205 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_3939 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008781  Pnap_3939  histone-like nucleoid-structuring protein H-NS  100 
 
 		 99 aa  202  2e-51  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0681504  hitchhiker  0.000514453 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1226  histone-like nucleoid-structuring protein H-NS  39.18 
 
 		 114 aa  82  0.000000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.204671  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1065  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  38.78 
 
 		 98 aa  81.3  0.000000000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1144  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  38.78 
 
 		 98 aa  81.3  0.000000000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.439674  normal  0.582774 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1913  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  43.01 
 
 		 95 aa  79  0.00000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000183319 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4128  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  43.01 
 
 		 95 aa  79  0.00000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.382519  hitchhiker  0.00000000510411 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1150  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  37.76 
 
 		 99 aa  77.8  0.00000000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6777  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  40.21 
 
 		 99 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2060  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  39.58 
 
 		 91 aa  74.3  0.0000000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0796579  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0838  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  38.54 
 
 		 94 aa  73.2  0.000000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2580  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  39.58 
 
 		 119 aa  73.2  0.000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.122678  normal  0.024514 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3717  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  37.76 
 
 		 136 aa  73.2  0.000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.989758  hitchhiker  0.00118334 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3476  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  35.71 
 
 		 97 aa  72  0.000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.634664  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3934  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  32.65 
 
 		 91 aa  72  0.000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.222409  normal  0.184824 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2158  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  35.42 
 
 		 96 aa  70.9  0.000000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.232102  normal  0.811955 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3595  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  37.23 
 
 		 95 aa  68.2  0.00000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.137974  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4070  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  37.23 
 
 		 95 aa  67.8  0.00000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.000676326  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1833  histone-like nucleoid-structuring protein H-NS  37.5 
 
 		 96 aa  67.8  0.00000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.648369  normal  0.932582 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4714  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  31.63 
 
 		 98 aa  66.6  0.0000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.991534  normal  0.729946 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0190  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  35.42 
 
 		 97 aa  65.5  0.0000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.317548  hitchhiker  0.0000000190695 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2825  histone-like nucleoid-structuring protein H-NS  35.42 
 
 		 97 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0263  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  35.42 
 
 		 97 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.820493 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0281  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  35.42 
 
 		 97 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.166699  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0048  H-NS histone family protein  36.08 
 
 		 125 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2905  H-NS histone family protein  36.08 
 
 		 97 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3827  H-NS histone family protein  36.08 
 
 		 97 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1636  H-NS histone family protein  36.08 
 
 		 97 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.741416  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3155  H-NS histone family protein  36.08 
 
 		 97 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2965  H-NS histone family protein  36.08 
 
 		 97 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3909  H-NS histone family protein  36.08 
 
 		 97 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3404  H-NS histone family protein  36.08 
 
 		 97 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.237819  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4465  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  35.42 
 
 		 92 aa  64.3  0.0000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.695514  normal  0.126063 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0209  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  34.38 
 
 		 97 aa  64.3  0.0000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.726678 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3384  histone-like nucleoid-structuring protein H-NS  34.38 
 
 		 97 aa  64.3  0.0000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1968  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  35.11 
 
 		 93 aa  64.3  0.0000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0195  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  34.38 
 
 		 97 aa  64.3  0.0000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.750004  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2135  putative DNA-binding protein  40.74 
 
 		 79 aa  64.3  0.0000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.45202  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4990  histone-like nucleoid-structuring protein H-NS  37.25 
 
 		 104 aa  63.9  0.0000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0212879  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0864  H-NS histone family protein  34.04 
 
 		 93 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3721  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  35.71 
 
 		 96 aa  62.4  0.000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.00112888  normal  0.513312 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1784  H-NS histone family protein  34.04 
 
 		 93 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1601  putative DNA-binding protein  34.04 
 
 		 93 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1623  H-NS histone family protein  34.04 
 
 		 93 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0668  H-NS histone family protein  34.04 
 
 		 93 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0958724  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2686  H-NS histone family protein  34.04 
 
 		 93 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4798  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  35.71 
 
 		 96 aa  62.4  0.000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.272454  normal  0.166506 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1386  H-NS histone family protein  34.04 
 
 		 93 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0489  H-NS histone family protein  34.04 
 
