151 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_1982 on replicon NC_012856
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012856  Rpic12D_1982  methylglyoxal synthase  100 
 
 		 143 aa  294  3e-79  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2382  methylglyoxal synthase  97.95 
 
 		 146 aa  288  2e-77  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.579764  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2185  methylglyoxal synthase  88.72 
 
 		 135 aa  248  2e-65  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0445857  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2504  methylglyoxal synthase  81.6 
 
 		 130 aa  214  4e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.156833  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0792  methylglyoxal synthase  80.49 
 
 		 140 aa  208  2e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.52468  normal  0.131121 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1304  methylglyoxal synthase  75.42 
 
 		 129 aa  189  2e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.206043  normal  0.073248 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2061  methylglyoxal synthase  74.58 
 
 		 129 aa  187  5e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.337955  normal  0.207657 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3256  methylglyoxal synthase  74.58 
 
 		 129 aa  187  5.999999999999999e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.308691  normal  0.881072 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0042  methylglyoxal synthase  70.34 
 
 		 127 aa  174  5e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.304097 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0987  methylglyoxal synthase  65.87 
 
 		 130 aa  172  9.999999999999999e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1881  methylglyoxal synthase  68.33 
 
 		 130 aa  171  2.9999999999999996e-42  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.715757  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1390  methylglyoxal synthase  68.33 
 
 		 130 aa  171  2.9999999999999996e-42  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1079  methylglyoxal synthase  68.33 
 
 		 130 aa  171  2.9999999999999996e-42  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.233114  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0788  methylglyoxal synthase  68.33 
 
 		 130 aa  171  2.9999999999999996e-42  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0615906  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1235  methylglyoxal synthase  68.33 
 
 		 130 aa  171  2.9999999999999996e-42  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1244  methylglyoxal synthase  68.33 
 
 		 130 aa  171  2.9999999999999996e-42  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.473905  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0362  methylglyoxal synthase  68.33 
 
 		 130 aa  171  2.9999999999999996e-42  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.607553  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1018  methylglyoxal synthase  66.67 
 
 		 130 aa  170  5.999999999999999e-42  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.736302  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5618  methylglyoxal synthase  65.57 
 
 		 130 aa  166  7e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0573538  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2291  methylglyoxal synthase  65.57 
 
 		 130 aa  166  7e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2314  methylglyoxal synthase  65.57 
 
 		 130 aa  166  7e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.659726 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04890  Dephospho-CoA kinase  60.66 
 
 		 317 aa  166  8e-41  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000544377  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1679  methylglyoxal synthase  64.75 
 
 		 130 aa  165  2e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0255708  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2329  methylglyoxal synthase  65.57 
 
 		 130 aa  164  2.9999999999999998e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2207  methylglyoxal synthase  65.57 
 
 		 130 aa  164  2.9999999999999998e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.093882  normal  0.861141 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1275  methylglyoxal synthase  60.5 
 
 		 128 aa  157  3e-38  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.418994  hitchhiker  0.00000238684 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1415  methylglyoxal synthase  54.69 
 
 		 131 aa  152  1e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0291451  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1416  methylglyoxal synthase  54.69 
 
 		 131 aa  152  1e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.032143  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1627  methylglyoxal synthase  54.69 
 
 		 131 aa  152  1e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.15767 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0524  methylglyoxal synthase  56.67 
 
 		 126 aa  151  2e-36  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1459  methylglyoxal synthase  53.91 
 
 		 131 aa  152  2e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0146321  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1700  methylglyoxal synthase  53.91 
 
 		 131 aa  151  2.9999999999999998e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0277502  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1662  methylglyoxal synthase  53.91 
 
 		 131 aa  151  2.9999999999999998e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0366  methylglyoxal synthase  51.22 
 
 		 126 aa  151  2.9999999999999998e-36  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3756  methylglyoxal synthase  53.91 
 
 		 131 aa  151  2.9999999999999998e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1589  methylglyoxal synthase  53.91 
 
 		 131 aa  151  2.9999999999999998e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1257  methylglyoxal synthase  57.5 
 
 		 131 aa  151  2.9999999999999998e-36  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.390587  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1443  methylglyoxal synthase  53.91 
 
 		 131 aa  150  4e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0250107  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1556  methylglyoxal synthase  53.91 
 
 		 131 aa  150  4e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3178  methylglyoxal synthase  55.65 
 
 		 134 aa  150  4e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2484  methylglyoxal synthase  60 
 
 		 133 aa  150  5e-36  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0194  methylglyoxal synthase  56.78 
 
 		 122 aa  150  8e-36  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0967  methylglyoxal synthase  58.12 
 
 		 123 aa  149  8.999999999999999e-36  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1309  methylglyoxal synthase  57.48 
 
 		 141 aa  149  8.999999999999999e-36  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.871383  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2192  methylglyoxal synthase  57.63 
 
 		 122 aa  149  1e-35  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0241  methylglyoxal synthase  61.54 
 
 		 137 aa  148  2e-35  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2123  methylglyoxal synthase  53.33 
 
 		 140 aa  147  4e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.336211  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0496  methylglyoxal synthase  55.83 
 
 		 144 aa  146  9e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1163  methylglyoxal synthase  56.45 
 
 		 128 aa  146  1.0000000000000001e-34  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.618904  normal  0.0141735 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1122  methylglyoxal synthase  56.67 
 
 		 126 aa  145  1.0000000000000001e-34  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2805  methylglyoxal synthase  58.47 
 
