153 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_2527 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009253  Dred_2527  methylglyoxal synthase  100 
 
 
139 aa  285  1e-76  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1309  methylglyoxal synthase  60 
 
 
141 aa  135  2e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.871383  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1982  methylglyoxal synthase  53.45 
 
 
143 aa  133  9.999999999999999e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2382  methylglyoxal synthase  53.45 
 
 
146 aa  133  9.999999999999999e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.579764  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1275  methylglyoxal synthase  59.62 
 
 
128 aa  132  1.9999999999999998e-30  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.418994  hitchhiker  0.00000238684 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2082  methylglyoxal synthase  64.52 
 
 
120 aa  131  3e-30  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2805  methylglyoxal synthase  60 
 
 
133 aa  130  5e-30  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.321447  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1881  methylglyoxal synthase  51.72 
 
 
130 aa  130  6e-30  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.715757  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1390  methylglyoxal synthase  51.72 
 
 
130 aa  130  6e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1018  methylglyoxal synthase  51.72 
 
 
130 aa  130  6e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.736302  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1079  methylglyoxal synthase  51.72 
 
 
130 aa  130  6e-30  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.233114  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0788  methylglyoxal synthase  51.72 
 
 
130 aa  130  6e-30  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0615906  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1235  methylglyoxal synthase  51.72 
 
 
130 aa  130  6e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1244  methylglyoxal synthase  51.72 
 
 
130 aa  130  6e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.473905  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0362  methylglyoxal synthase  51.72 
 
 
130 aa  130  6e-30  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.607553  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2504  methylglyoxal synthase  58.82 
 
 
130 aa  130  6.999999999999999e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.156833  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5618  methylglyoxal synthase  50 
 
 
130 aa  129  1.0000000000000001e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0573538  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1304  methylglyoxal synthase  53.91 
 
 
129 aa  129  1.0000000000000001e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.206043  normal  0.073248 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3256  methylglyoxal synthase  53.91 
 
 
129 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.308691  normal  0.881072 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04890  Dephospho-CoA kinase  48.53 
 
 
317 aa  129  2.0000000000000002e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000544377  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1163  methylglyoxal synthase  56.44 
 
 
128 aa  128  2.0000000000000002e-29  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.618904  normal  0.0141735 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0042  methylglyoxal synthase  51.75 
 
 
127 aa  127  3e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.304097 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1257  methylglyoxal synthase  57.29 
 
 
131 aa  127  3e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.390587  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1443  methylglyoxal synthase  49.19 
 
 
131 aa  127  6e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0250107  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1556  methylglyoxal synthase  49.19 
 
 
131 aa  127  6e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2329  methylglyoxal synthase  50 
 
 
130 aa  127  6e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2207  methylglyoxal synthase  50 
 
 
130 aa  127  6e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.093882  normal  0.861141 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0987  methylglyoxal synthase  50 
 
 
130 aa  127  7.000000000000001e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1662  methylglyoxal synthase  51.82 
 
 
131 aa  126  8.000000000000001e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1700  methylglyoxal synthase  51.82 
 
 
131 aa  126  8.000000000000001e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0277502  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3756  methylglyoxal synthase  51.82 
 
 
131 aa  126  8.000000000000001e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1589  methylglyoxal synthase  51.82 
 
 
131 aa  126  8.000000000000001e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1459  methylglyoxal synthase  57.29 
 
 
131 aa  126  9.000000000000001e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0146321  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1415  methylglyoxal synthase  57.29 
 
 
131 aa  126  1.0000000000000001e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0291451  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1416  methylglyoxal synthase  57.29 
 
 
131 aa  126  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.032143  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1627  methylglyoxal synthase  57.29 
 
 
131 aa  126  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.15767 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0233  methylglyoxal synthase  57 
 
 
144 aa  126  1.0000000000000001e-28  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2126  methylglyoxal synthase  61.96 
 
 
132 aa  126  1.0000000000000001e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000882281  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2061  methylglyoxal synthase  53.04 
 
 
129 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.337955  normal  0.207657 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0707  methylglyoxal synthase  59 
 
 
120 aa  126  1.0000000000000001e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2291  methylglyoxal synthase  49.14 
 
 
130 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2314  methylglyoxal synthase  49.14 
 
 
130 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.659726 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2185  methylglyoxal synthase  52.25 
 
 
135 aa  124  3e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0445857  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1679  methylglyoxal synthase  49.14 
 
 
130 aa  124  3e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0255708  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0792  methylglyoxal synthase  57.29 
 
 
140 aa  124  4.0000000000000003e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.52468  normal  0.131121 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2484  methylglyoxal synthase  55.79 
 
 
133 aa  124  6e-28  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2123  methylglyoxal synthase  54 
 
 
140 aa  123  1e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.336211  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3450  methylglyoxal synthase  54.55 
 
 
156 aa  122  1e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000281554  hitchhiker  0.00361328 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_145  methylglyoxal synthase  57 
 
 
144 aa  122  1e-27  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0496  methylglyoxal synthase  57.29 
 
 
144 aa  122  2e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0366  methylglyoxal synthase  55.21 
 
