151 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A3256 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007951  Bxe_A3256  methylglyoxal synthase  100 
 
 
129 aa  261  2e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.308691  normal  0.881072 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1304  methylglyoxal synthase  99.22 
 
 
129 aa  260  4.999999999999999e-69  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.206043  normal  0.073248 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2061  methylglyoxal synthase  92.25 
 
 
129 aa  248  2e-65  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.337955  normal  0.207657 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1881  methylglyoxal synthase  76 
 
 
130 aa  190  5e-48  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.715757  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1390  methylglyoxal synthase  76 
 
 
130 aa  190  5e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1079  methylglyoxal synthase  76 
 
 
130 aa  190  5e-48  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.233114  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0788  methylglyoxal synthase  76 
 
 
130 aa  190  5e-48  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0615906  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1235  methylglyoxal synthase  76 
 
 
130 aa  190  5e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1244  methylglyoxal synthase  76 
 
 
130 aa  190  5e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.473905  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0362  methylglyoxal synthase  76 
 
 
130 aa  190  5e-48  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.607553  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2185  methylglyoxal synthase  75.83 
 
 
135 aa  189  1e-47  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0445857  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5618  methylglyoxal synthase  76.27 
 
 
130 aa  187  4e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0573538  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2382  methylglyoxal synthase  74.58 
 
 
146 aa  187  5e-47  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.579764  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2291  methylglyoxal synthase  76.27 
 
 
130 aa  187  5.999999999999999e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1982  methylglyoxal synthase  74.58 
 
 
143 aa  187  5.999999999999999e-47  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2314  methylglyoxal synthase  76.27 
 
 
130 aa  187  5.999999999999999e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.659726 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0792  methylglyoxal synthase  76.27 
 
 
140 aa  186  9e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.52468  normal  0.131121 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1679  methylglyoxal synthase  75.42 
 
 
130 aa  186  1e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0255708  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0987  methylglyoxal synthase  76.27 
 
 
130 aa  186  1e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1018  methylglyoxal synthase  74.19 
 
 
130 aa  185  2e-46  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.736302  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2329  methylglyoxal synthase  75.42 
 
 
130 aa  185  2e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2207  methylglyoxal synthase  75.42 
 
 
130 aa  185  2e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.093882  normal  0.861141 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2504  methylglyoxal synthase  72.27 
 
 
130 aa  180  6e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.156833  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0042  methylglyoxal synthase  69.42 
 
 
127 aa  171  3.9999999999999995e-42  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.304097 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04890  Dephospho-CoA kinase  61.86 
 
 
317 aa  159  1e-38  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000544377  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1275  methylglyoxal synthase  61.74 
 
 
128 aa  149  8.999999999999999e-36  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.418994  hitchhiker  0.00000238684 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0967  methylglyoxal synthase  58.12 
 
 
123 aa  147  5e-35  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1257  methylglyoxal synthase  56.3 
 
 
131 aa  144  4.0000000000000006e-34  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.390587  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1459  methylglyoxal synthase  56.78 
 
 
131 aa  144  4.0000000000000006e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0146321  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1415  methylglyoxal synthase  56.78 
 
 
131 aa  142  1e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0291451  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1416  methylglyoxal synthase  56.78 
 
 
131 aa  142  1e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.032143  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1309  methylglyoxal synthase  58.97 
 
 
141 aa  142  1e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.871383  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0524  methylglyoxal synthase  56.25 
 
 
126 aa  142  1e-33  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1627  methylglyoxal synthase  56.78 
 
 
131 aa  142  1e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.15767 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0594  methylglyoxal synthase  57.98 
 
 
128 aa  142  2e-33  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.444681  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2126  methylglyoxal synthase  58.47 
 
 
132 aa  142  2e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000882281  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1443  methylglyoxal synthase  55.93 
 
 
131 aa  141  3e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0250107  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1556  methylglyoxal synthase  55.93 
 
 
131 aa  141  3e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3178  methylglyoxal synthase  59.65 
 
 
134 aa  141  3e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1662  methylglyoxal synthase  55.93 
 
 
131 aa  141  4e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1700  methylglyoxal synthase  55.93 
 
 
131 aa  141  4e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0277502  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1589  methylglyoxal synthase  55.93 
 
 
131 aa  141  4e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2082  methylglyoxal synthase  52.14 
 
 
120 aa  140  4e-33  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3756  methylglyoxal synthase  55.93 
 
 
131 aa  141  4e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2484  methylglyoxal synthase  56.56 
 
 
133 aa  140  6e-33  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2192  methylglyoxal synthase  53.78 
 
 
122 aa  139  9e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0366  methylglyoxal synthase  50.41 
 
 
126 aa  139  1.9999999999999998e-32  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2805  methylglyoxal synthase  54.47 
 
 
133 aa  139  1.9999999999999998e-32  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.321447  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2123  methylglyoxal synthase  53.39 
 
 
140 aa  139  1.9999999999999998e-32  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.336211  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1122  methylglyoxal synthase  50 
 
 
126 aa  139  1.9999999999999998e-32  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0496  methylglyoxal synthase  54.24 
 
 
144 aa  137  4.999999999999999e-32  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1706  methylglyoxal synthase  57.26 
 
