21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_5106 on replicon NC_010552
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010552  BamMC406_5106  hypothetical protein  100 
 
 		 181 aa  340  5e-93  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6616  hypothetical protein  54 
 
 		 439 aa  107  8.000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.266008  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6614  hypothetical protein  47.77 
 
 		 167 aa  102  3e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.446982  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6356  DNA-directed RNA polymerase II, large subunit, putative  48.21 
 
 		 400 aa  96.3  2e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.803195 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5104  hypothetical protein  52.9 
 
 		 673 aa  94.4  8e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.711525 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5101  hypothetical protein  48.39 
 
 		 547 aa  92  4e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.517615 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2040  chromosome segregation ATPases  65.88 
 
 		 754 aa  89  3e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0458  PEST motif-containing protein  64.71 
 
 		 939 aa  85.5  4e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.028922  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2041  chromosome segregation ATPases  38.38 
 
 		 1176 aa  74.7  0.0000000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0460  hypothetical protein  58.14 
 
 		 1220 aa  73.2  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.871611  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0464  gene 11-1 protein precursor, putative  40.76 
 
 		 1301 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.45092  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2047  chromosome segregation ATPases  52.08 
 
 		 1199 aa  68.9  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1945  chromosome segregation ATPases  42.22 
 
 		 836 aa  65.5  0.0000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.261745  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0814  hypothetical protein  46.6 
 
 		 413 aa  63.9  0.000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.449827  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6357  hypothetical protein  41.32 
 
 		 211 aa  63.9  0.000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0645  hypothetical protein  52 
 
 		 116 aa  58.5  0.00000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.183493  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0532  chromosome segregation ATPase  50 
 
 		 227 aa  58.5  0.00000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0815  hypothetical protein  43.48 
 
 		 209 aa  53.9  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6359  hypothetical protein  44.25 
 
 		 193 aa  47.4  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6362  chromosome segregation ATPase  44.66 
 
 		 483 aa  44.7  0.0007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.397181  normal  0.860165 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6358  hypothetical protein  48.53 
 
 		 172 aa  41.6  0.007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>