151 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_2543 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012917  PC1_2543  methylglyoxal synthase  100 
 
 		 152 aa  316  7e-86  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00778094  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2852  methylglyoxal synthase  97.37 
 
 		 152 aa  308  1e-83  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.069917  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1215  methylglyoxal synthase  83.55 
 
 		 152 aa  276  5e-74  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.216968  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2691  methylglyoxal synthase  83.55 
 
 		 152 aa  275  2e-73  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1760  methylglyoxal synthase  82.89 
 
 		 152 aa  268  2e-71  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0497546  hitchhiker  0.0006316 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2535  methylglyoxal synthase  76.16 
 
 		 154 aa  247  4e-65  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000427082  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3205  methylglyoxal synthase  76.16 
 
 		 154 aa  247  4e-65  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00712521  normal  0.0289942 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2624  methylglyoxal synthase  76.16 
 
 		 154 aa  247  4e-65  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.575879  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00967  methylglyoxal synthase  75.66 
 
 		 152 aa  242  9.999999999999999e-64  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.497667  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2680  methylglyoxal synthase  75.66 
 
 		 152 aa  242  9.999999999999999e-64  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.788486  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1127  methylglyoxal synthase  75.66 
 
 		 152 aa  242  9.999999999999999e-64  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.284898  normal  0.207413 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00974  hypothetical protein  75.66 
 
 		 152 aa  242  9.999999999999999e-64  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.651902  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1072  methylglyoxal synthase  75.66 
 
 		 152 aa  242  9.999999999999999e-64  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000670613  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1078  methylglyoxal synthase  75.66 
 
 		 152 aa  242  9.999999999999999e-64  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000897908  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2633  methylglyoxal synthase  75.66 
 
 		 152 aa  242  9.999999999999999e-64  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.264102  hitchhiker  0.000000301541 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2156  methylglyoxal synthase  75.66 
 
 		 152 aa  242  9.999999999999999e-64  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.082443  normal  0.275466 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2352  methylglyoxal synthase  75.66 
 
 		 152 aa  242  9.999999999999999e-64  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.318065  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1139  methylglyoxal synthase  73.68 
 
 		 152 aa  238  2.9999999999999997e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.482721 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1185  methylglyoxal synthase  73.68 
 
 		 152 aa  238  2.9999999999999997e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.408572  normal  0.64136 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1151  methylglyoxal synthase  73.68 
 
 		 152 aa  238  2.9999999999999997e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1117  methylglyoxal synthase  73.68 
 
 		 152 aa  238  2.9999999999999997e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000625657 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1034  methylglyoxal synthase  73.68 
 
 		 152 aa  238  2.9999999999999997e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.353997  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0650  methylglyoxal synthase  72 
 
 		 151 aa  236  5.999999999999999e-62  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1475  methylglyoxal synthase  71.71 
 
 		 152 aa  230  5e-60  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.977307  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000319  methylglyoxal synthase  68.21 
 
 		 151 aa  228  2e-59  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06121  methylglyoxal synthase  69.33 
 
 		 151 aa  227  6e-59  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1350  methylglyoxal synthase  67.11 
 
 		 152 aa  222  1e-57  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2133  methylglyoxal synthase  66.89 
 
 		 151 aa  219  9.999999999999999e-57  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0525885  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0116  methylglyoxal synthase  58.67 
 
 		 152 aa  189  9e-48  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.503426  normal  0.542869 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1310  methylglyoxal synthase  55.33 
 
 		 154 aa  189  1e-47  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.225102  normal  0.598668 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1077  methylglyoxal synthase  57.14 
 
 		 156 aa  189  1e-47  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.330764  hitchhiker  0.000000505204 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1302  methylglyoxal synthase  55.92 
 
 		 154 aa  188  2.9999999999999997e-47  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000000113114  decreased coverage  0.00562878 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0861  methylglyoxal synthase  56.29 
 
 		 153 aa  185  2e-46  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00000000142062  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0611  methylglyoxal synthase  57.93 
 
 		 155 aa  178  2e-44  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2381  methylglyoxal synthase  55.63 
 
 		 156 aa  177  2.9999999999999997e-44  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0265896  normal  0.0715346 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1240  methylglyoxal synthase  57.75 
 
 		 158 aa  173  9e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.259258  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1144  methylglyoxal synthase  54.79 
 
 		 155 aa  173  9e-43  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.175062  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2719  methylglyoxal synthase  57.75 
 
 		 158 aa  172  9.999999999999999e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2625  methylglyoxal synthase  57.04 
 
 		 158 aa  171  2.9999999999999996e-42  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1568  methylglyoxal synthase  55.63 
 
 		 166 aa  169  2e-41  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2526  methylglyoxal synthase  54.67 
 
 		 160 aa  168  2e-41  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.487727 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1634  methylglyoxal synthase  55.63 
 
 		 166 aa  169  2e-41  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0985  methylglyoxal synthase  59.7 
 
 		 135 aa  167  6e-41  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0342245  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1391  methylglyoxal synthase  55.15 
 
 		 153 aa  167  6e-41  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000525868  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1628  methylglyoxal synthase  54.81 
 
 		 167 aa  166  8e-41  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.652172  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3100  methylglyoxal synthase  50.67 
 
 		 159 aa  164  2.9999999999999998e-40  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000537533  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1558  methylglyoxal synthase  50.68 
 
 		 159 aa  163  9e-40  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.296029  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3450  methylglyoxal synthase  58.21 
 