 
130 aa  136  7.999999999999999e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0194  methylglyoxal synthase  53.39 
 
 
122 aa  136  1e-31  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0707  methylglyoxal synthase  55.08 
 
 
120 aa  135  2e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1077  methylglyoxal synthase  54.78 
 
 
119 aa  135  3.0000000000000003e-31  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0116  methylglyoxal synthase  51.69 
 
 
152 aa  134  5e-31  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.503426  normal  0.542869 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1265  methylglyoxal synthase  53.91 
 
 
119 aa  133  7.000000000000001e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.357495  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1798  methylglyoxal synthase  53.78 
 
 
123 aa  131  3.9999999999999996e-30  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.061495  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0985  methylglyoxal synthase  50 
 
 
135 aa  130  3.9999999999999996e-30  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0342245  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1163  methylglyoxal synthase  51.18 
 
 
128 aa  131  3.9999999999999996e-30  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.618904  normal  0.0141735 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_145  methylglyoxal synthase  56.14 
 
 
144 aa  130  9e-30  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0233  methylglyoxal synthase  55.26 
 
 
144 aa  129  1.0000000000000001e-29  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2527  methylglyoxal synthase  53.91 
 
 
139 aa  129  2.0000000000000002e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0137  methylglyoxal synthase  56.14 
 
 
144 aa  127  4.0000000000000003e-29  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0241  methylglyoxal synthase  52.89 
 
 
137 aa  127  4.0000000000000003e-29  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3450  methylglyoxal synthase  52.99 
 
 
156 aa  127  4.0000000000000003e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000281554  hitchhiker  0.00361328 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1481  methylglyoxal synthase  47.71 
 
 
119 aa  127  6e-29  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1558  methylglyoxal synthase  49.57 
 
 
159 aa  127  7.000000000000001e-29  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.296029  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00533  methylglyoxal synthase  48.28 
 
 
136 aa  126  9.000000000000001e-29  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4588  methylglyoxal synthase  49.19 
 
 
133 aa  125  1.0000000000000001e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2381  methylglyoxal synthase  46.88 
 
 
156 aa  123  6e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0265896  normal  0.0715346 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1760  methylglyoxal synthase  48.33 
 
 
152 aa  123  7e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0497546  hitchhiker  0.0006316 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2651  methylglyoxal synthase  50.83 
 
 
140 aa  123  9e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.957792  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0611  methylglyoxal synthase  50.43 
 
 
155 aa  121  3e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1333  methylglyoxal synthase  52.94 
 
 
125 aa  121  3e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.714194  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3595  methylglyoxal synthase  52.59 
 
 
137 aa  121  4e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21210  methylglyoxal synthase  50 
 
 
148 aa  121  4e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.846941  normal  0.0527752 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1048  methylglyoxal synthase  53.78 
 
 
125 aa  120  9e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.171658  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0986  methylglyoxal synthase  53.78 
 
 
125 aa  120  9e-27  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1475  methylglyoxal synthase  48.28 
 
 
152 aa  118  1.9999999999999998e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.977307  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1568  methylglyoxal synthase  47.86 
 
 
166 aa  118  1.9999999999999998e-26  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1634  methylglyoxal synthase  47.86 
 
 
166 aa  118  1.9999999999999998e-26  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1302  methylglyoxal synthase  44 
 
 
154 aa  118  3e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000000113114  decreased coverage  0.00562878 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1310  methylglyoxal synthase  50 
 
 
154 aa  118  3e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.225102  normal  0.598668 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3100  methylglyoxal synthase  46.4 
 
 
159 aa  118  3e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000537533  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2133  methylglyoxal synthase  43.2 
 
 
151 aa  117  4.9999999999999996e-26  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0525885  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0650  methylglyoxal synthase  41.6 
 
 
151 aa  117  4.9999999999999996e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2852  methylglyoxal synthase  44.8 
 
 
152 aa  117  4.9999999999999996e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.069917  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2543  methylglyoxal synthase  44.8 
 
 
152 aa  117  7e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00778094  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1215  methylglyoxal synthase  47.5 
 
 
152 aa  117  7e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.216968  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0861  methylglyoxal synthase  48.72 
 
 
153 aa  116  9.999999999999999e-26  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00000000142062  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1144  methylglyoxal synthase  47.86 
 
 
155 aa  116  9.999999999999999e-26  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.175062  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000319  methylglyoxal synthase  43.1 
 
 
151 aa  115  1.9999999999999998e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1034  methylglyoxal synthase  47.41 
 
 
152 aa  114  3.9999999999999997e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.353997  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1185  methylglyoxal synthase  47.41 
 
 
152 aa  114  3.9999999999999997e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.408572  normal  0.64136 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1151  methylglyoxal synthase  47.41 
 
 
152 aa  114  3.9999999999999997e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1628  methylglyoxal synthase  48.28 
 
 
167 aa  114  3.9999999999999997e-25  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.652172  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1139  methylglyoxal synthase  47.41 
 
 
152 aa  114  3.9999999999999997e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.482721 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1117  methylglyoxal synthase  47.41 
 
 
152 aa  114  3.9999999999999997e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000625657 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4130  methylglyoxal synthase  52.54 
 
 
126 aa  114  5e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.070186  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>