20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_6614 on replicon NC_010553
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010553  BamMC406_6614  hypothetical protein  100 
 
 		 167 aa  306  6.999999999999999e-83  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.446982  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6616  hypothetical protein  72.63 
 
 		 439 aa  220  6e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.266008  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6356  DNA-directed RNA polymerase II, large subunit, putative  58.28 
 
 		 400 aa  123  1e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.803195 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5104  hypothetical protein  60.58 
 
 		 673 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.711525 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5101  hypothetical protein  56.76 
 
 		 547 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.517615 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5106  hypothetical protein  47.77 
 
 		 181 aa  102  2e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0815  hypothetical protein  43.83 
 
 		 209 aa  95.1  3e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6357  hypothetical protein  41.92 
 
 		 211 aa  95.1  4e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0464  gene 11-1 protein precursor, putative  60 
 
 		 1301 aa  85.5  3e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.45092  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0458  PEST motif-containing protein  44.74 
 
 		 939 aa  82.4  0.000000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.028922  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0460  hypothetical protein  48.12 
 
 		 1220 aa  80.1  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.871611  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2041  chromosome segregation ATPases  58.1 
 
 		 1176 aa  78.6  0.00000000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2040  chromosome segregation ATPases  47.37 
 
 		 754 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2047  chromosome segregation ATPases  46.88 
 
 		 1199 aa  75.9  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1945  chromosome segregation ATPases  39.56 
 
 		 836 aa  73.6  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.261745  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0814  hypothetical protein  48.51 
 
 		 413 aa  72.4  0.000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.449827  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0532  chromosome segregation ATPase  40.79 
 
 		 227 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0645  hypothetical protein  43.93 
 
 		 116 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.183493  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6359  hypothetical protein  37.95 
 
 		 193 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6362  chromosome segregation ATPase  38.41 
 
 		 483 aa  46.6  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.397181  normal  0.860165 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>