25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_6616 on replicon NC_010553
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010553  BamMC406_6616  hypothetical protein  100 
 
 		 439 aa  740    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.266008  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5104  hypothetical protein  64.04 
 
 		 673 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.711525 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0460  hypothetical protein  56.71 
 
 		 1220 aa  342  5.999999999999999e-93  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.871611  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5101  hypothetical protein  52.33 
 
 		 547 aa  333  4e-90  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.517615 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0464  gene 11-1 protein precursor, putative  51.43 
 
 		 1301 aa  303  3.0000000000000004e-81  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.45092  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2041  chromosome segregation ATPases  49.02 
 
 		 1176 aa  302  7.000000000000001e-81  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2047  chromosome segregation ATPases  51.55 
 
 		 1199 aa  301  1e-80  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0814  hypothetical protein  55.05 
 
 		 413 aa  293  4e-78  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.449827  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2040  chromosome segregation ATPases  48.37 
 
 		 754 aa  259  7e-68  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0458  PEST motif-containing protein  46.42 
 
 		 939 aa  236  8e-61  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.028922  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1945  chromosome segregation ATPases  46.44 
 
 		 836 aa  228  1e-58  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.261745  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6614  hypothetical protein  77.64 
 
 		 167 aa  211  2e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.446982  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0815  hypothetical protein  51.67 
 
 		 209 aa  181  2e-44  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0532  chromosome segregation ATPase  54 
 
 		 227 aa  163  5.0000000000000005e-39  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6356  DNA-directed RNA polymerase II, large subunit, putative  53.76 
 
 		 400 aa  133  5e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.803195 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5106  hypothetical protein  54 
 
 		 181 aa  107  4e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6362  chromosome segregation ATPase  37.42 
 
 		 483 aa  105  1e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.397181  normal  0.860165 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6357  hypothetical protein  44.75 
 
 		 211 aa  96.7  7e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4474  hypothetical protein  28.39 
 
 		 508 aa  88.2  3e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0402318  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0645  hypothetical protein  48.87 
 
 		 116 aa  87.8  4e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.183493  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6359  hypothetical protein  40.82 
 
 		 193 aa  55.8  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5055  collagen adhesion protein  25.64 
 
 		 3393 aa  54.3  0.000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5449  lpxtg-motif cell wall anchor domain protein  23.77 
 
 		 3486 aa  52.8  0.00001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5536  collagen adhesion protein  25.43 
 
 		 3392 aa  51.2  0.00004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3738  hypothetical protein  31 
 
 		 99 aa  43.5  0.007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.213636  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>