151 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_2484 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013946  Mrub_2484  methylglyoxal synthase  100 
 
 		 133 aa  269  8.000000000000001e-72  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1163  methylglyoxal synthase  80.17 
 
 		 128 aa  208  2e-53  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.618904  normal  0.0141735 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04890  Dephospho-CoA kinase  63.41 
 
 		 317 aa  167  6e-41  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000544377  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0241  methylglyoxal synthase  63.87 
 
 		 137 aa  166  1e-40  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0233  methylglyoxal synthase  64.41 
 
 		 144 aa  157  3e-38  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2651  methylglyoxal synthase  63.25 
 
 		 140 aa  157  4e-38  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.957792  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2082  methylglyoxal synthase  59.83 
 
 		 120 aa  157  4e-38  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_145  methylglyoxal synthase  62.71 
 
 		 144 aa  154  3e-37  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1275  methylglyoxal synthase  59.17 
 
 		 128 aa  153  7e-37  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.418994  hitchhiker  0.00000238684 
 
 
-
 
NC_002936  DET0137  methylglyoxal synthase  62.71 
 
 		 144 aa  152  2e-36  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1309  methylglyoxal synthase  57.94 
 
 		 141 aa  151  2e-36  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.871383  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0366  methylglyoxal synthase  55.37 
 
 		 126 aa  151  2.9999999999999998e-36  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1982  methylglyoxal synthase  60 
 
 		 143 aa  150  5e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1122  methylglyoxal synthase  56.8 
 
 		 126 aa  150  5e-36  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2382  methylglyoxal synthase  60 
 
 		 146 aa  150  5e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.579764  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0524  methylglyoxal synthase  58.87 
 
 		 126 aa  150  7e-36  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1798  methylglyoxal synthase  56.1 
 
 		 123 aa  149  1e-35  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.061495  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2185  methylglyoxal synthase  59.66 
 
 		 135 aa  148  2e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0445857  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2805  methylglyoxal synthase  59.02 
 
 		 133 aa  149  2e-35  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.321447  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0792  methylglyoxal synthase  62.39 
 
 		 140 aa  148  3e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.52468  normal  0.131121 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2126  methylglyoxal synthase  57.85 
 
 		 132 aa  148  3e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000882281  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1459  methylglyoxal synthase  58.47 
 
 		 131 aa  147  4e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0146321  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1443  methylglyoxal synthase  58.47 
 
 		 131 aa  146  9e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0250107  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1556  methylglyoxal synthase  58.47 
 
 		 131 aa  146  9e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3756  methylglyoxal synthase  58.47 
 
 		 131 aa  146  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1662  methylglyoxal synthase  58.47 
 
 		 131 aa  146  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1415  methylglyoxal synthase  58.47 
 
 		 131 aa  145  1.0000000000000001e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0291451  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1416  methylglyoxal synthase  58.47 
 
 		 131 aa  145  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.032143  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1589  methylglyoxal synthase  58.47 
 
 		 131 aa  146  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1257  methylglyoxal synthase  59.32 
 
 		 131 aa  146  1.0000000000000001e-34  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.390587  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1627  methylglyoxal synthase  58.47 
 
 		 131 aa  145  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.15767 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1700  methylglyoxal synthase  58.47 
 
 		 131 aa  146  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0277502  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2504  methylglyoxal synthase  57.48 
 
 		 130 aa  143  6e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.156833  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2192  methylglyoxal synthase  57.5 
 
 		 122 aa  143  8.000000000000001e-34  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2123  methylglyoxal synthase  55.93 
 
 		 140 aa  142  1e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.336211  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3603  cyclic nucleotide-binding protein  51.64 
 
 		 322 aa  142  1e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.181046  normal  0.223623 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0496  methylglyoxal synthase  57.63 
 
 		 144 aa  142  1e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1077  methylglyoxal synthase  59.13 
 
 		 119 aa  142  2e-33  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3178  methylglyoxal synthase  58.82 
 
 		 134 aa  142  2e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1265  methylglyoxal synthase  59.13 
 
 		 119 aa  140  4e-33  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.357495  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0594  methylglyoxal synthase  53.66 
 
 		 128 aa  140  5e-33  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.444681  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3256  methylglyoxal synthase  56.56 
 
 		 129 aa  140  6e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.308691  normal  0.881072 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2061  methylglyoxal synthase  56.56 
 
 		 129 aa  140  7e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.337955  normal  0.207657 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1304  methylglyoxal synthase  55.74 
 
 		 129 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.206043  normal  0.073248 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0707  methylglyoxal synthase  55.26 
 
 		 120 aa  137  4.999999999999999e-32  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1881  methylglyoxal synthase  55.65 
 
 		 130 aa  136  7e-32  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.715757  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1390  methylglyoxal synthase  55.65 
 
 		 130 aa  136  7e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1079  methylglyoxal synthase  55.65 
 
 		 130 aa  136  7e-32  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.233114  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0788  methylglyoxal synthase  55.65 
 
 		 130 aa  136  7e-32  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0615906  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1235  methylglyoxal synthase  55.65 
 
 		 130 aa  136  7e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1244  methylglyoxal synthase  55.65 
 
 		 130 aa  136  7e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.473905  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0362  methylglyoxal synthase  55.65 
 
