214 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_2863 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_2863  glycerate kinase  100 
 
 		 382 aa  696    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.480993 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2626  glycerate kinase  61.21 
 
 		 403 aa  324  2e-87  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26280  glycerate kinase  52.85 
 
 		 385 aa  322  6e-87  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0355581 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0404  glycerate kinase  45.87 
 
 		 381 aa  248  1e-64  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0467091  decreased coverage  0.00777473 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3551  glycerate kinase  42.47 
 
 		 387 aa  246  6e-64  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.565329  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3529  glycerate kinase  45.43 
 
 		 384 aa  244  9.999999999999999e-64  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2915  glycerate kinase  43.9 
 
 		 383 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2685  Glycerate kinase  43.35 
 
 		 381 aa  243  3e-63  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1926  glycerate kinase  40.16 
 
 		 371 aa  243  5e-63  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3392  glycerate kinase  41.94 
 
 		 381 aa  241  2e-62  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3165  glycerate kinase 2  42.2 
 
 		 380 aa  234  2.0000000000000002e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.589174  normal  0.0595423 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0846  glycerate kinase  42.74 
 
 		 380 aa  234  3e-60  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0871  glycerate 2-kinase  35.81 
 
 		 380 aa  233  4.0000000000000004e-60  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3118  glycerate kinase 2  42.2 
 
 		 380 aa  233  4.0000000000000004e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.855661  normal  0.775701 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1142  glycerate kinase  41.82 
 
 		 382 aa  233  6e-60  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.45984  unclonable  0.0000000352544 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0173  glycerate kinase  45.97 
 
 		 388 aa  233  6e-60  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3181  glycerate kinase 2  41.94 
 
 		 380 aa  232  7.000000000000001e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.345716  normal  0.43286 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1637  glycerate kinase 1  45.97 
 
 		 388 aa  232  7.000000000000001e-60  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0262  glycerate kinase 2  45.97 
 
 		 388 aa  232  8.000000000000001e-60  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2051  glycerate kinase  43.32 
 
 		 378 aa  232  9e-60  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.55697  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2908  glycerate kinase  43.77 
 
 		 379 aa  231  1e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.46762 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3279  glycerate kinase 2  41.94 
 
 		 380 aa  232  1e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.809605  normal  0.297665 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3100  glycerate kinase 2  41.94 
 
 		 380 aa  231  2e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2952  glycerate kinase  46.11 
 
 		 386 aa  230  3e-59  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3602  glycerate kinase  36.46 
 
 		 381 aa  228  1e-58  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3115  glycerate kinase  43.58 
 
 		 379 aa  228  1e-58  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.630245  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0846  hypothetical protein  37.8 
 
 		 373 aa  228  1e-58  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0245025  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4927  glycerate kinase  43.73 
 
 		 395 aa  228  1e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.36164  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0812  glycerate kinase  41.94 
 
 		 380 aa  228  2e-58  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22950  Glycerate kinase  41.76 
 
 		 380 aa  228  2e-58  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0854  glycerate kinase  37.8 
 
 		 373 aa  226  4e-58  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.69696  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3398  glycerate kinase  42.94 
 
 		 380 aa  226  7e-58  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.13407  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0571  glycerate kinase II  41.18 
 
 		 382 aa  226  7e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0578  glycerate kinase II  41.18 
 
 		 382 aa  226  7e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.837942 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0573  glycerate kinase II  41.18 
 
 		 382 aa  225  1e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0632  glycerate kinase II  41.18 
 
 		 382 aa  225  1e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.82847  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3280  glycerate kinase  42.18 
 
 		 379 aa  224  2e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.345259  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2690  glycerate kinase  43.58 
 
 		 379 aa  224  2e-57  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1524  glycerate kinase  37.07 
 
 		 380 aa  224  2e-57  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2591  glycerate kinase  48.26 
 
 		 375 aa  224  2e-57  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.324688  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0201  glycerate kinase  44.35 
 
 		 394 aa  223  3e-57  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2594  glycerate kinase  38.61 
 
 		 379 aa  222  9e-57  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3134  glycerate kinase  38.79 
 
 		 392 aa  221  9.999999999999999e-57  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00500551 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1896  glycerate kinase  36.7 
 
 		 384 aa  221  9.999999999999999e-57  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2726  glycerate kinase  42.05 
 
 		 379 aa  219  5e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2858  glycerate kinase  42.05 
 
 		 379 aa  219  5e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.368112  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2685  glycerate kinase  42.05 
 
 		 379 aa  219  5e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2637  glycerate kinase  42.05 
 
 		 379 aa  219  5e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0579  glycerate kinase  45.17 
 
 		 353 aa  219  7.999999999999999e-56  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.513033  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2534  glycerate kinase  40.48 
 
