More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_6023 on replicon NC_008544
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008544  Bcen2424_6023  FAD linked oxidase domain-containing protein  100 
 
 
472 aa  927    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6514  FAD linked oxidase domain-containing protein  96.61 
 
 
472 aa  861    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0813577  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7432  FAD linked oxidase-like  89.26 
 
 
472 aa  817    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.204246  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5658  FAD linked oxidase-like  100 
 
 
472 aa  927    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.658041  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6129  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  84.92 
 
 
469 aa  767    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0299284 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3158  FAD linked oxidase domain-containing protein  39.41 
 
 
473 aa  271  2e-71  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1862  FAD linked oxidase domain-containing protein  36.44 
 
 
472 aa  248  2e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.258357  hitchhiker  0.0000244132 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1351  putative FAD-binding oxidoreductase  36.2 
 
 
472 aa  245  9.999999999999999e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.652696  normal  0.185636 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4598  FAD linked oxidase-like  36.04 
 
 
473 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.347374  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1431  FAD linked oxidase domain-containing protein  36 
 
 
473 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.488984  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1453  FAD linked oxidase domain-containing protein  35.78 
 
 
473 aa  242  1e-62  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.473918  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0971  FAD linked oxidase-like  35.78 
 
 
473 aa  242  1e-62  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.18122  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2776  FAD linked oxidase domain protein  35.83 
 
 
472 aa  241  2e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2621  oxidoreductase, FAD-binding  36.16 
 
 
473 aa  240  2.9999999999999997e-62  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.6474  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1334  FAD linked oxidase domain-containing protein  35.78 
 
 
473 aa  241  2.9999999999999997e-62  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5768  FAD linked oxidase domain-containing protein  38.49 
 
 
519 aa  238  1e-61  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000146107 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1374  FAD linked oxidase domain-containing protein  35.33 
 
 
473 aa  239  1e-61  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.901201 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1578  FAD linked oxidase domain-containing protein  36.4 
 
 
475 aa  238  2e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1682  oxidoreductase, FAD-binding  36.38 
 
 
473 aa  237  4e-61  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0939  oxidoreductase, FAD-binding  36.38 
 
 
473 aa  236  7e-61  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0753  oxidoreductase, FAD-binding  36.38 
 
 
473 aa  236  7e-61  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.78628  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1859  oxidoreductase, FAD-binding  36.38 
 
 
524 aa  236  7e-61  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1472  oxidoreductase, FAD-binding  36.38 
 
 
473 aa  236  7e-61  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1704  oxidoreductase, FAD-binding  36.38 
 
 
473 aa  236  7e-61  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0409  oxidoreductase, FAD-binding  36.38 
 
 
473 aa  236  7e-61  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1997  FAD linked oxidase domain protein  34.68 
 
 
470 aa  235  1.0000000000000001e-60  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.810162  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4968  FAD linked oxidase domain-containing protein  36.18 
 
 
476 aa  235  2.0000000000000002e-60  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1556  oxidoreductase protein  36.32 
 
 
470 aa  233  4.0000000000000004e-60  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.94486 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1667  FAD linked oxidase domain protein  34.23 
 
 
470 aa  231  3e-59  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.39014  hitchhiker  0.00657046 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1668  FAD linked oxidase domain protein  32.88 
 
 
477 aa  230  5e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1828  FAD linked oxidase-like  34.55 
 
 
473 aa  228  2e-58  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00514065 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2989  FAD linked oxidase-like  34.84 
 
 
477 aa  226  7e-58  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1290  FAD linked oxidase-like  35.89 
 
 
472 aa  225  1e-57  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0982  FAD linked oxidase domain-containing protein  28.79 
 
 
472 aa  223  6e-57  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2485  FAD linked oxidase domain-containing protein  34.34 
 
 
479 aa  223  8e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0928797  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21430  FAD linked oxidoreductase  34.43 
 
 
472 aa  222  9.999999999999999e-57  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.314839  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1452  FAD linked oxidase domain-containing protein  35.47 
 
 
480 aa  222  9.999999999999999e-57  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.332175  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2401  FAD linked oxidase domain protein  36.53 
 
 
468 aa  222  9.999999999999999e-57  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0307  FAD linked oxidase domain-containing protein  35.84 
 
 
479 aa  222  9.999999999999999e-57  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1117  FAD linked oxidase domain protein  35.02 
 
 
489 aa  220  3.9999999999999997e-56  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6324  FAD linked oxidase domain protein  32.73 
 
 
471 aa  219  7e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0789269  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1198  FAD linked oxidase domain-containing protein  34.79 
 
 
474 aa  219  7.999999999999999e-56  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.543667 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0542  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  36.41 
 
 
464 aa  217  4e-55  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4328  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  36.49 
 
 
475 aa  216  5.9999999999999996e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0770  FAD linked oxidase domain-containing protein  36.09 
 
 
471 aa  215  9.999999999999999e-55  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.913488 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1247  FAD linked oxidase, C-terminal:FAD linked oxidase, N-terminal  34.37 
 
 
472 aa  215  9.999999999999999e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2796  FAD linked oxidase domain-containing protein  37.61 
 
 
498 aa  216  9.999999999999999e-55  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1128  FAD linked oxidase-like protein  34.73 
 
 
474 aa  215  9.999999999999999e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0322284  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5180  FAD linked oxidase domain protein  35.96 
 
 
464 aa  215  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.531552  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3758  FAD linked oxidase domain-containing protein  33.94 
 
 
480 aa  214  2.9999999999999995e-54  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2750  FAD linked oxidase, C-terminal:FAD linked oxidase, N-terminal  32.27 
 