 		 93 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.416523  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0116  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  32.99 
 
 		 100 aa  61.2  0.000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS00711  putative HNS-like transcription regulator protein  34.69 
 
 		 96 aa  60.8  0.000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.0000172984  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5562  histone-like nucleoid-structuring protein H-NS  32.67 
 
 		 104 aa  61.2  0.000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7403  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  35.79 
 
 		 96 aa  60.8  0.000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5767  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  38.24 
 
 		 99 aa  60.8  0.000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3677  histone-like nucleoid-structuring protein H-NS  34 
 
 		 102 aa  60.8  0.000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.166379 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4886  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  34.82 
 
 		 114 aa  60.8  0.000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.602991  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1558  H-NS histone family protein  37.89 
 
 		 131 aa  60.8  0.000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.752713  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4071  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  34.83 
 
 		 95 aa  60.1  0.000000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0737815 
 
 
-
 
NC_003296  RS02004  putative HNS-like transcription regulator protein  35.05 
 
 		 95 aa  58.9  0.00000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0969964  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3822  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  37.36 
 
 		 100 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000137841  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2160  DNA-binding protein BprA  34.74 
 
 		 96 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1529  DNA-binding protein BprA  34.74 
 
 		 96 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0569  HNS-like transcription regulator protein  34.74 
 
 		 100 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.147609  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0112  HNS-like transcriptional regulator  37.36 
 
 		 100 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000994611  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2072  H-NS histone family protein  34.74 
 
 		 96 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0755  H-NS histone family protein  34.74 
 
 		 100 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0220992  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2075  DNA-binding protein BprA  34.74 
 
 		 100 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0585602  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0398  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  30.93 
 
 		 100 aa  58.2  0.00000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2867  H-NS histone family protein  35.87 
 
 		 98 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1677  H-NS histone family protein  35.87 
 
 		 98 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5596  nucleoid protein H-NS  34 
 
 		 102 aa  58.2  0.00000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.16143  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0084  H-NS histone family protein  35.87 
 
 		 98 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0843  DNA-binding protein BprA  34.74 
 
 		 96 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.277711  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3154  histone-like nucleoid-structuring protein H-NS  33.66 
 
 		 100 aa  57.8  0.00000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4282  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  31.31 
 
 		 100 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0105949  normal  0.0174683 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5060  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  33.66 
 
 		 100 aa  57.8  0.00000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5214  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  33.66 
 
 		 100 aa  57.8  0.00000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.319749 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0158  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  38.46 
 
 		 98 aa  57.8  0.00000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3943  H-NS histone family protein  35.87 
 
 		 98 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3862  H-NS histone family protein  35.87 
 
 		 98 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3109  H-NS histone family protein  35.87 
 
 		 98 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3442  H-NS histone family protein  35.87 
 
 		 98 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4321  putative HNS-like transcriptional regulator  30.93 
 
 		 100 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0720  H-NS histone family protein  33.68 
 
 		 96 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.232457  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1706  H-NS histone family protein  33.68 
 
 		 104 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1174  H-NS histone family protein  33.68 
 
 		 104 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.354816  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1247  H-NS histone family protein  33.68 
 
 		 96 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0742  H-NS histone family protein  33.68 
 
 		 104 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0867  putative HNS-like transcription regulator protein  32.29 
 
 		 96 aa  57  0.00000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.139885 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2442  H-NS histone family protein  33.68 
 
 		 131 aa  57  0.00000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4285  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  30.21 
 
 		 97 aa  57  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2981  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  36.23 
 
 		 100 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.207499  decreased coverage  0.0000000417224 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0208  H-NS histone family protein  29.47 
 
 		 101 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00707733  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0088  DNA-binding protein BprA  30.53 
 
 		 101 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0099  H-NS histone family protein  29.47 
 
 		 101 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3224  DNA-binding protein BprA  30.53 
 
 		 101 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1616  H-NS histone family protein  29.47 
 
 		 101 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2290  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  34.38 
 
 		 112 aa  55.5  0.0000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1370  nucleoid protein H-NS  33.33 
 
 		 115 aa  55.5  0.0000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.620152  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3850  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  32.74 
 
 		 239 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.000396096  normal  0.523489 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0126  H-NS histone family protein  29.47 
 
 		 101 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>