 		 133 aa  145  2.0000000000000003e-34  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.321447  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1706  methylglyoxal synthase  56.2 
 
 		 130 aa  145  2.0000000000000003e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00533  methylglyoxal synthase  50 
 
 		 136 aa  143  7.0000000000000006e-34  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1798  methylglyoxal synthase  55.08 
 
 		 123 aa  142  1e-33  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.061495  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2126  methylglyoxal synthase  51.56 
 
 		 132 aa  143  1e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000882281  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2082  methylglyoxal synthase  52.99 
 
 		 120 aa  142  2e-33  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2651  methylglyoxal synthase  55.65 
 
 		 140 aa  140  5e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.957792  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3450  methylglyoxal synthase  54.24 
 
 		 156 aa  139  9.999999999999999e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000281554  hitchhiker  0.00361328 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3595  methylglyoxal synthase  52.34 
 
 		 137 aa  139  1.9999999999999998e-32  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0594  methylglyoxal synthase  53.39 
 
 		 128 aa  137  3.9999999999999997e-32  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.444681  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0707  methylglyoxal synthase  53.39 
 
 		 120 aa  137  3.9999999999999997e-32  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1475  methylglyoxal synthase  46.43 
 
 		 152 aa  137  6e-32  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.977307  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_145  methylglyoxal synthase  51.18 
 
 		 144 aa  135  1e-31  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0233  methylglyoxal synthase  51.18 
 
 		 144 aa  135  1e-31  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0861  methylglyoxal synthase  46.62 
 
 		 153 aa  133  7.000000000000001e-31  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00000000142062  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0985  methylglyoxal synthase  49.58 
 
 		 135 aa  133  8e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0342245  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1144  methylglyoxal synthase  51.69 
 
 		 155 aa  133  8e-31  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.175062  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2527  methylglyoxal synthase  53.45 
 
 		 139 aa  133  9.999999999999999e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0611  methylglyoxal synthase  48.84 
 
 		 155 aa  133  9.999999999999999e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0137  methylglyoxal synthase  50.39 
 
 		 144 aa  131  3e-30  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1302  methylglyoxal synthase  46.97 
 
 		 154 aa  131  3e-30  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000000113114  decreased coverage  0.00562878 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2381  methylglyoxal synthase  50.42 
 
 		 156 aa  131  3e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0265896  normal  0.0715346 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1077  methylglyoxal synthase  53.45 
 
 		 119 aa  131  3e-30  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1265  methylglyoxal synthase  53.45 
 
 		 119 aa  130  6e-30  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.357495  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1568  methylglyoxal synthase  48.33 
 
 		 166 aa  130  6e-30  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21210  methylglyoxal synthase  51.72 
 
 		 148 aa  130  6e-30  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.846941  normal  0.0527752 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1634  methylglyoxal synthase  48.33 
 
 		 166 aa  130  6e-30  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1481  methylglyoxal synthase  51.92 
 
 		 119 aa  130  6.999999999999999e-30  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0116  methylglyoxal synthase  47.54 
 
 		 152 aa  130  7.999999999999999e-30  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.503426  normal  0.542869 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1048  methylglyoxal synthase  52.46 
 
 		 125 aa  129  1.0000000000000001e-29  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.171658  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0986  methylglyoxal synthase  52.46 
 
 		 125 aa  129  1.0000000000000001e-29  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1350  methylglyoxal synthase  45.24 
 
 		 152 aa  128  2.0000000000000002e-29  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1333  methylglyoxal synthase  52.46 
 
 		 125 aa  128  2.0000000000000002e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.714194  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00967  methylglyoxal synthase  45.67 
 
 		 152 aa  128  3e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.497667  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2680  methylglyoxal synthase  45.67 
 
 		 152 aa  128  3e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.788486  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1127  methylglyoxal synthase  45.67 
 
 		 152 aa  128  3e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.284898  normal  0.207413 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00974  hypothetical protein  45.67 
 
 		 152 aa  128  3e-29  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.651902  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1072  methylglyoxal synthase  45.67 
 
 		 152 aa  128  3e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000670613  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1078  methylglyoxal synthase  45.67 
 
 		 152 aa  128  3e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000897908  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2633  methylglyoxal synthase  45.67 
 
 		 152 aa  128  3e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.264102  hitchhiker  0.000000301541 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2156  methylglyoxal synthase  45.67 
 
 		 152 aa  128  3e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.082443  normal  0.275466 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2352  methylglyoxal synthase  45.67 
 
 		 152 aa  128  3e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.318065  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2367  methylglyoxal synthase  48.44 
 
 		 133 aa  127  5.0000000000000004e-29  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000264399  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1760  methylglyoxal synthase  44.09 
 
 		 152 aa  127  7.000000000000001e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0497546  hitchhiker  0.0006316 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1628  methylglyoxal synthase  47.33 
 
 		 167 aa  126  8.000000000000001e-29  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.652172  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4588  methylglyoxal synthase  50.83 
 
 		 133 aa  126  1.0000000000000001e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2526  methylglyoxal synthase  47.46 
 
 		 160 aa  125  2.0000000000000002e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.487727 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1034  methylglyoxal synthase  44.09 
 
 		 152 aa  124  3e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.353997  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1139  methylglyoxal synthase  44.09 
 
 		 152 aa  124  3e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.482721 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1185  methylglyoxal synthase  44.09 
 
 		 152 aa  124  3e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.408572  normal  0.64136 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>