| Gene Information Plasmid Coverage information Fosmid Coverage information Sequence |
Gene Information |
| Locus tag | BURPS1710b_A0460 |
|---|
| Symbol | |
|---|
| ID | 3693575 |
|---|
| Type | CDS |
|---|
| Is gene spliced | No |
|---|
| Is pseudo gene | No |
|---|
| Organism name | Burkholderia pseudomallei 1710b |
|---|
| Kingdom | Bacteria |
|---|
| Replicon accession | NC_007435 |
|---|
| Strand | - |
|---|
| Start bp | 632404 |
|---|
| End bp | 636066 |
|---|
| Gene Length | 3663 bp |
|---|
| Protein Length | 1220 aa |
|---|
| Translation table | 11 |
|---|
| GC content | 65% |
|---|
| IMG OID | 637730714 |
|---|
| Product | hypothetical protein |
|---|
| Protein accession | YP_335619 |
|---|
| Protein GI | 76818472 |
|---|
| COG category | |
|---|
| COG ID | |
|---|
| TIGRFAM ID | |
|---|
| 
|
Plasmid Coverage information |
| Num covering plasmid clones | 15 |
|---|
| Plasmid unclonability p-value | 0.871611 |
|---|
| Plasmid hitchhiking | No |
|---|
| Plasmid clonability | normal |
|---|
| |
Fosmid Coverage information |
| Num covering fosmid clones | n/a |
|---|
| Fosmid unclonability p-value | n/a |
|---|
| Fosmid Hitchhiker | n/a |
|---|
| Fosmid clonability | n/a |
|---|
| |
Sequence |
| Gene sequence | GTGCCGGTCG CGACGCTGTC CGGATCGGTC GAGTTCGCGT GGAAGTACTT GATGCCGTTC
GCGTTGATGT TGTCGATCGC GGCGCCGACG CTGGTGTTGG TCGCGGTGGT GCCGTTCGCG
TTGTACGTCG TGTACGACGG CGCGGAGATC GCGCCGGTGG CCGGATCGTA CGTCGCGCCG
CCGCCGAGCG CCGCGGCGGT GCTGTTGCCG AGGTTCGTCG TGTTCGTCGT GATCGAGCTG
ATGCTCGTCG ACAGCGAGCC GATGCCGGTC GAGGCGGACG TGGAGAGCGA CGCGAGGTTG
CTGTTGGTCG CGTTGATGCT GGTCGACAGC GAGCCGATGC CGGTCGAGCT CGACGTGGAG
AGCGACGCGA GGTTGCTGTT GGTCGTGTCG ATGCTGGTCG ACAGCGAGCC GATGCCGGTC
GAGGCCGACG TGGAGAGCGA CACGAGGTTG CTGTTGGTCG ACGACAGGCC GGTGGACAGC
GAACCGATGC CGGTCGAAGT CGACGTGGAC AGCGAGGCGA CGGTGCTGTT GGTCGTGGAC
AGGCCGGTGG AGAGCGAGCC GATGCCGGTC GAGGTCGACG TGGACAGCGA GGCGACGGTG
CTGTTGGTCG TGGACAGGCC GGTGGAAAGC GAGCCGATGC CGGTTGACGT GGAGGTCGAC
AGCGAGGCGA TCGAGCTGGT GGCCGAGCTC AGGCCCGTCG AAGTCGAGGT GGACAGCGAA
GCGACGGTGC TGTTGGTCGT GGACAGACCG GTGGAAAGCG AGCCGATACC GTTCGACGTG
GAGGTCGACA GCGAAGCGAT CGAGCTGGTG GCCGAGCTCA GACCGGTCGA AGTCGACGTG
GACAGCGAAG CAACGGTGCT ATCGGTCGTG GACAGACCGG TGGACAGCGA GCCGATGCCG
