16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_6357 on replicon NC_010557
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010557  BamMC406_6357  hypothetical protein  100 
 
 
211 aa  389  1e-107  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6359  hypothetical protein  54.7 
 
 
193 aa  125  4.0000000000000003e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6356  DNA-directed RNA polymerase II, large subunit, putative  47.83 
 
 
400 aa  123  2e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.803195 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6362  chromosome segregation ATPase  53.57 
 
 
483 aa  105  4e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.397181  normal  0.860165 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6616  hypothetical protein  44.75 
 
 
439 aa  105  7e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.266008  normal 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6614  hypothetical protein  43.37 
 
 
167 aa  102  5e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.446982  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5106  hypothetical protein  40.12 
 
 
181 aa  66.2  0.0000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2040  chromosome segregation ATPases  74.36 
 
 
754 aa  62.4  0.000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0458  PEST motif-containing protein  71.79 
 
 
939 aa  58.5  0.00000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.028922  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0814  hypothetical protein  34.01 
 
 
413 aa  56.2  0.0000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.449827  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5104  hypothetical protein  40.91 
 
 
673 aa  54.7  0.0000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.711525 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0815  hypothetical protein  31.71 
 
 
209 aa  53.9  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0460  hypothetical protein  39.08 
 
 
1220 aa  52  0.000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.871611  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5101  hypothetical protein  37.13 
 
 
547 aa  49.3  0.00004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.517615 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2041  chromosome segregation ATPases  36.81 
 
 
1176 aa  46.2  0.0004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0464  gene 11-1 protein precursor, putative  31.66 
 
 
1301 aa  43.1  0.003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.45092  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>