22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_5101 on replicon NC_010552
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010552  BamMC406_5101  hypothetical protein  100 
 
 		 547 aa  915    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.517615 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5104  hypothetical protein  67.11 
 
 		 673 aa  538  9.999999999999999e-153  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.711525 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0464  gene 11-1 protein precursor, putative  59.59 
 
 		 1301 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.45092  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2047  chromosome segregation ATPases  53.38 
 
 		 1199 aa  358  9e-98  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0460  hypothetical protein  53.25 
 
 		 1220 aa  346  8e-94  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.871611  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2041  chromosome segregation ATPases  51.27 
 
 		 1176 aa  328  2.0000000000000001e-88  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0814  hypothetical protein  57.64 
 
 		 413 aa  322  9.999999999999999e-87  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.449827  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0458  PEST motif-containing protein  46.04 
 
 		 939 aa  287  4e-76  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.028922  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6616  hypothetical protein  48.5 
 
 		 439 aa  278  2e-73  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.266008  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2040  chromosome segregation ATPases  44.25 
 
 		 754 aa  273  4.0000000000000004e-72  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1945  chromosome segregation ATPases  41.87 
 
 		 836 aa  268  2e-70  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.261745  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0532  chromosome segregation ATPase  56.91 
 
 		 227 aa  140  6e-32  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6362  chromosome segregation ATPase  39.06 
 
 		 483 aa  122  1.9999999999999998e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.397181  normal  0.860165 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6614  hypothetical protein  56.76 
 
 		 167 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.446982  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0815  hypothetical protein  47.19 
 
 		 209 aa  114  5e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5106  hypothetical protein  48.39 
 
 		 181 aa  91.3  4e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0645  hypothetical protein  60.4 
 
 		 116 aa  85.1  0.000000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.183493  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6356  DNA-directed RNA polymerase II, large subunit, putative  46.82 
 
 		 400 aa  60.8  0.00000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.803195 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6357  hypothetical protein  38.2 
 
 		 211 aa  52  0.00003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6359  hypothetical protein  39.38 
 
 		 193 aa  51.6  0.00004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1275  RNA-binding S4 domain protein  23.03 
 
 		 674 aa  48.9  0.0002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.206781 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1339  RNA-binding S4 domain protein  24.89 
 
 		 627 aa  43.5  0.01  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.476364  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>