GTCGACGTGG AAGTCGACAG CGAAGCGATC GAGCTGTTCG CCGAGCTCAG GCCCGTCGAA
GTCGACGTGG ACAGCGAAGC GACGGTGCTA TCGGTCGTGG ACAGGCCGGT GGAAAGCGAG
CCGATACTGG TCGACGTGGA AGTCGACAGC GAAGCGATCG AGCTGGTGGC CGAGCTCAGG
CCCGTCGAAG TCGAGGTGGA CAGCGAAGCG ACGGTGCTGT TGGTCGTCGA CAGACCGGTG
GAAAGCGAGC CGATGCCGGT CGACGTGGAG GTCGACAGCG AAGCGATCGA GCTGGTGGCC
GAGCTCAGAC CGGTCGAAGT CGAGGTGGAC AGCGAAGCGA CGTTGCTGTT GGTCGTGGAC
AGGCCGGTGG AAAGCGAACC GATGCCGGTC GACGTGGAAG TCGACAGCGA AGTGATCGAG
CTGGTGGCCG AGCTCAGGCC GGTCGAAGTC GACGTGGACA GCGAGGCGAC GGTGCTATCG
GTCGTGGACA GACCGGTGGA CAGCGAGCCG ATGCCGGTCG ACGTGGAAGT CGACAGCGAG
GCGATCGAGC TGTTCGCCGA GCTCAGGCCG GTCGAAGTCG ACGTGGACAG CGAGGCGACG
GTGCTATCGG TCGTGGACAG ACCGGTGGAG AGCGAGCCGA TGCCGGTCGA CGTGGAAGTC
GACAGCGAAG CGATCGAGCT GGTGGCCGAG CTCAGACCCG TCGAAGTCGA GGTGGACAGC
GAAGCGACGT TGCTGTTGGT CGTGGACAGA CCGGTGGAAA GCGAGCCGAT ACCGGTCGAC
GTGGAGGTCG ACAGCGAGGC GATCGAGCTA TTCGCCAAGT TCAGGCCCGT CGAAGTCGAG
GTGGACAGCG AAGCGACGTT GCTGTTGGTC GTGGACAGGC CGGTGGAAAG CGAGCCGATA
CCGGTCGACG TGGAAGTCGA CAGCGAGGCG ATCGAGCTAT TCGCCGAGCT CAGGCCCGTC
GAAGTCGAGG TGGACAGCGA AGCGACGTTG CTGTTGGTCG TGGACAGGCC GGTGGAAAGC
GAGTCGATAC TGGTCGACGT GGAAGTCGAC AGCGAGGCGA TCGAGCTATT CGCCAAGTTC
AGGCCCGTCG AAGTCGAGGT GGACAGCGAA GCGACGTTGC TGTTGGTCGT GGACAGGCCG
GTGGAAAGCG AGCCGATACC GGTCGACGTG GAAGTCGACA GCGAGGCGAT CGAGCTATTC
GCCGAGCTCA GGCCCGTCGA AGTCGAGGTG GACAGCGAAG CGACGTTGCT GTTGGTCGTG
GACAGACCGG TGGACAGCGA GCCGATACCG GTCGACGTGG AGGTCGACAG CGAGGCGATC
GAGCTATTCG CCGAGCTCAG ACCGGTCGAA GTCGACGTGG ACAGCGAGGC GACGGTGCTA
TCGGTCGTGG ACAGGCCGGT GGAAAGCGAG CCGATGCCGG TCGACGTGGA GGTCGACAGC
GAGGCGATCG AGCTATTCGC CGAGCTCAGA CCGGTCGAAG TCGACGTGGA CAGCGAGGCG
ACGGTGCTAT CGGTCGTGGA CAGGCCGGTG GAAAGCGAGC CGATGCCGGT CGACGTGGAA
GTCGACAGCG AAGCGATCGA GCTGTTCGCC GAGCTCAGGC CCGTCGAAGT CGACGTGGAC
AGCGAAGCGA CGGTGCTATT CGCGGTCGAC AGCCCGGTGG ACAACGAATT GACGCCGCTC
TGCGCGGTGC TGATGCCCGA CGAAGCGGAC GTCGACAGCG AGGTCAGCGA GCTATTCGTG
CTGCTCAGGC CGCTGGACAG CGAGGCGACG TTGCTGTTGG TGGTCGACAG GCCGGTGGAA
AGCGAGCCGA TACCGGTCGA CGTGGAAGTC GACAGCGAAG CGATCGAGCT GGTGGCCGAA
CTCAGGCCGG TCGAGGTCGA CGTGGACAGC GACGCGACGG TGCTATCGGT CGTGGACAGA
CCGGTGGAGA GCGAGCCGAT GCCGGTCGAC GTGGAAGTCG ACAGCGAAGC GATCGAGCTG
