| Gene Information Plasmid Coverage information Fosmid Coverage information Sequence |
Gene Information |
| Locus tag | BURPS668_A2047 |
|---|
| Symbol | |
|---|
| ID | 4887557 |
|---|
| Type | CDS |
|---|
| Is gene spliced | No |
|---|
| Is pseudo gene | No |
|---|
| Organism name | Burkholderia pseudomallei 668 |
|---|
| Kingdom | Bacteria |
|---|
| Replicon accession | NC_009075 |
|---|
| Strand | - |
|---|
| Start bp | 1979952 |
|---|
| End bp | 1983551 |
|---|
| Gene Length | 3600 bp |
|---|
| Protein Length | 1199 aa |
|---|
| Translation table | 11 |
|---|
| GC content | 64% |
|---|
| IMG OID | 640131985 |
|---|
| Product | chromosome segregation ATPases |
|---|
| Protein accession | YP_001063042 |
|---|
| Protein GI | 126442859 |
|---|
| COG category | |
|---|
| COG ID | |
|---|
| TIGRFAM ID | |
|---|
| 
|
Plasmid Coverage information |
| Num covering plasmid clones | 22 |
|---|
| Plasmid unclonability p-value | 1 |
|---|
| Plasmid hitchhiking | No |
|---|
| Plasmid clonability | normal |
|---|
| |
Fosmid Coverage information |
| Num covering fosmid clones | n/a |
|---|
| Fosmid unclonability p-value | n/a |
|---|
| Fosmid Hitchhiker | n/a |
|---|
| Fosmid clonability | n/a |
|---|
| |
Sequence |
| Gene sequence | ATGTCGGCGG CGATGCCCGT GCTCGCGGGC AGCGCGCGGA TCACGTTGTT CGTGCTGTTG
ACGATCGTCG TCGACAGCGA CGTGAGCTGC GTGTTGAGGT TGGTCACGCT CGTCGACAGC
GACGCGACGC TCGTGTTCGT CGTCGACAGG CCGGTGGACA GCGAGTTCAC GCTTGTCGAA
GTCGACGTGG ACAGCGACGC GACGTTGCTG TTGGTGGTCG ACAGGCTGGT GGACAGCGAG
CCGACGGCCG TCGAGGTGGA CGTGGACAGC GAGGCGACGT TGCTGTTGGT GGTCGACAGG
CCGGTGGACA GCGAGCCGAC GGCCGTCGAG GTGGATGTGG ACAGCGAGGC GACCGTGCTG
TTGGTTGCGG CGAGGCCGGT CGAGGCGGAC GTCGACAGCG ACGCGACGCT GCTGTTGGTG
GCGCTCAGGC CGGTGGACAG CGAGCTCACG GAGGTGAGCG TCGACGTGGA CAGCGACGCG
AGATTGCTGT TGGTCGTCGC GAGGCCGGTG GACAGCGAGC CGATCGAGCT CAGCGCCGAC
GAGAAGCTCG TCGAGGTCGA CGTCGAGAGC GAAGCGATCG AGCTGGTTGT TGACGAGAGG
CCGGTCGACG TGGAGGTCGA CAGCGAGGCG AGGTTGCTGT CGGTGGTGCT CAGGCCGGTC
GAGAGCGATG CGACGCTGCT GTTGGTGGTG CTCAGGCCGG TCGAGAGCGA TGCGACGCTG
CTGTTGGTGG TGCTCAAGCC GGTGGACAGC GAGTCGACGC TCGTCGAGGT CGACGTGGAC
AGCGAAGCGA TCGAGCTGGT CGCGGACGAA AGGCCGGTCG ACGTGGAAGT CGACAGCGAG