 		 381 aa  219  8.999999999999998e-56  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2779  glycerate kinase  38.36 
 
 		 394 aa  218  1e-55  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.357218 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5030  glycerate kinase  40.69 
 
 		 380 aa  218  1e-55  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43390  Glycerate kinase  44.92 
 
 		 378 aa  217  2.9999999999999998e-55  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00316811  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2519  glycerate kinase  37.7 
 
 		 381 aa  216  4e-55  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.122569 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4326  hypothetical protein  46.32 
 
 		 381 aa  216  5.9999999999999996e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0260902  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1470  glycerate kinase  37.82 
 
 		 394 aa  215  8e-55  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3178  glycerate kinase  42.78 
 
 		 379 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2012  glycerate kinase 2  36 
 
 		 383 aa  214  1.9999999999999998e-54  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.197664  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1982  glycerate kinase  47.06 
 
 		 369 aa  214  1.9999999999999998e-54  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1439  glycerate kinase  45.48 
 
 		 380 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.465286  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2714  glycerate kinase  39.31 
 
 		 384 aa  214  1.9999999999999998e-54  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.426289  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2001  glycerate kinase  46.52 
 
 		 369 aa  214  2.9999999999999995e-54  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3692  glycerate kinase  42.63 
 
 		 409 aa  213  2.9999999999999995e-54  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2047  glycerate kinase  46.52 
 
 		 369 aa  214  2.9999999999999995e-54  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.495865  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2538  glycerate kinase  42.51 
 
 		 379 aa  213  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0151  glycerate kinase  44.92 
 
 		 381 aa  213  3.9999999999999995e-54  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.219073  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2685  glycerate kinase  37.17 
 
 		 381 aa  212  7e-54  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.384968 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02989  glycerate kinase I  40.75 
 
 		 408 aa  212  7.999999999999999e-54  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02940  hypothetical protein  40.75 
 
 		 408 aa  212  7.999999999999999e-54  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0581  Glycerate kinase  40.75 
 
 		 381 aa  212  1e-53  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0576  glycerate kinase I  40.75 
 
 		 381 aa  212  1e-53  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3239  glycerate 2-kinase  40.86 
 
 		 379 aa  212  1e-53  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0332689 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3313  glycerate kinase I  40.75 
 
 		 381 aa  212  1e-53  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3419  glycerate kinase I  40.46 
 
 		 381 aa  211  2e-53  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4436  glycerate kinase I  40.46 
 
 		 381 aa  211  2e-53  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.109938 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3602  glycerate kinase I  40.46 
 
 		 381 aa  210  3e-53  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3623  glycerate kinase  38.4 
 
 		 386 aa  210  4e-53  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.304163  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3566  glycerate kinase I  39.68 
 
 		 381 aa  210  4e-53  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.816007 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1860  Glycerate kinase  40.64 
 
 		 388 aa  209  6e-53  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.817432  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4081  glycerate kinase  39.78 
 
 		 378 aa  209  9e-53  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.063717 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3234  glycerate kinase I  39.88 
 
 		 381 aa  208  1e-52  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50760  hypothetical protein  47.11 
 
 		 381 aa  208  1e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0151848 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1478  glycerate kinase  36.15 
 
 		 378 aa  208  1e-52  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0615  glycerate kinase II  39.52 
 
 		 381 aa  208  1e-52  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4052  glycerate kinase  39.78 
 
 		 378 aa  208  1e-52  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0111  glycerate kinase  39.78 
 
 		 378 aa  207  2e-52  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0925  glycerate kinase  35.56 
 
 		 381 aa  206  5e-52  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000221042  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0551  glycerate kinase II  39.25 
 
 		 381 aa  206  5e-52  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06863  glycerate kinase  38.27 
 
 		 377 aa  206  7e-52  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00464  glycerate kinase II  39.25 
 
 		 381 aa  206  8e-52  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00469  hypothetical protein  39.25 
 
 		 381 aa  206  8e-52  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2672  glycerate kinase  43.88 
 
 		 381 aa  205  1e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.16173  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3109  glycerate kinase II  40.34 
 
 		 381 aa  204  2e-51  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.574239 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2587  glycerate kinase  37.97 
 
 		 381 aa  204  2e-51  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.692299 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3519  Glycerate kinase  44.05 
 
 		 397 aa  204  2e-51  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0587  glycerate kinase II  40.34 
 
 		 381 aa  204  2e-51  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3099  Glycerate kinase  38.98 
 
 		 381 aa  203  3e-51  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1859  glycerate kinase family protein  39.37 
 
 		 386 aa  204  3e-51  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0148  glycerate kinase  36.7 
 
 		 385 aa  204  3e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.175486  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0559  glycerate kinase II  38.98 
 
 		 381 aa  203  4e-51  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>