21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_6362 on replicon NC_010557
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010557  BamMC406_6362  chromosome segregation ATPase  100 
 
 		 483 aa  818    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.397181  normal  0.860165 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2041  chromosome segregation ATPases  40.98 
 
 		 1176 aa  164  4.0000000000000004e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0460  hypothetical protein  40.85 
 
 		 1220 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.871611  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0458  PEST motif-containing protein  37.97 
 
 		 939 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.028922  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0814  hypothetical protein  39.33 
 
 		 413 aa  145  1e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.449827  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5104  hypothetical protein  41.14 
 
 		 673 aa  143  8e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.711525 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0464  gene 11-1 protein precursor, putative  40.72 
 
 		 1301 aa  142  1.9999999999999998e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.45092  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2047  chromosome segregation ATPases  39.65 
 
 		 1199 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1945  chromosome segregation ATPases  37.1 
 
 		 836 aa  139  7.999999999999999e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.261745  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2040  chromosome segregation ATPases  35.78 
 
 		 754 aa  130  7.000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5101  hypothetical protein  40.69 
 
 		 547 aa  120  4.9999999999999996e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.517615 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6359  hypothetical protein  50.25 
 
 		 193 aa  108  3e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0815  hypothetical protein  39.52 
 
 		 209 aa  95.5  2e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6357  hypothetical protein  53.57 
 
 		 211 aa  92.8  1e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0532  chromosome segregation ATPase  41.9 
 
 		 227 aa  88.6  2e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6616  hypothetical protein  34.68 
 
 		 439 aa  85.5  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.266008  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6356  DNA-directed RNA polymerase II, large subunit, putative  52.63 
 
 		 400 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.803195 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0645  hypothetical protein  41.35 
 
 		 116 aa  52  0.00003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.183493  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6614  hypothetical protein  38.41 
 
 		 167 aa  46.6  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.446982  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5106  hypothetical protein  44.66 
 
 		 181 aa  45.4  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0456  hypothetical protein  20.94 
 
 		 2764 aa  45.1  0.003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    unclonable  0.000000000000873422 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>