151 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_0116 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008709  Ping_0116  methylglyoxal synthase  100 
 
 		 152 aa  315  1e-85  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.503426  normal  0.542869 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1475  methylglyoxal synthase  64 
 
 		 152 aa  204  4e-52  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.977307  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1117  methylglyoxal synthase  62.67 
 
 		 152 aa  200  5e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000625657 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1034  methylglyoxal synthase  62.67 
 
 		 152 aa  200  5e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.353997  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1185  methylglyoxal synthase  62.67 
 
 		 152 aa  200  5e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.408572  normal  0.64136 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1151  methylglyoxal synthase  62.67 
 
 		 152 aa  200  5e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1139  methylglyoxal synthase  62.67 
 
 		 152 aa  200  5e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.482721 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1350  methylglyoxal synthase  64 
 
 		 152 aa  198  3e-50  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00967  methylglyoxal synthase  60.67 
 
 		 152 aa  196  9e-50  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.497667  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2680  methylglyoxal synthase  60.67 
 
 		 152 aa  196  9e-50  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.788486  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1127  methylglyoxal synthase  60.67 
 
 		 152 aa  196  9e-50  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.284898  normal  0.207413 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00974  hypothetical protein  60.67 
 
 		 152 aa  196  9e-50  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.651902  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1072  methylglyoxal synthase  60.67 
 
 		 152 aa  196  9e-50  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000670613  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1078  methylglyoxal synthase  60.67 
 
 		 152 aa  196  9e-50  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000897908  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1760  methylglyoxal synthase  61.33 
 
 		 152 aa  196  9e-50  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0497546  hitchhiker  0.0006316 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2633  methylglyoxal synthase  60.67 
 
 		 152 aa  196  9e-50  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.264102  hitchhiker  0.000000301541 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2156  methylglyoxal synthase  60.67 
 
 		 152 aa  196  9e-50  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.082443  normal  0.275466 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2352  methylglyoxal synthase  60.67 
 
 		 152 aa  196  9e-50  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.318065  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2852  methylglyoxal synthase  60.67 
 
 		 152 aa  196  1.0000000000000001e-49  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.069917  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06121  methylglyoxal synthase  59.6 
 
 		 151 aa  193  6e-49  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1215  methylglyoxal synthase  60.67 
 
 		 152 aa  193  9e-49  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.216968  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2133  methylglyoxal synthase  60.67 
 
 		 151 aa  191  4e-48  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0525885  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2543  methylglyoxal synthase  58.67 
 
 		 152 aa  189  9e-48  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00778094  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000319  methylglyoxal synthase  58 
 
 		 151 aa  189  1e-47  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0650  methylglyoxal synthase  58.28 
 
 		 151 aa  187  2.9999999999999997e-47  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2535  methylglyoxal synthase  58.67 
 
 		 154 aa  187  5.999999999999999e-47  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000427082  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3205  methylglyoxal synthase  58.67 
 
 		 154 aa  187  5.999999999999999e-47  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00712521  normal  0.0289942 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2624  methylglyoxal synthase  58.67 
 
 		 154 aa  187  5.999999999999999e-47  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.575879  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2691  methylglyoxal synthase  57.33 
 
 		 152 aa  185  2e-46  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1302  methylglyoxal synthase  58.55 
 
 		 154 aa  184  3e-46  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000000113114  decreased coverage  0.00562878 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1310  methylglyoxal synthase  55.33 
 
 		 154 aa  184  5e-46  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.225102  normal  0.598668 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2381  methylglyoxal synthase  62.76 
 
 		 156 aa  182  1.0000000000000001e-45  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0265896  normal  0.0715346 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0861  methylglyoxal synthase  57.33 
 
 		 153 aa  179  2e-44  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00000000142062  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1144  methylglyoxal synthase  56.16 
 
 		 155 aa  174  3e-43  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.175062  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1077  methylglyoxal synthase  51.33 
 
 		 156 aa  173  6e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.330764  hitchhiker  0.000000505204 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1558  methylglyoxal synthase  51.66 
 
 		 159 aa  170  5e-42  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.296029  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0918  methylglyoxal synthase  57.04 
 
 		 158 aa  167  7e-41  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.502742  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3450  methylglyoxal synthase  58.96 
 
 		 156 aa  165  2e-40  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000281554  hitchhiker  0.00361328 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1097  methylglyoxal synthase  56.3 
 
 		 143 aa  165  2e-40  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3100  methylglyoxal synthase  49.33 
 
 		 159 aa  164  2.9999999999999998e-40  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000537533  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0611  methylglyoxal synthase  57.14 
 
 		 155 aa  164  2.9999999999999998e-40  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21210  methylglyoxal synthase  61.11 
 
 		 148 aa  164  5e-40  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.846941  normal  0.0527752 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0703  methylglyoxal synthase  53.47 
 
 		 151 aa  162  1.0000000000000001e-39  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000171943 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1906  methylglyoxal synthase  53.85 
 
 		 146 aa  161  3e-39  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1628  methylglyoxal synthase  56.82 
 
 		 167 aa  160  7e-39  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.652172  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0985  methylglyoxal synthase  57.89 
 
 		 135 aa  155  1e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0342245  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1568  methylglyoxal synthase  54.55 
 
 		 166 aa  155  2e-37  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1634  methylglyoxal synthase  54.55 
 
