151 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_2314 on replicon NC_010508
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008542  Bcen2424_2291  methylglyoxal synthase  100 
 
 
130 aa  260  4.999999999999999e-69  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2314  methylglyoxal synthase  100 
 
 
130 aa  260  4.999999999999999e-69  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.659726 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1679  methylglyoxal synthase  99.23 
 
 
130 aa  259  1e-68  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0255708  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2329  methylglyoxal synthase  97.69 
 
 
130 aa  255  1e-67  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2207  methylglyoxal synthase  97.69 
 
 
130 aa  255  1e-67  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.093882  normal  0.861141 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5618  methylglyoxal synthase  96.15 
 
 
130 aa  251  2.0000000000000002e-66  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0573538  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0987  methylglyoxal synthase  96.15 
 
 
130 aa  251  2.0000000000000002e-66  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1881  methylglyoxal synthase  92.06 
 
 
130 aa  232  1.0000000000000001e-60  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.715757  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1390  methylglyoxal synthase  92.06 
 
 
130 aa  232  1.0000000000000001e-60  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1079  methylglyoxal synthase  92.06 
 
 
130 aa  232  1.0000000000000001e-60  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.233114  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0788  methylglyoxal synthase  92.06 
 
 
130 aa  232  1.0000000000000001e-60  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0615906  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1235  methylglyoxal synthase  92.06 
 
 
130 aa  232  1.0000000000000001e-60  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1244  methylglyoxal synthase  92.06 
 
 
130 aa  232  1.0000000000000001e-60  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.473905  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0362  methylglyoxal synthase  92.06 
 
 
130 aa  232  1.0000000000000001e-60  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.607553  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1018  methylglyoxal synthase  92.06 
 
 
130 aa  231  2.0000000000000002e-60  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.736302  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2061  methylglyoxal synthase  76.27 
 
 
129 aa  187  4e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.337955  normal  0.207657 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1304  methylglyoxal synthase  76.27 
 
 
129 aa  187  5e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.206043  normal  0.073248 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3256  methylglyoxal synthase  76.27 
 
 
129 aa  187  5.999999999999999e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.308691  normal  0.881072 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0792  methylglyoxal synthase  74.8 
 
 
140 aa  184  3e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.52468  normal  0.131121 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2504  methylglyoxal synthase  69.35 
 
 
130 aa  177  5.999999999999999e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.156833  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1982  methylglyoxal synthase  65.57 
 
 
143 aa  166  7e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2382  methylglyoxal synthase  65.57 
 
 
146 aa  166  8e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.579764  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2185  methylglyoxal synthase  66.09 
 
 
135 aa  160  8.000000000000001e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0445857  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0042  methylglyoxal synthase  68.64 
 
 
127 aa  156  9e-38  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.304097 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04890  Dephospho-CoA kinase  59.84 
 
 
317 aa  154  4e-37  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000544377  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0967  methylglyoxal synthase  63.56 
 
 
123 aa  151  2e-36  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1275  methylglyoxal synthase  60.48 
 
 
128 aa  150  5.9999999999999996e-36  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.418994  hitchhiker  0.00000238684 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0594  methylglyoxal synthase  63.03 
 
 
128 aa  150  7e-36  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.444681  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0707  methylglyoxal synthase  60.17 
 
 
120 aa  146  7e-35  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1309  methylglyoxal synthase  57.5 
 
 
141 aa  144  3e-34  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.871383  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2192  methylglyoxal synthase  57.98 
 
 
122 aa  144  5e-34  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1798  methylglyoxal synthase  60.5 
 
 
123 aa  143  6e-34  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.061495  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0194  methylglyoxal synthase  60.17 
 
 
122 aa  143  7.0000000000000006e-34  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1415  methylglyoxal synthase  56.67 
 
 
131 aa  142  1e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0291451  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1416  methylglyoxal synthase  56.67 
 
 
131 aa  142  1e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.032143  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0241  methylglyoxal synthase  57.03 
 
 
137 aa  142  1e-33  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1706  methylglyoxal synthase  57.5 
 
 
130 aa  143  1e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0524  methylglyoxal synthase  52.03 
 
 
126 aa  142  1e-33  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1627  methylglyoxal synthase  56.67 
 
 
131 aa  142  1e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.15767 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1257  methylglyoxal synthase  55.83 
 
 
131 aa  142  1e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.390587  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3178  methylglyoxal synthase  59.65 
 
 
134 aa  142  1e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1459  methylglyoxal synthase  55.83 
 
 
131 aa  142  1e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0146321  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1589  methylglyoxal synthase  55.83 
 
 
131 aa  141  2e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1662  methylglyoxal synthase  55.83 
 
 
131 aa  141  2e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1443  methylglyoxal synthase  55.83 
 
 
131 aa  141  2e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0250107  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1556  methylglyoxal synthase  55.83 
 
 
131 aa  141  2e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1700  methylglyoxal synthase  55.83 
 
 
131 aa  141  2e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0277502  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3756  methylglyoxal synthase  55.83 
 
 
131 aa  141  2e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2126  methylglyoxal synthase  54.1 
 
 
132 aa  141  3e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000882281  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2805  methylglyoxal synthase  61.4 
 
 
133 aa  141  4e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.321447  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1077  methylglyoxal synthase  55.93 
 
 
119 aa  140  4e-33  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0366  methylglyoxal synthase  51.69 
 