 
468 aa  213  4.9999999999999996e-54  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.603945 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2213  FAD linked oxidase domain protein  35.58 
 
 
469 aa  213  5.999999999999999e-54  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1049  FAD linked oxidase-like protein  35.21 
 
 
474 aa  210  5e-53  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.538289  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2697  FAD linked oxidase  34.75 
 
 
480 aa  209  6e-53  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.706737 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4691  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  32.74 
 
 
475 aa  209  7e-53  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1517  FAD linked oxidase domain-containing protein  33.63 
 
 
472 aa  209  9e-53  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.105357 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2771  FAD linked oxidase domain-containing protein  34.2 
 
 
502 aa  209  1e-52  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.360334  hitchhiker  0.00649416 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2091  FAD linked oxidase-like  35.27 
 
 
471 aa  208  2e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.647831 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1744  FAD linked oxidase-like protein  34 
 
 
484 aa  207  3e-52  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3784  FAD linked oxidase domain-containing protein  32.95 
 
 
472 aa  207  4e-52  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.532115  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_4010  FAD linked oxidase-like  32.98 
 
 
478 aa  207  4e-52  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3053  FAD linked oxidase domain-containing protein  35.35 
 
 
481 aa  204  2e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2071  FAD linked oxidase-like  34.42 
 
 
469 aa  205  2e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.840196 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2386  putative D-lactate ferricytochrome C oxidoreductase  34.52 
 
 
475 aa  204  3e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0617149  normal  0.571261 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2755  FAD linked oxidase domain-containing protein  31.93 
 
 
458 aa  204  3e-51  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1468  FAD linked oxidase domain protein  33.7 
 
 
487 aa  204  4e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.412211  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0390  FAD-binding protein  31.18 
 
 
469 aa  204  4e-51  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.13376  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8493  FAD linked oxidase domain protein  32.88 
 
 
480 aa  202  9e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0941328  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4275  FAD linked oxidase, C-terminal:FAD linked oxidase, N-terminal  33.77 
 
 
483 aa  202  9.999999999999999e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3118  FAD linked oxidase domain protein  36.62 
 
 
469 aa  201  1.9999999999999998e-50  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.624021  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1790  FAD linked oxidase-like protein  33.72 
 
 
470 aa  201  1.9999999999999998e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.624763  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3047  FAD linked oxidase domain protein  34.72 
 
 
489 aa  201  3e-50  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.517001 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3209  FAD linked oxidase domain-containing protein  34.67 
 
 
489 aa  201  3e-50  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.350249  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1614  FAD linked oxidase domain-containing protein  35.61 
 
 
462 aa  201  3e-50  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.546012  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1307  FAD linked oxidase, C-terminal:FAD linked oxidase, N-terminal  31.92 
 
 
470 aa  200  3.9999999999999996e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1131  FAD linked oxidase-like  34.24 
 
 
475 aa  199  7e-50  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.27032  normal  0.530597 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4472  FAD linked oxidase domain-containing protein  35.96 
 
 
464 aa  198  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00222178 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5468  FAD linked oxidase domain-containing protein  33.03 
 
 
473 aa  198  2.0000000000000003e-49  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  hitchhiker  0.00404471  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0214  FAD linked oxidase domain-containing protein  34.68 
 
 
465 aa  198  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4322  FAD linked oxidase-like  34.67 
 
 
474 aa  197  4.0000000000000005e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.163811 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2117  putative D-lactate dehydrogenase  34.3 
 
 
471 aa  196  5.000000000000001e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2978  FAD linked oxidase domain protein  34.14 
 
 
465 aa  196  6e-49  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0733  FAD linked oxidase domain protein  35.67 
 
 
478 aa  196  1e-48  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0806943 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1608  FAD linked oxidase-like protein  35.59 
 
 
468 aa  195  1e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.319346  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2364  FAD linked oxidase domain-containing protein  33.93 
 
 
496 aa  196  1e-48  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0406  oxidoreductase, FAD-binding  31.17 
 
 
470 aa  194  2e-48  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006680  CNK01540  conserved hypothetical protein  30.02 
 
 
537 aa  195  2e-48  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.527687  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2016  FAD linked oxidase domain-containing protein  33.03 
 
 
474 aa  195  2e-48  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.45278 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1266  FAD linked oxidase domain protein  33.05 
 
 
475 aa  194  3e-48  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0415  oxidoreductase, FAD-binding  31.17 
 
 
470 aa  194  3e-48  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0135  FAD linked oxidase domain-containing protein  37.15 
 
 
476 aa  194  4e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3146  FAD linked oxidase-like  32.63 
 
 
463 aa  194  4e-48  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.27329 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6048  FAD linked oxidase domain-containing protein  33.12 
 
 
472 aa  193  5e-48  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0525  FAD linked oxidase domain-containing protein  31.17 
 
 
470 aa  192  1e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0138  FAD linked oxidase domain-containing protein  34.99 
 
 
506 aa  192  1e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.529634  normal 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_89565  mitochondrial D-lactate dehydrogenase  29.77 
 
 
523 aa  192  1e-47  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5658  FAD linked oxidase, C-terminal:FAD linked oxidase, N-terminal  32.16 
 
 
475 aa  191  2e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0716  FAD linked oxidase-like  31.61 
 
 
476 aa  191  2e-47  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.570326  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0158  FAD linked oxidase domain protein  34 
 
 
465 aa  192  2e-47  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.033343 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0121  FAD linked oxidase domain-containing protein  36.58 
 
 
476 aa  192  2e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.273807  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>