| Gene Information Plasmid Coverage information Fosmid Coverage information Sequence |
Gene Information |
| Locus tag | BURPS1710b_A0458 |
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| Symbol | |
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| ID | 3694442 |
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| Type | CDS |
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| Is gene spliced | No |
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| Is pseudo gene | No |
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| Organism name | Burkholderia pseudomallei 1710b |
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| Kingdom | Bacteria |
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| Replicon accession | NC_007435 |
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| Strand | - |
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| Start bp | 629572 |
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| End bp | 632391 |
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| Gene Length | 2820 bp |
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| Protein Length | 939 aa |
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| Translation table | 11 |
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| GC content | 66% |
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| IMG OID | 637730713 |
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| Product | PEST motif-containing protein |
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| Protein accession | YP_335618 |
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| Protein GI | 76817774 |
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| COG category | |
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| COG ID | |
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| TIGRFAM ID | |
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Plasmid Coverage information |
| Num covering plasmid clones | 9 |
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| Plasmid unclonability p-value | 0.028922 |
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| Plasmid hitchhiking | No |
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| Plasmid clonability | normal |
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Fosmid Coverage information |
| Num covering fosmid clones | n/a |
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| Fosmid unclonability p-value | n/a |
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| Fosmid Hitchhiker | n/a |
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| Fosmid clonability | n/a |
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Sequence |
| Gene sequence | TTGATCGCAT CGGTGCTGCT GGCGGTGACC TGGCCGGCGG CGACGTTCGT GATCTGGCGT
TCCGCGCTCG GCGCCCCGAC GCTCACGACG CCCACGGGCG CGCTGCCCGC GAACGTACCG
AGCGTGGTCG AGCCGACGGT CGCGCTGCTG GTCGGGACGG CCGCGGCCGT CACCGAGTTC
GCGCCGAGCG CGACCGAGTT CGCCGTGGCG GCCGTCGCGC CCGTGCCGAT CGCGACGGCG
TCCGCGCCGG TCGCGACGCT GTCCGGCCCA GTCGAGTTCG CATGGAAGTA CTTGATGCCG
TTCGCGTTGA TGCTGTCGAT CGCAGAGCCG ACACTGGTGT TGGCCGTGGT CGTGCCGTTC
GCGTTGTACG TCGTGTACGA CGGCGCGGAA ATCGTGCCGG TGGCCGGATT GTACGTCGCG
CCGCCGCCGA GCGCCGCGGC GGTGCTGCTG CCGAGATTGT TGGTCGTCGT CGCGACGGTC
GACAGGCCGG TGGAAAGCGA GCCGATGCCG GTCGACGTGG AAGTCGACAG CGAAGCGATC
GAGCTGGTGG CCGAGCTCAA GCCGGTCGAA GTCGACGTGG ACAGCGAAGC GACGGTGCTA
TTGGTGGTCG ACAGCCCGGT GGACAACGAA TTGACGCCGC TCTGCGCGGT GCTGATGCCA
GACGAGGCGG AAGTCGACAG CGAGGTCAGC GAGCTATTCG TGCTGCTCAG TCCGCTGGAC
