151 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A2068 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A2068  methylglyoxal synthase  100 
 
 		 155 aa  320  6e-87  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1248  methylglyoxal synthase  60.68 
 
 		 126 aa  146  1.0000000000000001e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.10803  normal  0.0156923 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2894  methylglyoxal synthase  54.55 
 
 		 162 aa  144  3e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0227656 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1568  methylglyoxal synthase  57.02 
 
 		 166 aa  145  3e-34  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1634  methylglyoxal synthase  57.02 
 
 		 166 aa  145  3e-34  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1979  methylglyoxal synthase  50 
 
 		 147 aa  144  4.0000000000000006e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00620313  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0611  methylglyoxal synthase  53.54 
 
 		 155 aa  142  2e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1628  methylglyoxal synthase  56 
 
 		 167 aa  140  6e-33  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.652172  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1906  methylglyoxal synthase  48.61 
 
 		 146 aa  140  7e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2625  methylglyoxal synthase  55.37 
 
 		 158 aa  140  7e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1240  methylglyoxal synthase  55.37 
 
 		 158 aa  139  9.999999999999999e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.259258  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2719  methylglyoxal synthase  55.37 
 
 		 158 aa  139  9.999999999999999e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2526  methylglyoxal synthase  54.55 
 
 		 160 aa  137  4.999999999999999e-32  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.487727 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0985  methylglyoxal synthase  56.1 
 
 		 135 aa  136  1e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0342245  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1144  methylglyoxal synthase  51.77 
 
 		 155 aa  136  1e-31  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.175062  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1077  methylglyoxal synthase  51.59 
 
 		 156 aa  134  7.000000000000001e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.330764  hitchhiker  0.000000505204 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1760  methylglyoxal synthase  55.28 
 
 		 152 aa  133  8e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0497546  hitchhiker  0.0006316 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0861  methylglyoxal synthase  48.25 
 
 		 153 aa  132  9.999999999999999e-31  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00000000142062  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0918  methylglyoxal synthase  44.76 
 
 		 158 aa  132  9.999999999999999e-31  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.502742  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1097  methylglyoxal synthase  44.06 
 
 		 143 aa  132  1.9999999999999998e-30  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1302  methylglyoxal synthase  48.63 
 
 		 154 aa  132  3e-30  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000000113114  decreased coverage  0.00562878 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0703  methylglyoxal synthase  49.24 
 
 		 151 aa  131  3e-30  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000171943 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00533  methylglyoxal synthase  52.85 
 
 		 136 aa  131  3.9999999999999996e-30  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21210  methylglyoxal synthase  54.17 
 
 		 148 aa  130  5e-30  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.846941  normal  0.0527752 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3450  methylglyoxal synthase  53.54 
 
 		 156 aa  130  6e-30  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000281554  hitchhiker  0.00361328 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1350  methylglyoxal synthase  56.67 
 
 		 152 aa  130  6.999999999999999e-30  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3368  methylglyoxal synthase  55.08 
 
 		 126 aa  130  6.999999999999999e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.378138  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2852  methylglyoxal synthase  51.59 
 
 		 152 aa  129  2.0000000000000002e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.069917  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1048  methylglyoxal synthase  50.85 
 
 		 125 aa  128  3e-29  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.171658  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0986  methylglyoxal synthase  50.85 
 
 		 125 aa  128  3e-29  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1333  methylglyoxal synthase  50.83 
 
 		 125 aa  128  3e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.714194  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1215  methylglyoxal synthase  53.33 
 
 		 152 aa  128  4.0000000000000003e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.216968  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2691  methylglyoxal synthase  54.17 
 
 		 152 aa  127  4.0000000000000003e-29  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4444  methylglyoxal synthase  56.76 
 
 		 126 aa  127  7.000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.56391 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1558  methylglyoxal synthase  47.18 
 
 		 159 aa  125  1.0000000000000001e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.296029  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2543  methylglyoxal synthase  52.5 
 
 		 152 aa  126  1.0000000000000001e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00778094  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1391  methylglyoxal synthase  49.58 
 
 		 153 aa  125  2.0000000000000002e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000525868  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2381  methylglyoxal synthase  47.76 
 
 		 156 aa  125  2.0000000000000002e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0265896  normal  0.0715346 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1117  methylglyoxal synthase  50.79 
 
 		 152 aa  124  4.0000000000000003e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000625657 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1151  methylglyoxal synthase  50.79 
 
 		 152 aa  124  4.0000000000000003e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2133  methylglyoxal synthase  50.81 
 
 		 151 aa  124  4.0000000000000003e-28  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0525885  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1185  methylglyoxal synthase  50.79 
 
 		 152 aa  124  4.0000000000000003e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.408572  normal  0.64136 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1139  methylglyoxal synthase  50.79 
 
 		 152 aa  124  4.0000000000000003e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.482721 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1034  methylglyoxal synthase  50.79 
 
 		 152 aa  124  4.0000000000000003e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.353997  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2535  methylglyoxal synthase  50.81 
 
 		 154 aa  124  6e-28  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000427082  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3205  methylglyoxal synthase  50.81 
 
 		 154 aa  124  6e-28  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00712521  normal  0.0289942 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2624  methylglyoxal synthase  50.81 
 
