151 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_3100 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010001  Cphy_3100  methylglyoxal synthase  100 
 
 
159 aa  330  3e-90  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000537533  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1391  methylglyoxal synthase  62.5 
 
 
153 aa  195  2.0000000000000003e-49  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000525868  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0861  methylglyoxal synthase  57.33 
 
 
153 aa  176  2e-43  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00000000142062  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0611  methylglyoxal synthase  55.7 
 
 
155 aa  174  4e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2691  methylglyoxal synthase  52.41 
 
 
152 aa  168  3e-41  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2625  methylglyoxal synthase  56.39 
 
 
158 aa  167  8e-41  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2852  methylglyoxal synthase  50.67 
 
 
152 aa  166  1e-40  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.069917  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1077  methylglyoxal synthase  49.32 
 
 
156 aa  166  1e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.330764  hitchhiker  0.000000505204 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06121  methylglyoxal synthase  51.39 
 
 
151 aa  166  1e-40  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00967  methylglyoxal synthase  51.03 
 
 
152 aa  165  2e-40  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.497667  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2680  methylglyoxal synthase  51.03 
 
 
152 aa  165  2e-40  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.788486  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2719  methylglyoxal synthase  55.64 
 
 
158 aa  166  2e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2381  methylglyoxal synthase  51.02 
 
 
156 aa  165  2e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0265896  normal  0.0715346 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00974  hypothetical protein  51.03 
 
 
152 aa  165  2e-40  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.651902  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1127  methylglyoxal synthase  51.03 
 
 
152 aa  165  2e-40  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.284898  normal  0.207413 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1215  methylglyoxal synthase  50 
 
 
152 aa  166  2e-40  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.216968  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1072  methylglyoxal synthase  51.03 
 
 
152 aa  165  2e-40  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000670613  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1078  methylglyoxal synthase  51.03 
 
 
152 aa  165  2e-40  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000897908  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2633  methylglyoxal synthase  51.03 
 
 
152 aa  165  2e-40  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.264102  hitchhiker  0.000000301541 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2156  methylglyoxal synthase  51.03 
 
 
152 aa  165  2e-40  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.082443  normal  0.275466 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2352  methylglyoxal synthase  51.03 
 
 
152 aa  165  2e-40  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.318065  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000319  methylglyoxal synthase  51.03 
 
 
151 aa  165  2e-40  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1144  methylglyoxal synthase  55.07 
 
 
155 aa  166  2e-40  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.175062  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1240  methylglyoxal synthase  55.64 
 
 
158 aa  165  2.9999999999999998e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.259258  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2543  methylglyoxal synthase  50.67 
 
 
152 aa  164  2.9999999999999998e-40  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00778094  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1475  methylglyoxal synthase  51.03 
 
 
152 aa  165  2.9999999999999998e-40  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.977307  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1760  methylglyoxal synthase  50.34 
 
 
152 aa  164  2.9999999999999998e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0497546  hitchhiker  0.0006316 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0116  methylglyoxal synthase  49.33 
 
 
152 aa  164  4e-40  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.503426  normal  0.542869 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0650  methylglyoxal synthase  50.69 
 
 
151 aa  164  4e-40  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2526  methylglyoxal synthase  53.96 
 
 
160 aa  164  4e-40  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.487727 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1302  methylglyoxal synthase  53.24 
 
 
154 aa  164  5e-40  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000000113114  decreased coverage  0.00562878 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1034  methylglyoxal synthase  49.66 
 
 
152 aa  161  3e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.353997  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1558  methylglyoxal synthase  50 
 
 
159 aa  162  3e-39  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.296029  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1139  methylglyoxal synthase  49.66 
 
 
152 aa  161  3e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.482721 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1185  methylglyoxal synthase  49.66 
 
 
152 aa  161  3e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.408572  normal  0.64136 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1151  methylglyoxal synthase  49.66 
 
 
152 aa  161  3e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1117  methylglyoxal synthase  49.66 
 
 
152 aa  161  3e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000625657 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1568  methylglyoxal synthase  52.78 
 
 
166 aa  160  6e-39  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1634  methylglyoxal synthase  52.78 
 
 
166 aa  160  6e-39  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1350  methylglyoxal synthase  46.94 
 
 
152 aa  160  9e-39  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2133  methylglyoxal synthase  50 
 
 
151 aa  159  1e-38  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0525885  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0703  methylglyoxal synthase  52.82 
 
 
151 aa  158  3e-38  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000000171943 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2535  methylglyoxal synthase  47.95 
 
 
154 aa  156  9e-38  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000427082  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3205  methylglyoxal synthase  47.95 
 
 
154 aa  156  9e-38  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00712521  normal  0.0289942 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2624  methylglyoxal synthase  47.95 
 
 
154 aa  156  9e-38  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.575879  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1310  methylglyoxal synthase  45.83 
 
 
154 aa  155  3e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.225102  normal  0.598668 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0985  methylglyoxal synthase  54.89 
 
 
135 aa  153  1e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0342245  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21210  methylglyoxal synthase  54.76 
 
 
148 aa  152  2e-36  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.846941  normal  0.0527752 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1628  methylglyoxal synthase  53.44 
 