AGCGAGGCGA CGTTGCTGTT GGTGGTCGAC AGGCCGGTGG AAAGCGAGCC GATGCCGGTC
GACGTGGAGG TCGACAGCGA AGCGATCGAG CTGGTGGCCG AGCTCAGGCC GGTCGAAGTC
GACGTGGACA GCGAAGCGAC GGTGCTATTC GCGGTCGACA GCCCGGTGGA CAACGAGTTG
ACACCGCTCT GCGCGGTGCT GATGCCCGAC GAAGCGGACG TCGACAGCGA GGTCAGCGAG
CTATTCGTGC TGCTCAGGCC GCTGGACAGC GAGGCGACGT TGCTGTTGGT GGTCGACAGG
CCGGTGGAAA GCGAGCCGAT ACCGGTCGAC GTGGAAGTCG ACAGCGAAGC GATCGAGCTG
GTGGCCGAGC TCAGGCCGGT CGAGGTCGAC GTGGACAGCG AAGCGACGGT GCTATTGGTG
GTCGACAGCC CGGTGGACAA CGAATTGACG CCGCTCTGCG CGGTGCTGAT GCCAGACGAG
GCGGAAGTCG ACAGCGAGGT CAGCGAGCTA TTCGTGCTGC TCAGTCCGCT GGACAGCGAG
GCGACGTTGC TGTTGGTGGT CGACAGGCCG GTGGAAAGCG AGCCGATACC GGTCGACGTG
GAAGTCGACA GCGAAGCGAT CGAGCTGGTG GCCGAGCTCA GGCCGGTCGA AGTCGACGTG
GACAGCGAAG CGACGGTGCT ATTCGCGGTC GACAGCCCGG TGGACAACGA GTTGACACCG
CTCTGCGCGG TGCTGATGCC CGACGAAGCG GACGTCGACA GCGAGGTCAG CGAGCTATTC
GTGCTGCTCA GGCCGCTGGA CAGCGAGGCG ACGTTGCTGT TGGTGGTCGA CAGGCCGCTG
GAAAGCGAAC CGATACCGGT CGAAGTGGAA GTCGACAGCG AAGCGATCGA GCTGGTGGCC
GAGCTCAAGC CGGTCGAAGT CGACGTGGAC AGCGAAGCGA CGGTGCTATT GGTGGTCGAC
AGCCCGGTGG ACAACGAATT GACGCCGCTC TGCGCGGTGC TGATGCCAGA CGAGGCGGAA
GTCGACAGCG AGGTCAGCGA GCTATTCGTG CTGCTCAGTC CGCTGGACAG CGAGGCGACG
TTGCTGTTGG TGGTCGACAG GCCGGTGGAA AGCGAGCCGA TGCCGGTCGA CGTGGAGGTC
GACAGCGAAG CGATCGAGCT GGTGGCCGAG CTCAGGCCGG TCGAAGTCGA CGTGGACAGC
GAAGCGACGG TGCTATTGGT GGTCGACAGC CCGGTGGACA ACGAGTTGAC ACCGCTCTGC
GCGGTGCTGA TGCCCGACGA AGCGGACGTC GACAGCGAGG TCAGCGAGCT ATTCGTGCTG
CTCAGGCCGC TGGACAGCGA GGCGACGTTG CTGTTGGTGG TCGACAGGCC GGTGGAAAGC
GAGCCGATAC CGGTCGACGT GGAAGTCGAC AGCGAAGCGA TCGAGCTGGT GGCCGAGCTC
AGGCCGGTCG AGGTCGACGT GGACAGCGAA GCGACGGTGC TATTGGTGGT CGACAGCCCG
GTGGACAACG AATTGACGCC GCTCTGCGCG GTGCTGATGC CCGACGAAGC GGAAGTCGAA
AGCGAGGCGA TCGAGCTATT CGCCGAGCTC AAGCCGGTCG AAGTCGACGT GGACAGCGAA
GCGACGGTGC TATTGGTGGT CGACAGCCCG GTGGACAACG AATTGACACC GCTCTGCGCG
GTGCTGATGC CCGACGAGGC GGAAGTCGAC AGCGAGGTCA GCGAGCTGTT CGTGCTGCTC
AGGCCGCTGG ACAGCGAGGC GACGTTGCTG TTGGTGGTCG ACAGCCCGGT GGAAAGCGAA
CCGATGCCGG TCGACGTGGA AGTCGACAGT GAAGCGATCG AGCTGGTGGC CGAGCTCAGG
CCGGTCGAAG TCGACGTGGA CAGCGACGCG ATCGAGCTTC TGGCTGACGA AAGCCCGGTC
GATGTGGAGG TCGACAAACT GGCGATTGCG CTAGTGGTCG TGCTCATGCC CGTACTCAGT
TGGGCAACCG TGACGGCGTC ATTCGCTGCG GAGCCGTCCG CAACGTTGGT GATGCGGCGC
AAATTGGTCG AGGAACCGAC GGACACCTCC GAAGACGGGG CGGCGCTGCC CGTCAAGTAG
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| Protein sequence | MIASVLLAVT WPAATFVIWR SALGAPTLTT PTGALPANVP SVVEPTVALL VGTAAAVTEF
APSATEFAVA AVAPVPIATA SAPVATLSGP VEFAWKYLMP FALMLSIAEP TLVLAVVVPF
ALYVVYDGAE IVPVAGLYVA PPPSAAAVLL PRLLVVVATV DRPVESEPMP VDVEVDSEAI
ELVAELKPVE VDVDSEATVL LVVDSPVDNE LTPLCAVLMP DEAEVDSEVS ELFVLLSPLD
SEATLLLVVD RPVESEPMPV DVEVDSEAIE LVAELRPVEV DVDSEATVLF AVDSPVDNEL
TPLCAVLMPD EADVDSEVSE LFVLLRPLDS EATLLLVVDR PVESEPIPVD VEVDSEAIEL
VAELRPVEVD VDSEATVLLV VDSPVDNELT PLCAVLMPDE AEVDSEVSEL FVLLSPLDSE
ATLLLVVDRP VESEPIPVDV EVDSEAIELV AELRPVEVDV DSEATVLFAV DSPVDNELTP
LCAVLMPDEA DVDSEVSELF VLLRPLDSEA TLLLVVDRPL ESEPIPVEVE VDSEAIELVA
ELKPVEVDVD SEATVLLVVD SPVDNELTPL CAVLMPDEAE VDSEVSELFV LLSPLDSEAT
LLLVVDRPVE SEPMPVDVEV DSEAIELVAE LRPVEVDVDS EATVLLVVDS PVDNELTPLC
AVLMPDEADV DSEVSELFVL LRPLDSEATL LLVVDRPVES EPIPVDVEVD SEAIELVAEL
RPVEVDVDSE ATVLLVVDSP VDNELTPLCA VLMPDEAEVE SEAIELFAEL KPVEVDVDSE
ATVLLVVDSP VDNELTPLCA VLMPDEAEVD SEVSELFVLL RPLDSEATLL LVVDSPVESE
PMPVDVEVDS EAIELVAELR PVEVDVDSDA IELLADESPV DVEVDKLAIA LVVVLMPVLS
WATVTASFAA EPSATLVMRR KLVEEPTDTS EDGAALPVK
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