 		 154 aa  124  6e-28  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.575879  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3100  methylglyoxal synthase  50.43 
 
 		 159 aa  123  7e-28  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000537533  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1310  methylglyoxal synthase  48.84 
 
 		 154 aa  123  8.000000000000001e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.225102  normal  0.598668 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00967  methylglyoxal synthase  50.79 
 
 		 152 aa  123  9e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.497667  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2680  methylglyoxal synthase  50.79 
 
 		 152 aa  123  9e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.788486  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00974  hypothetical protein  50.79 
 
 		 152 aa  123  9e-28  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.651902  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1127  methylglyoxal synthase  50.79 
 
 		 152 aa  123  9e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.284898  normal  0.207413 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06121  methylglyoxal synthase  50.4 
 
 		 151 aa  123  9e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1072  methylglyoxal synthase  50.79 
 
 		 152 aa  123  9e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000670613  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1078  methylglyoxal synthase  50.79 
 
 		 152 aa  123  9e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000897908  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2633  methylglyoxal synthase  50.79 
 
 		 152 aa  123  9e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.264102  hitchhiker  0.000000301541 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2156  methylglyoxal synthase  50.79 
 
 		 152 aa  123  9e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.082443  normal  0.275466 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2352  methylglyoxal synthase  50.79 
 
 		 152 aa  123  9e-28  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.318065  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000319  methylglyoxal synthase  50.4 
 
 		 151 aa  123  1e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4130  methylglyoxal synthase  54.05 
 
 		 126 aa  122  2e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.070186  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1475  methylglyoxal synthase  49.21 
 
 		 152 aa  122  3e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.977307  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0650  methylglyoxal synthase  50.83 
 
 		 151 aa  120  8e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3595  methylglyoxal synthase  53.91 
 
 		 137 aa  118  3e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0240  methylglyoxal synthase  49.15 
 
 		 126 aa  117  3.9999999999999996e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.822912  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1001  methylglyoxal synthase  48.06 
 
 		 146 aa  115  3e-25  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.187835 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2072  methylglyoxal synthase  52.59 
 
 		 126 aa  115  3e-25  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.246305  normal  0.326665 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0116  methylglyoxal synthase  50.81 
 
 		 152 aa  112  2.0000000000000002e-24  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.503426  normal  0.542869 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1309  methylglyoxal synthase  47.06 
 
 		 141 aa  111  3e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.871383  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2805  methylglyoxal synthase  38.97 
 
 		 133 aa  111  5e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.321447  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1275  methylglyoxal synthase  45.3 
 
 		 128 aa  108  3e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.418994  hitchhiker  0.00000238684 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2123  methylglyoxal synthase  46.72 
 
 		 140 aa  107  5e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.336211  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0366  methylglyoxal synthase  46.96 
 
 		 126 aa  107  6e-23  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0496  methylglyoxal synthase  45.3 
 
 		 144 aa  106  1e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2082  methylglyoxal synthase  43.59 
 
 		 120 aa  105  2e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0233  methylglyoxal synthase  43.48 
 
 		 144 aa  105  2e-22  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_145  methylglyoxal synthase  43.48 
 
 		 144 aa  105  2e-22  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0707  methylglyoxal synthase  42.15 
 
 		 120 aa  104  4e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1443  methylglyoxal synthase  44.44 
 
 		 131 aa  103  7e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0250107  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1556  methylglyoxal synthase  44.44 
 
 		 131 aa  103  7e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1662  methylglyoxal synthase  44.44 
 
 		 131 aa  103  8e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1589  methylglyoxal synthase  44.44 
 
 		 131 aa  103  8e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3756  methylglyoxal synthase  44.44 
 
 		 131 aa  103  8e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1700  methylglyoxal synthase  44.44 
 
 		 131 aa  103  8e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0277502  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1415  methylglyoxal synthase  44.44 
 
 		 131 aa  103  1e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0291451  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1416  methylglyoxal synthase  44.44 
 
 		 131 aa  103  1e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.032143  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1627  methylglyoxal synthase  44.44 
 
 		 131 aa  103  1e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.15767 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1265  methylglyoxal synthase  43.22 
 
 		 119 aa  102  2e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.357495  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1257  methylglyoxal synthase  44.92 
 
 		 131 aa  102  2e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.390587  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1459  methylglyoxal synthase  43.59 
 
 		 131 aa  102  2e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0146321  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0241  methylglyoxal synthase  44.07 
 
 		 137 aa  101  3e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2185  methylglyoxal synthase  44.26 
 
 		 135 aa  101  5e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0445857  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0524  methylglyoxal synthase  42.11 
 
 		 126 aa  100  5e-21  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1982  methylglyoxal synthase  43.31 
 
 		 143 aa  100  5e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2504  methylglyoxal synthase  45.9 
 
 		 130 aa  100  6e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.156833  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2382  methylglyoxal synthase  43.31 
 
 		 146 aa  100  6e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.579764  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1077  methylglyoxal synthase  41.88 
 
 		 119 aa  100  7e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2484  methylglyoxal synthase  42.61 
 
 		 133 aa  99  2e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0137  methylglyoxal synthase  41.74 
 
 		 144 aa  98.6  3e-20  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2126  methylglyoxal synthase  40.48 
 
 		 132 aa  98.2  3e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000882281  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>