 		 156 aa  161  3e-39  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000281554  hitchhiker  0.00361328 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0703  methylglyoxal synthase  53.52 
 
 		 151 aa  159  9e-39  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000171943 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0918  methylglyoxal synthase  54.07 
 
 		 158 aa  157  4e-38  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.502742  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1906  methylglyoxal synthase  54.68 
 
 		 146 aa  157  5e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1097  methylglyoxal synthase  53.33 
 
 		 143 aa  156  9e-38  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21210  methylglyoxal synthase  57.02 
 
 		 148 aa  152  1e-36  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.846941  normal  0.0527752 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00533  methylglyoxal synthase  59.84 
 
 		 136 aa  151  4e-36  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2894  methylglyoxal synthase  50 
 
 		 162 aa  145  2.0000000000000003e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0227656 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1979  methylglyoxal synthase  47.89 
 
 		 147 aa  142  1e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00620313  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1309  methylglyoxal synthase  56.41 
 
 		 141 aa  133  8e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.871383  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1001  methylglyoxal synthase  47.33 
 
 		 146 aa  131  3e-30  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.187835 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2123  methylglyoxal synthase  50.86 
 
 		 140 aa  128  4.0000000000000003e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.336211  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0496  methylglyoxal synthase  50.86 
 
 		 144 aa  127  5.0000000000000004e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2072  methylglyoxal synthase  51.72 
 
 		 126 aa  127  6e-29  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.246305  normal  0.326665 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2068  methylglyoxal synthase  52.5 
 
 		 155 aa  126  1.0000000000000001e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1275  methylglyoxal synthase  53.64 
 
 		 128 aa  126  1.0000000000000001e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.418994  hitchhiker  0.00000238684 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0707  methylglyoxal synthase  53.39 
 
 		 120 aa  126  1.0000000000000001e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1248  methylglyoxal synthase  52.17 
 
 		 126 aa  125  2.0000000000000002e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.10803  normal  0.0156923 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2192  methylglyoxal synthase  46.15 
 
 		 122 aa  124  4.0000000000000003e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1443  methylglyoxal synthase  50 
 
 		 131 aa  124  4.0000000000000003e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0250107  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1556  methylglyoxal synthase  50 
 
 		 131 aa  124  4.0000000000000003e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2082  methylglyoxal synthase  49.15 
 
 		 120 aa  124  4.0000000000000003e-28  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2805  methylglyoxal synthase  50 
 
 		 133 aa  124  5e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.321447  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1459  methylglyoxal synthase  50 
 
 		 131 aa  124  7e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0146321  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1589  methylglyoxal synthase  50 
 
 		 131 aa  123  9e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1662  methylglyoxal synthase  50 
 
 		 131 aa  123  9e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1415  methylglyoxal synthase  50 
 
 		 131 aa  123  9e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0291451  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1416  methylglyoxal synthase  50 
 
 		 131 aa  123  9e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.032143  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1627  methylglyoxal synthase  50 
 
 		 131 aa  123  9e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.15767 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0241  methylglyoxal synthase  49.59 
 
 		 137 aa  123  9e-28  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1700  methylglyoxal synthase  50 
 
 		 131 aa  123  9e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0277502  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3756  methylglyoxal synthase  50 
 
 		 131 aa  123  9e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1257  methylglyoxal synthase  49.14 
 
 		 131 aa  123  1e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.390587  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2126  methylglyoxal synthase  50.43 
 
 		 132 aa  122  1e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000882281  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1048  methylglyoxal synthase  49.15 
 
 		 125 aa  122  2e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.171658  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04890  Dephospho-CoA kinase  48.33 
 
 		 317 aa  122  2e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000544377  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0986  methylglyoxal synthase  49.15 
 
 		 125 aa  122  2e-27  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2185  methylglyoxal synthase  47.2 
 
 		 135 aa  121  4e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0445857  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1982  methylglyoxal synthase  46.56 
 
 		 143 aa  121  4e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3368  methylglyoxal synthase  49.18 
 
 		 126 aa  121  4e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.378138  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2382  methylglyoxal synthase  46.92 
 
 		 146 aa  120  5e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.579764  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1333  methylglyoxal synthase  47.46 
 
 		 125 aa  120  7e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.714194  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0366  methylglyoxal synthase  50.85 
 
 		 126 aa  120  9e-27  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0792  methylglyoxal synthase  46.61 
 
 		 140 aa  118  1.9999999999999998e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.52468  normal  0.131121 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1077  methylglyoxal synthase  46.49 
 
 		 119 aa  119  1.9999999999999998e-26  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0967  methylglyoxal synthase  47.9 
 
 		 123 aa  119  1.9999999999999998e-26  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3595  methylglyoxal synthase  47.69 
 
 		 137 aa  118  3e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1265  methylglyoxal synthase  45.61 
 
 		 119 aa  118  3e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.357495  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1018  methylglyoxal synthase  45.6 
 
 		 130 aa  117  3.9999999999999996e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.736302  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2291  methylglyoxal synthase  46.22 
 
 		 130 aa  117  4.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0233  methylglyoxal synthase  44.8 
 
 		 144 aa  117  4.9999999999999996e-26  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2314  methylglyoxal synthase  46.22 
 
 		 130 aa  117  4.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.659726 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1679  methylglyoxal synthase  46.22 
 
 		 130 aa  117  7e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0255708  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>