 
126 aa  140  9e-33  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1122  methylglyoxal synthase  47.58 
 
 
126 aa  139  9e-33  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0496  methylglyoxal synthase  57.5 
 
 
144 aa  139  9.999999999999999e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1265  methylglyoxal synthase  54.24 
 
 
119 aa  138  1.9999999999999998e-32  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.357495  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2123  methylglyoxal synthase  54.17 
 
 
140 aa  138  3e-32  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.336211  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0233  methylglyoxal synthase  56.3 
 
 
144 aa  135  2e-31  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2082  methylglyoxal synthase  50.43 
 
 
120 aa  134  4e-31  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0137  methylglyoxal synthase  57.14 
 
 
144 aa  134  5e-31  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_145  methylglyoxal synthase  54.62 
 
 
144 aa  133  7.000000000000001e-31  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00533  methylglyoxal synthase  53.78 
 
 
136 aa  132  1.9999999999999998e-30  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1163  methylglyoxal synthase  55.47 
 
 
128 aa  131  1.9999999999999998e-30  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.618904  normal  0.0141735 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2484  methylglyoxal synthase  57.02 
 
 
133 aa  130  5e-30  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3100  methylglyoxal synthase  53.51 
 
 
159 aa  127  3e-29  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000537533  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2651  methylglyoxal synthase  55.08 
 
 
140 aa  127  4.0000000000000003e-29  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.957792  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1558  methylglyoxal synthase  51.69 
 
 
159 aa  127  5.0000000000000004e-29  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.296029  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3450  methylglyoxal synthase  53.04 
 
 
156 aa  125  2.0000000000000002e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000281554  hitchhiker  0.00361328 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2527  methylglyoxal synthase  49.14 
 
 
139 aa  125  2.0000000000000002e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0116  methylglyoxal synthase  49.15 
 
 
152 aa  125  3e-28  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.503426  normal  0.542869 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1481  methylglyoxal synthase  48.11 
 
 
119 aa  123  8.000000000000001e-28  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1302  methylglyoxal synthase  48.31 
 
 
154 aa  123  1e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000000113114  decreased coverage  0.00562878 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3595  methylglyoxal synthase  52.5 
 
 
137 aa  122  1e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4588  methylglyoxal synthase  47.58 
 
 
133 aa  122  1e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0985  methylglyoxal synthase  50 
 
 
135 aa  122  2e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0342245  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1760  methylglyoxal synthase  47.06 
 
 
152 aa  122  2e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0497546  hitchhiker  0.0006316 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2381  methylglyoxal synthase  49.15 
 
 
156 aa  121  3e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0265896  normal  0.0715346 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0611  methylglyoxal synthase  47.01 
 
 
155 aa  120  7e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21210  methylglyoxal synthase  53.51 
 
 
148 aa  120  7e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.846941  normal  0.0527752 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0861  methylglyoxal synthase  46.09 
 
 
153 aa  119  1.9999999999999998e-26  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00000000142062  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2526  methylglyoxal synthase  47.37 
 
 
160 aa  118  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.487727 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2852  methylglyoxal synthase  45.16 
 
 
152 aa  118  1.9999999999999998e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.069917  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00967  methylglyoxal synthase  45.76 
 
 
152 aa  117  3.9999999999999996e-26  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.497667  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2680  methylglyoxal synthase  45.76 
 
 
152 aa  117  3.9999999999999996e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.788486  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000319  methylglyoxal synthase  44.44 
 
 
151 aa  117  3.9999999999999996e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1127  methylglyoxal synthase  45.76 
 
 
152 aa  117  3.9999999999999996e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.284898  normal  0.207413 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1906  methylglyoxal synthase  50 
 
 
146 aa  117  3.9999999999999996e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1072  methylglyoxal synthase  45.76 
 
 
152 aa  117  3.9999999999999996e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000670613  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1078  methylglyoxal synthase  45.76 
 
 
152 aa  117  3.9999999999999996e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000897908  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00974  hypothetical protein  45.76 
 
 
152 aa  117  3.9999999999999996e-26  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.651902  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2633  methylglyoxal synthase  45.76 
 
 
152 aa  117  3.9999999999999996e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.264102  hitchhiker  0.000000301541 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2156  methylglyoxal synthase  45.76 
 
 
152 aa  117  3.9999999999999996e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.082443  normal  0.275466 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2352  methylglyoxal synthase  45.76 
 
 
152 aa  117  3.9999999999999996e-26  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.318065  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2543  methylglyoxal synthase  46.22 
 
 
152 aa  117  4.9999999999999996e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00778094  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3368  methylglyoxal synthase  52.59 
 
 
126 aa  117  4.9999999999999996e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.378138  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1475  methylglyoxal synthase  44.54 
 
 
152 aa  117  7.999999999999999e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.977307  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06121  methylglyoxal synthase  44.83 
 
 
151 aa  116  9e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2367  methylglyoxal synthase  45.83 
 
 
133 aa  116  9e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000264399  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1628  methylglyoxal synthase  51.3 
 
 
167 aa  116  9.999999999999999e-26  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.652172  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1333  methylglyoxal synthase  51.26 
 
 
125 aa  116  9.999999999999999e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.714194  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1215  methylglyoxal synthase  45.3 
 
 
152 aa  115  1.9999999999999998e-25  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.216968  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>