 
167 aa  152  2e-36  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.652172  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0918  methylglyoxal synthase  52.63 
 
 
158 aa  152  2e-36  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.502742  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3450  methylglyoxal synthase  54.2 
 
 
156 aa  150  5e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000281554  hitchhiker  0.00361328 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1097  methylglyoxal synthase  52.27 
 
 
143 aa  150  5e-36  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1906  methylglyoxal synthase  56.45 
 
 
146 aa  149  1e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0707  methylglyoxal synthase  55.17 
 
 
120 aa  144  4.0000000000000006e-34  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00533  methylglyoxal synthase  52.67 
 
 
136 aa  142  1e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2894  methylglyoxal synthase  50.35 
 
 
162 aa  143  1e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0227656 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04890  Dephospho-CoA kinase  53.6 
 
 
317 aa  140  7e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000544377  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2651  methylglyoxal synthase  51.22 
 
 
140 aa  137  6e-32  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.957792  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1275  methylglyoxal synthase  51.56 
 
 
128 aa  136  1e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.418994  hitchhiker  0.00000238684 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1309  methylglyoxal synthase  48.94 
 
 
141 aa  133  9.999999999999999e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.871383  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2805  methylglyoxal synthase  53.04 
 
 
133 aa  133  9.999999999999999e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.321447  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1443  methylglyoxal synthase  53.51 
 
 
131 aa  132  1.9999999999999998e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0250107  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1556  methylglyoxal synthase  53.51 
 
 
131 aa  132  1.9999999999999998e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2484  methylglyoxal synthase  47.33 
 
 
133 aa  132  1.9999999999999998e-30  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1163  methylglyoxal synthase  50.85 
 
 
128 aa  132  1.9999999999999998e-30  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.618904  normal  0.0141735 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1662  methylglyoxal synthase  53.51 
 
 
131 aa  131  3e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1979  methylglyoxal synthase  42.66 
 
 
147 aa  131  3e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00620313  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1589  methylglyoxal synthase  53.51 
 
 
131 aa  131  3e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3756  methylglyoxal synthase  53.51 
 
 
131 aa  131  3e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2082  methylglyoxal synthase  50.86 
 
 
120 aa  132  3e-30  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1700  methylglyoxal synthase  53.51 
 
 
131 aa  131  3e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0277502  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1415  methylglyoxal synthase  53.51 
 
 
131 aa  131  3.9999999999999996e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0291451  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1416  methylglyoxal synthase  53.51 
 
 
131 aa  131  3.9999999999999996e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.032143  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1627  methylglyoxal synthase  53.51 
 
 
131 aa  131  3.9999999999999996e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.15767 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1257  methylglyoxal synthase  52.63 
 
 
131 aa  130  6.999999999999999e-30  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.390587  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0496  methylglyoxal synthase  52.63 
 
 
144 aa  130  9e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1001  methylglyoxal synthase  48.85 
 
 
146 aa  130  1.0000000000000001e-29  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.187835 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1459  methylglyoxal synthase  52.63 
 
 
131 aa  129  2.0000000000000002e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0146321  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0967  methylglyoxal synthase  53.04 
 
 
123 aa  128  3e-29  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1122  methylglyoxal synthase  53.91 
 
 
126 aa  128  3e-29  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2291  methylglyoxal synthase  53.51 
 
 
130 aa  127  4.0000000000000003e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2314  methylglyoxal synthase  53.51 
 
 
130 aa  127  4.0000000000000003e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.659726 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2192  methylglyoxal synthase  50.43 
 
 
122 aa  127  5.0000000000000004e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2123  methylglyoxal synthase  50.88 
 
 
140 aa  127  5.0000000000000004e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.336211  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1018  methylglyoxal synthase  52.54 
 
 
130 aa  127  6e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.736302  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0241  methylglyoxal synthase  53.45 
 
 
137 aa  127  7.000000000000001e-29  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1679  methylglyoxal synthase  53.51 
 
 
130 aa  126  9.000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0255708  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1881  methylglyoxal synthase  51.69 
 
 
130 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.715757  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1390  methylglyoxal synthase  51.69 
 
 
130 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1079  methylglyoxal synthase  51.69 
 
 
130 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.233114  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0788  methylglyoxal synthase  51.69 
 
 
130 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0615906  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1235  methylglyoxal synthase  51.69 
 
 
130 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1244  methylglyoxal synthase  51.69 
 
 
130 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.473905  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0362  methylglyoxal synthase  51.69 
 
 
130 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.607553  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_145  methylglyoxal synthase  51.75 
 
 
144 aa  125  2.0000000000000002e-28  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0233  methylglyoxal synthase  51.75 
 
 
144 aa  125  2.0000000000000002e-28  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0987  methylglyoxal synthase  50.41 
 
 
130 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5618  methylglyoxal synthase  53.51 
 
 
130 aa  125  3e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0573538  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1077  methylglyoxal synthase  48.7 
 
 
119 aa  125  3e-28  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0792  methylglyoxal synthase  49.17 
 
 
140 aa  124  5e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.52468  normal  0.131121 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>