 		 166 aa  155  2e-37  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2526  methylglyoxal synthase  53.03 
 
 		 160 aa  151  4e-36  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.487727 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2719  methylglyoxal synthase  51.52 
 
 		 158 aa  150  7e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1240  methylglyoxal synthase  51.52 
 
 		 158 aa  149  1e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.259258  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2625  methylglyoxal synthase  51.52 
 
 		 158 aa  149  1e-35  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1391  methylglyoxal synthase  48.91 
 
 		 153 aa  147  5e-35  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000525868  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00533  methylglyoxal synthase  52.67 
 
 		 136 aa  144  5e-34  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2894  methylglyoxal synthase  48.03 
 
 		 162 aa  140  9e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0227656 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1979  methylglyoxal synthase  49.64 
 
 		 147 aa  136  1e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00620313  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3256  methylglyoxal synthase  51.69 
 
 		 129 aa  134  5e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.308691  normal  0.881072 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1304  methylglyoxal synthase  51.69 
 
 		 129 aa  134  6.0000000000000005e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.206043  normal  0.073248 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2185  methylglyoxal synthase  48.03 
 
 		 135 aa  132  9.999999999999999e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0445857  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2061  methylglyoxal synthase  51.69 
 
 		 129 aa  133  9.999999999999999e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.337955  normal  0.207657 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04890  Dephospho-CoA kinase  48 
 
 		 317 aa  132  1.9999999999999998e-30  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000544377  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1982  methylglyoxal synthase  47.54 
 
 		 143 aa  130  7.999999999999999e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2382  methylglyoxal synthase  47.54 
 
 		 146 aa  130  7.999999999999999e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.579764  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0496  methylglyoxal synthase  48.76 
 
 		 144 aa  129  1.0000000000000001e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2805  methylglyoxal synthase  47.5 
 
 		 133 aa  128  3e-29  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.321447  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0987  methylglyoxal synthase  50.85 
 
 		 130 aa  127  4.0000000000000003e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5618  methylglyoxal synthase  50 
 
 		 130 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0573538  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2082  methylglyoxal synthase  47.41 
 
 		 120 aa  125  2.0000000000000002e-28  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0707  methylglyoxal synthase  50 
 
 		 120 aa  125  2.0000000000000002e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2291  methylglyoxal synthase  49.15 
 
 		 130 aa  125  3e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0042  methylglyoxal synthase  48.31 
 
 		 127 aa  124  3e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.304097 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2192  methylglyoxal synthase  47.46 
 
 		 122 aa  125  3e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2314  methylglyoxal synthase  49.15 
 
 		 130 aa  125  3e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.659726 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1018  methylglyoxal synthase  50 
 
 		 130 aa  124  5e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.736302  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1679  methylglyoxal synthase  49.15 
 
 		 130 aa  124  5e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0255708  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2329  methylglyoxal synthase  48.31 
 
 		 130 aa  123  1e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2207  methylglyoxal synthase  48.31 
 
 		 130 aa  123  1e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.093882  normal  0.861141 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1881  methylglyoxal synthase  49.15 
 
 		 130 aa  122  2e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.715757  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2504  methylglyoxal synthase  48.31 
 
 		 130 aa  122  2e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.156833  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1390  methylglyoxal synthase  49.15 
 
 		 130 aa  122  2e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1079  methylglyoxal synthase  49.15 
 
 		 130 aa  122  2e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.233114  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0788  methylglyoxal synthase  49.15 
 
 		 130 aa  122  2e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0615906  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1235  methylglyoxal synthase  49.15 
 
 		 130 aa  122  2e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1244  methylglyoxal synthase  49.15 
 
 		 130 aa  122  2e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.473905  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0362  methylglyoxal synthase  49.15 
 
 		 130 aa  122  2e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.607553  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1122  methylglyoxal synthase  50.88 
 
 		 126 aa  122  2e-27  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0792  methylglyoxal synthase  46.61 
 
 		 140 aa  121  4e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.52468  normal  0.131121 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2123  methylglyoxal synthase  45.45 
 
 		 140 aa  121  4e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.336211  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1706  methylglyoxal synthase  45.08 
 
 		 130 aa  121  4e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0967  methylglyoxal synthase  45.3 
 
 		 123 aa  121  4e-27  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2126  methylglyoxal synthase  46.28 
 
 		 132 aa  121  4e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000882281  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1001  methylglyoxal synthase  45.38 
 
 		 146 aa  120  5e-27  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.187835 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1275  methylglyoxal synthase  48.65 
 
 		 128 aa  120  7e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.418994  hitchhiker  0.00000238684 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1163  methylglyoxal synthase  48.28 
 
 		 128 aa  120  8e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.618904  normal  0.0141735 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3178  methylglyoxal synthase  45.61 
 
 		 134 aa  120  8e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1309  methylglyoxal synthase  49.17 
 
 		 141 aa  120  9.999999999999999e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.871383  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0241  methylglyoxal synthase  46.77 
 
 		 137 aa  119  9.999999999999999e-27  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0524  methylglyoxal synthase  48.7 
 
 		 126 aa  119  9.999999999999999e-27  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1459  methylglyoxal synthase  43.8 
 
 		 131 aa  119  1.9999999999999998e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0146321  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2527  methylglyoxal synthase  54.74 
 
 		 139 aa  118  3e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>