000000136233  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1739  H-NS histone family protein  41.76 
 
 
96 aa  60.1  0.000000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  unclonable  0.00000000000000443719  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1551  H-NS histone family protein  41.76 
 
 
96 aa  60.1  0.000000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000358636  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2220  H-NS histone family protein  36.59 
 
 
102 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.999721  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2714  DNA-binding protein BprA  40.43 
 
 
111 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.344106  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2867  H-NS histone family protein  31.96 
 
 
98 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3943  H-NS histone family protein  31.96 
 
 
98 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0838  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  36.59 
 
 
94 aa  58.9  0.00000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3862  H-NS histone family protein  31.96 
 
 
98 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0084  H-NS histone family protein  31.96 
 
 
98 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1677  H-NS histone family protein  31.96 
 
 
98 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4285  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  41.11 
 
 
97 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3109  H-NS histone family protein  31.96 
 
 
98 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3595  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  36.59 
 
 
95 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.137974  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6382  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  41.18 
 
 
99 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.193522  normal  0.0275568 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3442  H-NS histone family protein  31.96 
 
 
98 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4070  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  36.59 
 
 
95 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.000676326  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0265  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  34.74 
 
 
98 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0365  H-NS histone family protein  40.66 
 
 
96 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00000040716  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0132  histone-like nucleoid-structuring protein H-NS  43.01 
 
 
99 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4714  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  35.16 
 
 
98 aa  57  0.00000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.991534  normal  0.729946 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3279  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  38.46 
 
 
97 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0515948 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2686  H-NS histone family protein  34.07 
 
 
93 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6900  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  35.37 
 
 
110 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0668  H-NS histone family protein  34.07 
 
 
93 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0958724  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1601  putative DNA-binding protein  34.07 
 
 
93 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0864  H-NS histone family protein  34.07 
 
 
93 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1784  H-NS histone family protein  34.07 
 
 
93 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3934  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  35.44 
 
 
91 aa  55.8  0.0000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.222409  normal  0.184824 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1623  H-NS histone family protein  34.07 
 
 
93 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1833  histone-like nucleoid-structuring protein H-NS  32.98 
 
 
96 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.648369  normal  0.932582 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5767  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  36.14 
 
 
99 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5234  H-NS histone family protein  40.24 
 
 
105 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.508361  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0489  H-NS histone family protein  34.07 
 
 
93 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.416523  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4703  H-NS histone family protein  40.24 
 
 
105 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00682709  normal  0.394659 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6089  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  37.78 
 
 
109 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.817977  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1386  H-NS histone family protein  34.07 
 
 
93 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5851  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  37.78 
 
 
109 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2135  putative DNA-binding protein  38.89 
 
 
79 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.45202  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6589  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  37.78 
 
 
109 aa  55.1  0.0000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.768318  normal  0.0573169 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0651  H-NS histone family protein  32.58 
 
 
113 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2382  H-NS histone family protein  32.58 
 
 
113 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1775  H-NS histone family protein  32.58 
 
 
113 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0387422  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5743  histone-like nucleoid-structuring protein H-NS  37.78 
 
 
109 aa  55.1  0.0000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6107  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  37.78 
 
 
109 aa  55.1  0.0000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.525668  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0812  H-NS histone family protein  32.58 
 
 
113 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0112  HNS-like transcriptional regulator  32.99 
 
 
100 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000994611  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1170  H-NS histone family protein  32.58 
 
 
113 aa  54.7  0.0000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1150  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  37.5 
 
 
99 aa  54.3  0.0000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6347  histone-like nucleoid-structuring protein H-NS  39.33 
 
 
516 aa  54.3  0.0000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.0000113528  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1093  H-NS histone family protein  32.58 
 
 
113 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.327135  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6191  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  34.88 
 
 
102 aa  53.9  0.0000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.299615  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3822  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  31.96 
 
 
100 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000137841  normal 
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7403  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  36.25 
 
 
96 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0175  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  30.61 
 
 
98 aa  53.9  0.0000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0162  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  30.61 
 
 
98 aa  53.9  0.0000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.121985  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4282  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  29.47 
 
 
100 aa  52.8  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0105949  normal  0.0174683 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7579  histone-like nucleoid-structuring protein H-NS  36.67 
 
 
109 aa  53.5  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.54905  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5922  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  34.88 
 
 
102 aa  53.1  0.000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.997127  normal  0.678214 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1558  H-NS histone family protein  32.29 
 
 
131 aa  53.1  0.000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.752713  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2580  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  31.25 
 
 
119 aa  53.1  0.000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.122678  normal  0.024514 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6777  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  29.76 
 
 
99 aa  53.1  0.000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0068  H-NS histone family protein  32.63 
 
 
99 aa  52.4  0.000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  unclonable  0.00000000181219  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2290  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  33.72 
 
 
112 aa  52.4  0.000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6005  histone-like nucleoid-structuring protein H-NS  36.26 
 
 
103 aa  52.4  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4990  histone-like nucleoid-structuring protein H-NS  36.26 
 
 
104 aa  52.8  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0212879  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0208  H-NS histone family protein  36.84 
 
 
101 aa  52.8  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00707733  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1570  H-NS histone family protein  32.98 
 
 
173 aa  52.4  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  unclonable  0.000000000103893  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0158  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  32.65 
 
 
98 aa  52.4  0.000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0088  DNA-binding protein BprA  36.84 
 
 
101 aa  52  0.000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0231  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  30.61 
 
 
98 aa  52.8  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4746  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  41.05 
 
 
101 aa  52.4  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.587516  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3189  H-NS histone family protein  30.93 
 
 
98 aa  52.8  0.000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3224  DNA-binding protein BprA  36.84 
 
 
101 aa  52  0.000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0099  H-NS histone family protein  36.84 
 
 
101 aa  52.8  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1616  H-NS histone family protein  36.84 
 
 
101 aa  52.8  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2858  histone-like nucleoid-structuring protein H-NS  30.61 
 
 
98 aa  52.8  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.259744  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5335  histone-like nucleoid-structuring protein H-NS  41.05 
 
 
101 aa  52.4  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0249  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  30.61 
 
 
98 aa  52.8  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5527  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  41.05 
 
 
101 aa  52.4  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.645148  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1144  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  36.49 
 
 
98 aa  52.4  0.000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.439674  normal  0.582774 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1225  H-NS histone family protein  32.63 
 
 
99 aa  52.4  0.000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000571024  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>