 
126 aa  122  2e-27  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0524  methylglyoxal synthase  53.92 
 
 
126 aa  122  2e-27  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0137  methylglyoxal synthase  56 
 
 
144 aa  121  3e-27  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1481  methylglyoxal synthase  52.94 
 
 
119 aa  121  3e-27  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1265  methylglyoxal synthase  52.94 
 
 
119 aa  121  4e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.357495  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1122  methylglyoxal synthase  52.94 
 
 
126 aa  120  5e-27  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0241  methylglyoxal synthase  48.03 
 
 
137 aa  120  6e-27  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1077  methylglyoxal synthase  52.94 
 
 
119 aa  120  9e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0611  methylglyoxal synthase  59.14 
 
 
155 aa  119  9.999999999999999e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3100  methylglyoxal synthase  47.66 
 
 
159 aa  118  1.9999999999999998e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000537533  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0985  methylglyoxal synthase  53.06 
 
 
135 aa  118  3e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0342245  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0116  methylglyoxal synthase  54.74 
 
 
152 aa  118  3e-26  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.503426  normal  0.542869 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2367  methylglyoxal synthase  53.12 
 
 
133 aa  115  1.9999999999999998e-25  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000264399  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21210  methylglyoxal synthase  52.69 
 
 
148 aa  114  3.9999999999999997e-25  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.846941  normal  0.0527752 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1798  methylglyoxal synthase  56.38 
 
 
123 aa  114  5e-25  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.061495  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0967  methylglyoxal synthase  55.32 
 
 
123 aa  114  5e-25  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1906  methylglyoxal synthase  53.54 
 
 
146 aa  113  8.999999999999998e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0861  methylglyoxal synthase  54.84 
 
 
153 aa  113  1.0000000000000001e-24  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00000000142062  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2719  methylglyoxal synthase  52.69 
 
 
158 aa  112  1.0000000000000001e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1302  methylglyoxal synthase  52.13 
 
 
154 aa  112  2.0000000000000002e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000000113114  decreased coverage  0.00562878 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1628  methylglyoxal synthase  51.61 
 
 
167 aa  112  2.0000000000000002e-24  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.652172  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1568  methylglyoxal synthase  54.84 
 
 
166 aa  112  2.0000000000000002e-24  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2651  methylglyoxal synthase  52.69 
 
 
140 aa  112  2.0000000000000002e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.957792  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1634  methylglyoxal synthase  54.84 
 
 
166 aa  112  2.0000000000000002e-24  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2625  methylglyoxal synthase  52.69 
 
 
158 aa  111  3e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1240  methylglyoxal synthase  52.69 
 
 
158 aa  111  3e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.259258  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2192  methylglyoxal synthase  53.68 
 
 
122 aa  111  3e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1558  methylglyoxal synthase  43.14 
 
 
159 aa  111  4.0000000000000004e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.296029  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0594  methylglyoxal synthase  50.98 
 
 
128 aa  110  4.0000000000000004e-24  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.444681  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1215  methylglyoxal synthase  43.75 
 
 
152 aa  110  5e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.216968  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2526  methylglyoxal synthase  52.69 
 
 
160 aa  110  5e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.487727 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1475  methylglyoxal synthase  48.48 
 
 
152 aa  110  6e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.977307  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2535  methylglyoxal synthase  49.46 
 
 
154 aa  110  6e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000427082  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3205  methylglyoxal synthase  49.46 
 
 
154 aa  110  6e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00712521  normal  0.0289942 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2624  methylglyoxal synthase  49.46 
 
 
154 aa  110  6e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.575879  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1760  methylglyoxal synthase  51.61 
 
 
152 aa  110  7.000000000000001e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0497546  hitchhiker  0.0006316 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2691  methylglyoxal synthase  52.13 
 
 
152 aa  110  8.000000000000001e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2381  methylglyoxal synthase  55.91 
 
 
156 aa  109  1.0000000000000001e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0265896  normal  0.0715346 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1310  methylglyoxal synthase  50 
 
 
154 aa  109  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.225102  normal  0.598668 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2852  methylglyoxal synthase  52.13 
 
 
152 aa  109  2.0000000000000002e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.069917  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1034  methylglyoxal synthase  49.46 
 
 
152 aa  108  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.353997  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1117  methylglyoxal synthase  49.46 
 
 
152 aa  108  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000625657 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1151  methylglyoxal synthase  49.46 
 
 
152 aa  108  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1139  methylglyoxal synthase  49.46 
 
 
152 aa  108  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.482721 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1185  methylglyoxal synthase  49.46 
 
 
152 aa  108  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.408572  normal  0.64136 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2543  methylglyoxal synthase  52.13 
 
 
152 aa  108  2.0000000000000002e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00778094  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00533  methylglyoxal synthase  51.61 
 
 
136 aa  108  2.0000000000000002e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1144  methylglyoxal synthase  52.69 
 
 
155 aa  108  3e-23  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.175062  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3178  methylglyoxal synthase  48.96 
 
 
134 aa  108  3e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1391  methylglyoxal synthase  44.85 
 
 
153 aa  107  5e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000525868  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>