GCGAGGTTGC TGTCGGTGGT GCTCAGGCCG GTCGAGAGCG ACGCGACGCT GCTGTTGGTG
GTGCTCAGGC TGGTGGACAG CGAGTCGACG CTCGTCGAGG TCGACGTGGA CAGCGAAGCG
ATCGAGCTGG TCGCGGTCGA GAGGCCGGTC GACGTGGAAG TCGACAGCGA GGCGAGGTTG
CTGTCGGTGG TGCTCAAACC GGTGGACAGC GAGCCGATGC CGGTCGAGGT CGACGTGGAC
AGCGAAGCGA TCGAGCTATT GGCCGAGCTG ATGCCCGACG AGGCGGACGT TGAAAGCGAG
GTCAACGAGC TGTTCGTGCT GCTCAGGCCG GAGGACAGCG AGGCGACATT GCTGTTGGTC
GTGCTCAGCC CGCTCGAAAG GGAGGTAATC GAACTGTTGG CCGACGAGAG CCCCGTCGAC
GTGGAGGTCG ACAGCGACGT GAGGTTGCTG TTGGTGGTGC TCAGGCCGGT GGAAAGCGAG
CCGATACCGG TCGAGGTCGA CGTGGACAGC GAAGCGATCG AGCTATTGGC CGAGCTGATG
CCCGAGGAAG CGGACGTTGA AAGCGAGGTC AGCGAGCTGT TCGTGCTGCT CAGGCCGGTC
GAGAGCGACG CGACGCTGCT GTTGGTGGTG CTCAAGCCGC TGGACAGCGA GGCGACATTG
CTATTGGTCG TGCTCAGTCC GCTCGAAAGG GAGGTAATCG AACTGTTGGC CGACGAGAGC
CCCGTCGACG TGGAGGTCGA CAGCGACGTG AGGTTGCTGT CGGTGGTGCT CAAACCGGTG
GACAGCGAGC TGATGCCGGT CGAGGTTGAC GTGGACAACG AAGCAATCGA GCTATTGGCT
GAGCTGATGC CCGACGAGGC GGACGTTGAA AGCGAGGTCA GCGAGCTGTT GGTGGTGCTC
AAGCCGCTGG ACAGCGAGGC GACGTTGCTG TTGGTCGTGC TCAGTCCGCT CGAAAGGGAA
GTGATCGAGC TGTTGGCCGA CGAGAGCCCC GTCGACGTGG AGGTCGACAG CGACGTGAGG
TTGCTGTCGG TGGTGCTCAA ACCGGTGGAC AGCGAGCTGA TGCCCGTCGA GGTCGACGTG
GACAACGAAG CGACCGAGCT GGTCGCGGAC GAGAGGCCGG TCGACGTGGA AGTCGACAGC
GAGGCGAGGT TGCTGTCGAT GGTGCTCAAA CCGGTGGACA GCGAGCCGAT GCCCGTCGAG
GTCGACGTGG ACAACGAAGC GACCGTGCTA TTGGTCGTCG ACAGTCCGGT CGACAGCGAA
TTGACGCCGC TCTGCGCGGT GCTGATGCCC GAGGAAGCGG ACGTCGACAG CGAGGTCAGC
GAGCTGTTCG TGCTGCTCAA GCCGGTGGAC AGCGACGCGA CGTTGCTGTT GGTCGTGCTC
AGTCCGCTCG AAAGGGAAGT GATCGAGCTG TTGGCCGACG AGAGGCCGGT CGACGTGGAA
GTCGACAGCG ACGTGAGGCT GCTGTTAGTG GTGCTCAGGC CGGTGGAAAG CGAGCCGATG
CCGGTCGAGG TCGACGTGGA CAGCGAGGCA ACCGAGCTAT TGGCCGAGCT GATGCCCGAC
GAGGCGGACG TTGAAAGCGA GGTGAGCGAG CTGTTGGTGG TGCTCAAGCC GGTTGACAGC
GAGGTGACGT TGCTGTTGGT CGTGCTCAGC CCGCTCGAAA GGGAGGTAAT CGAACTGTTG
GCCGACGAGA GCCCCGTCGA CGTGGAGGTC GACAGCGACG TGAGGTTGCT GTTGGTGGTG
CTCAGGCCGG TGGAAAGCGA GCCGATACCG GTCGAGGTCG ACGTGGACAG CGAAGCGATC
GAGCTGGTCG CGGACGAGAG GCCGGTCGAC GTGGAAGTCG ACAGCGAGGC GAGGTTGCTG
TCGGTGGTGC TCAAACCGGT GGAAAGCGAG CCGATACCGG TCGAGGTCGA CGTGGACAGC
GAAGCGATCG AGCTGGTCGC GGTCGAGAGG CCGGTCGACG TGGAAGTCGA CAGCGAGGCG