GTGGCCGAGC TCAAGCCGGT CGAGGTCGAG GTGGACAGCG AAGCGACGGT GCTATTGGTG
GTCGACAGCC CGGTGGACAA CGAATTGACA CCGCTCTGCG CGGTGCTGAT GCCGGACGAA
GCTGAAGTCG AAAGCGAGGT CAGCGAGCTG TTCGTGCTGC TCAGGCCGCT GGACAGCGAG
GCGACGTTGC TGTTGGTCGT GGACAGGCCG GTGGAAAGCG AGCCGATGCC GGTCGACGTG
GAGGTCGACA GCGAGGCGAT CGAGCTATTC GCCGAGCTCA GGCCGGTCGA GGTCGACGTG
GACAGCGAGG CGACGGTGCT ATTGGTCGTG GACAGACCGG TGGAAAGCGA GCCGATGCCG
GTCGACGTGG AGGTCGACAG CGAAGCGATC GAGCTGGTGG CCGAGCTCAG ACCGGTCGAA
GTCGAGGTGG ACAGCGAAGC GACGTTGCTG TTGGTTGTGG ACAGGCCGGT GGAAAGCGAA
CCGATGCCGG TCGACGTGGA AGTCGACAGC GAAGTGATCG AGCTGGTGGC CGAGCTCAGG
CCGGTCGAAG TCGAGGTGGA CAGCGAGGCG ACGGCGCTAT CGGTCGTGGA CAGACCGGTG
GAGAGCGAAC CGATACCGGT CGACGTGGAG GTCGACAGCG AGGCGATCGA GCTATTCGCC
GAGCTCAGGC CCGTCGAGGT GGAAGTGGAG AGCGAAGTAA TCGAACTGGT GGCCGACGAC
AGTCCCGTCG ACAGCGACGA AATCGAACTC GAGGTCGAGT CGAGCTTCGA CGCAACCGCA
TAG
|
|---|
| Protein sequence | MPVATLSGSV EFAWKYLMPF ALMLSIAAPT LVLVAVVPFA LYVVYDGAEI APVAGSYVAP
PPSAAAVLLP RFVVFVVIEL MLVDSEPMPV EADVESDARL LLVALMLVDS EPMPVELDVE
SDARLLLVVS MLVDSEPMPV EADVESDTRL LLVDDRPVDS EPMPVEVDVD SEATVLLVVD
RPVESEPMPV EVDVDSEATV LLVVDRPVES EPMPVDVEVD SEAIELVAEL RPVEVEVDSE
ATVLLVVDRP VESEPIPFDV EVDSEAIELV AELRPVEVDV DSEATVLSVV DRPVDSEPMP
VDVEVDSEAI ELFAELRPVE VDVDSEATVL SVVDRPVESE PILVDVEVDS EAIELVAELR
PVEVEVDSEA TVLLVVDRPV ESEPMPVDVE VDSEAIELVA ELRPVEVEVD SEATLLLVVD
RPVESEPMPV DVEVDSEVIE LVAELRPVEV DVDSEATVLS VVDRPVDSEP MPVDVEVDSE
AIELFAELRP VEVDVDSEAT VLSVVDRPVE SEPMPVDVEV DSEAIELVAE LRPVEVEVDS
EATLLLVVDR PVESEPIPVD VEVDSEAIEL FAKFRPVEVE VDSEATLLLV VDRPVESEPI
PVDVEVDSEA IELFAELRPV EVEVDSEATL LLVVDRPVES ESILVDVEVD SEAIELFAKF
RPVEVEVDSE ATLLLVVDRP VESEPIPVDV EVDSEAIELF AELRPVEVEV DSEATLLLVV
DRPVDSEPIP VDVEVDSEAI ELFAELRPVE VDVDSEATVL SVVDRPVESE PMPVDVEVDS
EAIELFAELR PVEVDVDSEA TVLSVVDRPV ESEPMPVDVE VDSEAIELFA ELRPVEVDVD
SEATVLFAVD SPVDNELTPL CAVLMPDEAD VDSEVSELFV LLRPLDSEAT LLLVVDRPVE
SEPIPVDVEV DSEAIELVAE LRPVEVDVDS DATVLSVVDR PVESEPMPVD VEVDSEAIEL
VAELKPVEVE VDSEATVLLV VDSPVDNELT PLCAVLMPDE AEVESEVSEL FVLLRPLDSE
ATLLLVVDRP VESEPMPVDV EVDSEAIELF AELRPVEVDV DSEATVLLVV DRPVESEPMP
VDVEVDSEAI ELVAELRPVE VEVDSEATLL LVVDRPVESE PMPVDVEVDS EVIELVAELR
PVEVEVDSEA TALSVVDRPV ESEPIPVDVE VDSEAIELFA ELRPVEVEVE SEVIELVADD
SPVDSDEIEL EVESSFDATA
|
|---|
| |