24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_5104 on replicon NC_010552
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010552  BamMC406_5104  hypothetical protein  100 
 
 
673 aa  1119    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.711525 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0464  gene 11-1 protein precursor, putative  60.03 
 
 
1301 aa  554  1e-156  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.45092  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0460  hypothetical protein  63.54 
 
 
1220 aa  549  1e-155  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.871611  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5101  hypothetical protein  64.27 
 
 
547 aa  512  1e-143  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.517615 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2047  chromosome segregation ATPases  54.62 
 
 
1199 aa  509  1e-143  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2041  chromosome segregation ATPases  58.15 
 
 
1176 aa  503  1e-141  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0458  PEST motif-containing protein  52.68 
 
 
939 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.028922  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1945  chromosome segregation ATPases  52.39 
 
 
836 aa  394  1e-108  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.261745  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0814  hypothetical protein  60.58 
 
 
413 aa  368  1e-100  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.449827  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2040  chromosome segregation ATPases  53.11 
 
 
754 aa  343  5.999999999999999e-93  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6616  hypothetical protein  60.52 
 
 
439 aa  337  3.9999999999999995e-91  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.266008  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0532  chromosome segregation ATPase  57.83 
 
 
227 aa  165  3e-39  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6362  chromosome segregation ATPase  41.25 
 
 
483 aa  136  9.999999999999999e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.397181  normal  0.860165 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0815  hypothetical protein  50.25 
 
 
209 aa  132  3e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6614  hypothetical protein  60.58 
 
 
167 aa  119  1.9999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.446982  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5106  hypothetical protein  52.9 
 
 
181 aa  94  9e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0645  hypothetical protein  55.93 
 
 
116 aa  87.8  6e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.183493  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5471  lpxtg-motif cell wall anchor domain protein  22.14 
 
 
3190 aa  67  0.000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00194019 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6359  hypothetical protein  37.08 
 
 
193 aa  63.9  0.00000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6357  hypothetical protein  40 
 
 
211 aa  50.4  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6356  DNA-directed RNA polymerase II, large subunit, putative  50 
 
 
400 aa  50.1  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.803195 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5480  lpxtg-motif cell wall anchor domain protein  22.84 
 
 
3210 aa  49.3  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5449  lpxtg-motif cell wall anchor domain protein  20.3 
 
 
3486 aa  47.4  0.0008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5039  collagen adhesion protein  21.22 
 
 
3333 aa  46.2  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>