25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_6356 on replicon NC_010557
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010557  BamMC406_6356  DNA-directed RNA polymerase II, large subunit, putative  100 
 
 		 400 aa  728    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.803195 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6616  hypothetical protein  53.76 
 
 		 439 aa  134  3e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.266008  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6614  hypothetical protein  58.28 
 
 		 167 aa  123  6e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.446982  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6357  hypothetical protein  46.67 
 
 		 211 aa  116  7.999999999999999e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5106  hypothetical protein  48.21 
 
 		 181 aa  96.3  8e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6362  chromosome segregation ATPase  52.63 
 
 		 483 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.397181  normal  0.860165 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6359  hypothetical protein  49.32 
 
 		 193 aa  79.7  0.00000000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2040  chromosome segregation ATPases  55.79 
 
 		 754 aa  73.2  0.000000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6358  hypothetical protein  42.86 
 
 		 172 aa  72.8  0.00000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0458  PEST motif-containing protein  53.85 
 
 		 939 aa  70.1  0.00000000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.028922  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0815  hypothetical protein  42.64 
 
 		 209 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2228  DNA-directed RNA polymerase II, large subunit, putative  38.74 
 
 		 522 aa  68.2  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0460  hypothetical protein  47.45 
 
 		 1220 aa  67  0.0000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.871611  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2041  chromosome segregation ATPases  47.45 
 
 		 1176 aa  66.6  0.0000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0814  hypothetical protein  45.65 
 
 		 413 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.449827  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2047  chromosome segregation ATPases  50.43 
 
 		 1199 aa  60.8  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5101  hypothetical protein  46.82 
 
 		 547 aa  60.8  0.00000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.517615 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0464  gene 11-1 protein precursor, putative  49.57 
 
 		 1301 aa  60.5  0.00000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.45092  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1945  chromosome segregation ATPases  44.63 
 
 		 836 aa  57.8  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.261745  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0532  chromosome segregation ATPase  45.69 
 
 		 227 aa  55.8  0.000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0645  hypothetical protein  41.88 
 
 		 116 aa  51.6  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.183493  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1771  hypothetical protein  26.4 
 
 		 307 aa  50.1  0.00008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0430779  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5104  hypothetical protein  50 
 
 		 673 aa  49.7  0.00009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.711525 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5103  PEST motif-containing protein  47.95 
 
 		 81 aa  46.6  0.0007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.6569 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0874  60S ribosomal protein L19  28.35 
 
 		 304 aa  43.1  0.008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>