 		 130 aa  136  7e-32  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.607553  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0194  methylglyoxal synthase  56.67 
 
 		 122 aa  136  1e-31  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1706  methylglyoxal synthase  58.12 
 
 		 130 aa  136  1e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0042  methylglyoxal synthase  59.83 
 
 		 127 aa  135  2e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.304097 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1481  methylglyoxal synthase  55.26 
 
 		 119 aa  135  2e-31  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0967  methylglyoxal synthase  56.67 
 
 		 123 aa  135  2e-31  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2517  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  47.37 
 
 		 297 aa  134  4e-31  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.955046 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0987  methylglyoxal synthase  57.89 
 
 		 130 aa  132  9.999999999999999e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3100  methylglyoxal synthase  47.33 
 
 		 159 aa  132  1.9999999999999998e-30  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000537533  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2291  methylglyoxal synthase  57.02 
 
 		 130 aa  130  5e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2314  methylglyoxal synthase  57.02 
 
 		 130 aa  130  5e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.659726 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1679  methylglyoxal synthase  57.02 
 
 		 130 aa  130  6e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0255708  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0985  methylglyoxal synthase  52.59 
 
 		 135 aa  130  6e-30  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0342245  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5618  methylglyoxal synthase  56.14 
 
 		 130 aa  129  1.0000000000000001e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0573538  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1018  methylglyoxal synthase  54.55 
 
 		 130 aa  129  1.0000000000000001e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.736302  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2329  methylglyoxal synthase  57.02 
 
 		 130 aa  129  1.0000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2207  methylglyoxal synthase  57.02 
 
 		 130 aa  129  1.0000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.093882  normal  0.861141 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2381  methylglyoxal synthase  51.28 
 
 		 156 aa  128  2.0000000000000002e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0265896  normal  0.0715346 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0611  methylglyoxal synthase  49.57 
 
 		 155 aa  128  3e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1144  methylglyoxal synthase  50.43 
 
 		 155 aa  127  4.0000000000000003e-29  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.175062  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21210  methylglyoxal synthase  52.17 
 
 		 148 aa  127  7.000000000000001e-29  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.846941  normal  0.0527752 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00533  methylglyoxal synthase  51.75 
 
 		 136 aa  125  2.0000000000000002e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4130  methylglyoxal synthase  53.28 
 
 		 126 aa  125  2.0000000000000002e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.070186  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0650  methylglyoxal synthase  46.15 
 
 		 151 aa  125  2.0000000000000002e-28  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3450  methylglyoxal synthase  49.15 
 
 		 156 aa  125  2.0000000000000002e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000281554  hitchhiker  0.00361328 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2133  methylglyoxal synthase  47.86 
 
 		 151 aa  125  3e-28  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0525885  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1760  methylglyoxal synthase  45.69 
 
 		 152 aa  124  5e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0497546  hitchhiker  0.0006316 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2527  methylglyoxal synthase  55.79 
 
 		 139 aa  124  6e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0861  methylglyoxal synthase  47.86 
 
 		 153 aa  123  8.000000000000001e-28  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00000000142062  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1333  methylglyoxal synthase  53.39 
 
 		 125 aa  123  8.000000000000001e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.714194  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000319  methylglyoxal synthase  47.41 
 
 		 151 aa  123  1e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1906  methylglyoxal synthase  50.85 
 
 		 146 aa  123  1e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1391  methylglyoxal synthase  43.51 
 
 		 153 aa  122  2e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000525868  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1558  methylglyoxal synthase  48.82 
 
 		 159 aa  122  2e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.296029  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1475  methylglyoxal synthase  47.41 
 
 		 152 aa  122  2e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.977307  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1568  methylglyoxal synthase  48.72 
 
 		 166 aa  121  4e-27  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06121  methylglyoxal synthase  46.55 
 
 		 151 aa  121  4e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1634  methylglyoxal synthase  48.72 
 
 		 166 aa  121  4e-27  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2367  methylglyoxal synthase  46.15 
 
 		 133 aa  120  5e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000264399  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4444  methylglyoxal synthase  51.64 
 
 		 126 aa  120  7e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.56391 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3368  methylglyoxal synthase  52.14 
 
 		 126 aa  120  8e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.378138  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1127  methylglyoxal synthase  45.69 
 
 		 152 aa  119  9.999999999999999e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.284898  normal  0.207413 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1185  methylglyoxal synthase  44.83 
 
 		 152 aa  119  9.999999999999999e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.408572  normal  0.64136 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1139  methylglyoxal synthase  44.83 
 
 		 152 aa  119  9.999999999999999e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.482721 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1117  methylglyoxal synthase  44.83 
 
 		 152 aa  119  9.999999999999999e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000625657 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3205  methylglyoxal synthase  44.44 
 
 		 154 aa  119  9.999999999999999e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00712521  normal  0.0289942 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2624  methylglyoxal synthase  44.44 
 
 		 154 aa  119  9.999999999999999e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.575879  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2633  methylglyoxal synthase  45.69 
 
 		 152 aa  119  9.999999999999999e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.264102  hitchhiker  0.000000301541 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2156  methylglyoxal synthase  45.69 
 
 		 152 aa  119  9.999999999999999e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.082443  normal  0.275466 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>