AGGTTGCTGT CGGTGGTGCT CAAACCGGTG GACAGCGAGC CGATGCCGGT CGAGGTCGAC
GTGGACAACG AAGCAATCGA GCTATTGGCT GAGCTGATGC CCGACGAGGT GGACGTTGAA
AGCGAGGTCA ACGAGCTGTT CGTGCTGCTC AGGCCGGTGG ACAGCGAGGC GACATTGCTG
TTGGTCGTGC TCAGCCCACT CGAAAGGGAG GTGATCGAGC TGTTGGCCGA CGAGAGCCCC
GTCGACGTAG AGGTCGACAG CGACGTGAGG TTGCTGTTGG TGGTGCTCAG GCCGGTGGAA
AGCGAGCCGA TGCCGGTCGA GGTCGACGTG GACAGCGAAG CAACCGAGCT ATTGGCTGAG
CTGATGCCCG ACGAGGTGGA CGTTGAAAGC GAGGTCAACG AACTGTTCGT GCTGCTCAGG
CCGGTGGAAA GCGAGCCGAT GCCCGTCGAG GTCGACGTGG ACAACGAAGC AACCGTGCTA
TTGGTCGTCG ACAGTCCGGT CGACAGCGAA TTGACGCCGC TCTGCGCGGT GCTGATGCCC
GAGGAAGCGG ACGTCGAAAG CGAGGTCAGC GAGCTGTTCG TGCTGCTCAG GCCGCTCGAC
AGCGAAGCAA TCGAGCTGTT CGCCGACGAC AGGCCCGTCG ACGCCGAAGT GGAAAGCGAG
GTCAGGCCGC TGTTTGTCGA CGACAGTCCG GTGGACAGCG ACGAGATCGA GCTGTTGAAC
GTCGACATGC TGCTCGACAG CGAGCCGATG CCCGTCGATG CCGAGGTCGA CAGCGAATAG
|
|---|
| Protein sequence | MSAAMPVLAG SARITLFVLL TIVVDSDVSC VLRLVTLVDS DATLVFVVDR PVDSEFTLVE
VDVDSDATLL LVVDRLVDSE PTAVEVDVDS EATLLLVVDR PVDSEPTAVE VDVDSEATVL
LVAARPVEAD VDSDATLLLV ALRPVDSELT EVSVDVDSDA RLLLVVARPV DSEPIELSAD
EKLVEVDVES EAIELVVDER PVDVEVDSEA RLLSVVLRPV ESDATLLLVV LRPVESDATL
LLVVLKPVDS ESTLVEVDVD SEAIELVADE RPVDVEVDSE ARLLSVVLRP VESDATLLLV
VLRLVDSEST LVEVDVDSEA IELVAVERPV DVEVDSEARL LSVVLKPVDS EPMPVEVDVD
SEAIELLAEL MPDEADVESE VNELFVLLRP EDSEATLLLV VLSPLEREVI ELLADESPVD
VEVDSDVRLL LVVLRPVESE PIPVEVDVDS EAIELLAELM PEEADVESEV SELFVLLRPV
ESDATLLLVV LKPLDSEATL LLVVLSPLER EVIELLADES PVDVEVDSDV RLLSVVLKPV
DSELMPVEVD VDNEAIELLA ELMPDEADVE SEVSELLVVL KPLDSEATLL LVVLSPLERE
VIELLADESP VDVEVDSDVR LLSVVLKPVD SELMPVEVDV DNEATELVAD ERPVDVEVDS
EARLLSMVLK PVDSEPMPVE VDVDNEATVL LVVDSPVDSE LTPLCAVLMP EEADVDSEVS
ELFVLLKPVD SDATLLLVVL SPLEREVIEL LADERPVDVE VDSDVRLLLV VLRPVESEPM
PVEVDVDSEA TELLAELMPD EADVESEVSE LLVVLKPVDS EVTLLLVVLS PLEREVIELL
ADESPVDVEV DSDVRLLLVV LRPVESEPIP VEVDVDSEAI ELVADERPVD VEVDSEARLL
SVVLKPVESE PIPVEVDVDS EAIELVAVER PVDVEVDSEA RLLSVVLKPV DSEPMPVEVD
VDNEAIELLA ELMPDEVDVE SEVNELFVLL RPVDSEATLL LVVLSPLERE VIELLADESP
VDVEVDSDVR LLLVVLRPVE SEPMPVEVDV DSEATELLAE LMPDEVDVES EVNELFVLLR
PVESEPMPVE VDVDNEATVL LVVDSPVDSE LTPLCAVLMP EEADVESEVS ELFVLLRPLD
SEAIELFADD RPVDAEVESE VRPLFVDDSP VDSDEIELLN VDMLLDSEPM PVDAEVDSE
|
|---|
| |